机器学习笔记（8）——数据预处理&特征工程 机器学习笔记（8）——数据预处理&特征工程1. 数据预处理1.1. 数据无纲量化1.2.缺失值1.3. 处理分类型特征1.4.处理连续型特征2. 特征选择2.1.过滤法fliter2.1.1方差过滤2.1.2卡方过滤2.1.3选取超参数K过滤2.1.4F检验过滤2.1.5互信息法过滤2.2.embedded嵌入法2.3.wrapper包装法
机器学习笔记（7）——决策树&随机森林代码 机器学习笔记（7）——决策树&随机森林代码本文部分图片与文字来源网络或学术论文，仅供学习使用，持续修改完善中。目录机器学习笔记（7）——决策树&随机森林代码1、决策树python写决策树sklearn实现决策树分类器sklearn实现决策树回归器2、随机森林sklearn实现随机森林分类器sklearn实现随机森林回归器sklearn用随机森林回归填补缺失值1、决策树决策树（Decision Tree）是一种非参数的有监督学习方法...
机器学习笔记（6）——线性回归&逻辑回归 1、线性回归西瓜书线性回归代码sklearn实现一元线性回归sklearn实现多元线性回归线性判别分析LDA2、逻辑回归损失函数sklearn实现逻辑回归鸢尾花数据集做逻辑回归
R语言可视化【ggplot2】 ggplot实现各种图形：类别比较：柱形图类别比较：条形图类别比较：克利夫兰点图类别比较：南丁格尔玫瑰图数值关系：散点图数值关系：气泡图数值关系：三维散点/气泡图数值关系：瀑布图数值关系：峰峦图数值关系：相关系数图数值关系：韦恩图数据分布：直方图数据分布：核密度估计图局部整体：直方图/密度图数据分布：散点分布图数据分布：柱形分布图数据分布：箱形图数据分布：小提琴图、雨云图数据分布：显著性标签的箱形图
【生信】全基因组关联分析（GWAS）原理 【生信】全基因组关联分析（GWAS）1.前提知识介绍1.1 最小二乘法1.2 GWAS的数学原理1.3 Hardy-Weinberg定律&卡方检验1.4 连锁不平衡1.5 曼哈顿图1.6 箱式图Box-plot1.7 QQ plot2、GWAS的定义2.1 几个需要知道的概念：2.2全基因组关联分析3、GWAS——数据预处理3.1质控的原因：3.2基因型数据的质控：3.4表型数据质控：3.5正负链翻转3.6 基因型填补3.7群体分层校
【生信MOOC】生物序列比对工具——多序列比对 【生信MOOC】生物序列比对工具2——多序列比对1、多序列比对的定义和用途2、多序列比对的要求3、多序列比对工具——EMBL - Clustal Omega4、多序列比对工具——EMBL - TCOFFEE - Expresso5、多序列比对的保存格式6、多序列比对结果编辑——jalview7、寻找保守区域：序列标识图 WebLogo8、寻找保守区域：序列基序 MEME9、寻找保守区域：PRINTS 指纹图谱数据库
【生信MOOC】生物序列比对工具 1、需了解的背景知识2、替换计分矩阵核酸替换计分矩阵蛋白质替换计分矩阵3、序列比对方法（1）打点法（2）两两序列比对算法4、在线序列比对工具EMBL 全局双序列比对工具Biotools 的双序列比对工具
【生信MOOC】生信数据库2 1、一级蛋白质序列数据库：UniProt 数据库2、一级蛋白质结构数据库：PDB数据库3、二级蛋白质结构数据库：结构域家族数据库Pfam4、二级蛋白质结构数据库：结构分类数据库CATH5、二级蛋白质结构数据库：结构分类数据库SCOP26、专项数据库：京都基因与基因组百科全书KEGG
【生信MOOC】生信数据库1 1、认识生物数据库装载的内容2、生物数据库的分类3、文献数据库——PubMed4、一级核酸数据库——NCBI的Genbank数据库4.1——大肠杆菌dUTPas（脱氧尿苷焦磷酸酶）X01714的DNA序列4.2——编码人dUTPase的成熟mRNA序列U902234.3——编码人dUTPase的dut基因序列。序列AF0184305、一级核酸数据库——基因组数据库Ensemble6、一级核酸数据库——微生物宏基因组数据库JCVI7、二级核酸数据库
HTML学习笔记 HTML学习笔记1.简介HTML 指的是超文本标记语言:HyperTextMarkupLanguage。HTML 不是一种编程语言，而是一种标记语言（标记语言是一套标记标签(markup tag)）<!DOCTYPE html>声明为 HTML5 文档 <html>元素是 HTML 页面的根元素 <head>元素包含了文档的元（meta）数据，如<meta charset="utf-8">定义网页编码格式为utf-8...
【生信】生物序列比对 1、生物序列比对介绍2、序列比对算法基于全局匹配的算法（1）打分矩阵（2）动态规划算法（3）Needleman-Wunsch算法基于局部匹配的算法Smith-Waterman算法Smith-Waterman算法与Needleman-Wunsch算法的区别启发式搜索算法BWT（(Burrows–Wheeler_transform)）算法3、多序列比对介绍
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