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sequencing
妹驼
业余专业学习者
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Fast Q与 fast A
一 基础知识1.1掌握FASTQ格式(1)格式有什么特点?fastq内容格式有4行:第1行主要储存序列测序时的坐标等信息;举个例子:• @ST-E00126:128:HJFLHCCXX:2:1101:7405:1133• 1. @,开始的标记符号;• 2. ST-E00126:128:HJFLHCCXX,测序仪唯一的设备名称;• 3. 2,lane的编号;• 4. 1101,t...原创 2019-07-02 17:46:02 · 822 阅读 · 0 评论 -
metagenomic Assembly
metagenomic Assembly:de novo定义:from the beginning(从头拼接), no reference genome guided(无参考基因组)1.基本思路:无论是一代sanger、二代短reads、三代长Pacbio,我们得到的测序数据相较于整个基因组而言仍然是极小的;我们的任务就是将这些小片段连接起来;序列之间的联系因为重复序列的存在变得非常复杂,...翻译 2019-07-03 16:51:41 · 686 阅读 · 0 评论