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--------------------------------------列表------------------------------------------- 一. 定义 它是以[ ]括起来, 每个元素⽤用’ , '隔开而且可以存放各种数据类型, 而且可以存放⼤大量量的数据. 二.索引与切片 1.索引 lst = [“麻花藤”, “王剑林林”, “⻢马芸”, “周鸿医”, “向华强”] l...
2019-09-30 19:27:03
134
原创 字符串
1.定义: “” 2.操作: -索引与切片: -索引: 语法: str[] -切片: 语法: str[start: end: step] ------ 从右往左(倒序) str[start: end: -step] 规则: 顾头不顾腚, 从start开始截取. 截取到end位置. 但不包括end 例子: 1. print(str[-5:-1]) # 牛b, 取到数据了. 但是. 顾头不顾腚. 怎...
2019-09-30 18:38:51
153
原创 函数3-生成器表达式,推导式,递归,其他重要函数
生成器,生成器函数，推导式 特点： 1.惰性 2.只能往下走 3.省内存 获取生成器： 生成器函数、生成器表达式、通过数据转化 生成器函数： 函数内部有yield 这个时候执行函数是获得生成器 next()出发生成器执行，执行到下一个yield send（),可以给上一个yield传值，执行到下一个yield，不能用在开头与结尾 推导式 1.列表推导式 [结果 for 判断] 2.字典推导式 3...
2019-09-24 19:03:52
134
原创 day8 -----文件操作
文件操作 文件操作函数 open(“文件名（路径)”， mode="？", encoding = “字符集”） # mode 要记r w a r+ b(处理非文本) # 绝对路径: 从磁盘的根目录开始寻找, 或者从互联网上寻找一个路径（下载路径） # 相对路径：相对于当前程序所在的文件夹 （用的多） #正常模式 r只读 f = open ("…/aaaa", mode=“r”, encodin...
2019-09-09 04:14:19
156
原创 反射
1.isinstance/issubclass/type issubclass(子类,父类) ##判断第一个参数是否是第二个参数的子类(子子孙孙) 例子: class Base(object): pass class Foo(Base): pass class Wal(Foo): print(issubclass(Foo,Base)) #True pri...
2019-07-23 19:39:52
94
原创 面向对象-------类的组合
组合 类1:学校: class School: def __init__(self,name,add): self.name = name self.add = add def func1(self): print('teaching') obj1 = School(...
2019-07-22 16:24:00
118
原创 面向对象 ---成员
一 成员 成员共分为三类 1.变量 实例变量(字段) -公有实例变量 -私有实例变量 类变量(静态字段) -公有类变量 -私有类变量 ###########在变量前加双下划线,就为私有变量如self.__name=food1, __food='红烧肉'########### ###########公有变...
2019-07-19 19:43:08
118
原创 面向对象
一 面向过程 函数式编程 优点: 增加代码重用性 增加代码可读性 二 面向对象 1. 面向对象方式格式: 定义: class 类名: #定义一个类,类名首字母大写 def 函数名(self): #在类中编写一个方法 ...
2019-07-17 21:50:26
70
原创 函数2
一 函数名的应用 #函数名为变量 1.可赋值 def func(): pass func = 1 2.可作为列表元素 def func1(): pass def func2(): pass def func3(): pass l = [func1,func2,func3] ...
2019-07-10 03:10:46
115
原创 函数1
function: 1.定义: 函数是对功能或是动作的封装. 函数侧重点对实现某个功能. 2.组成: def 函数名(形参列表): 函数体 函数返回值(return) 调用函数:函数名(实参列表) 形参:在函数声明的位置(变量) 实参:在函数调用的时候给函数形参传递的信息(值) 传参:将实参传递给形参的过程 返回值: 终止函数的运行 1.什么都不写,不写retu...
2019-07-06 06:11:02
125
翻译 metagenomic Assembly
metagenomic Assembly: de novo定义：from the beginning（从头拼接）, no reference genome guided（无参考基因组） 1.基本思路： 无论是一代sanger、二代短reads、三代长Pacbio，我们得到的测序数据相较于整个基因组而言仍然是极小的； 我们的任务就是将这些小片段连接起来；序列之间的联系因为重复序列的存在变得非常复杂，...
2019-07-03 16:51:41
706
原创 re模块
import re 一、re模块方法 查找： 1.re.findall(): 匹配所有 （输出结果为列表） #所查找对象中的每一项都是列表中的一个元素 re.findall(a,b,#c) 其中三个参数，一个默认值，两个必填 a 为正则表达式 b 为待匹配字符串 c 为flag ...
2019-07-02 20:35:00
112
原创 Fast Q与 fast A
一 基础知识 1.1掌握FASTQ格式 (1)格式有什么特点？ fastq内容格式有4行： 第1行主要储存序列测序时的坐标等信息； 举个例子： • @ST-E00126:128:HJFLHCCXX:2:1101:7405:1133 • 1. @，开始的标记符号; • 2. ST-E00126:128:HJFLHCCXX，测序仪唯一的设备名称; • 3. 2，lane的编号; • 4. 1101，t...
2019-07-02 17:46:02
853
原创 day 16模块
模块 一、模块 1.什么是模块： 模块：一种功能的集合 模块实际上是就是给我们提供功能， 这个要操作的内容本来就存在， 模块只不过是python提供给我们的去操作这个内容的方法 # python要和某个东西打交道，而这个东西与python没有关系，这个东西本身就存在 # python提供了一个功能的集合，专门负责和这个东西...
2019-07-01 19:58:53
173
空空如也
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