系统生物和生物学中的数理知识

1.生物系统学的必要性

生物还原论：生物单个细胞组分的信息生成、化学成分和它们的生物功能。

生物整体论：一个系统的性质不简单地等于组成部分性质的叠加。

 

2.基因回路

遗传和细胞间的功能是分层的，并且涉及到很多的层次。

给定DNA序列，我们能用开方读码框(ORF)(在mRNA上，沿5'至3'方向，从起始密码子到终止密码子之间的一段核苷酸序列，称为一个开放读码框架,读码框架内每3个碱基组成的三联体，就是决定一个氨基酸的遗传密码)来识别对应的基因，并再利用ORF来分配出对应的基因产物，最终靠这些协调功能组成基因回路。

DNA序列->基因->基因产物->基因回路，故:细胞功能依赖于多个基因产物之间的协同作用。也可以理解成细胞的功能比作基因回路的功能，而生理学功能可以看成是多个基因回路之间协同作用的结果。

基因回路：指集合在一起需要执行特定细胞功能的不同的基因产物。

性质：1.比较稳定，