蓝桥杯——dna对比

题目描述

脱氧核糖核酸即常说的DNA，是一类带有遗传信息的生物大分子。它由4种主要的脱氧核苷酸(dAMP、dGMP、dCMT和dTMP)通过磷酸二酯键连接而成。这4种核苷酸可以分别记为：A、G、C、T。 

    DNA携带的遗传信息可以用形如：AGGTCGACTCCA.... 的串来表示。DNA在转录复制的过程中可能会发生随机的偏差，这才最终造就了生物的多样性。

    为了简化问题，我们假设，DNA在复制的时候可能出现的偏差是（理论上，对每个碱基被复制时，都可能出现偏差）：

　1. 漏掉某个脱氧核苷酸。例如把 AGGT 复制成为：AGT

    2. 错码，例如把 AGGT 复制成了：AGCT

    3. 重码，例如把 AGGT 复制成了：AAGGT

    如果某DNA串a，最少要经过 n 次出错，才能变为DNA串b，则称这两个DNA串的距离为 n。

    例如：AGGTCATATTCC 与 CGGTCATATTC 的距离为 2

    你的任务是：编写程序，找到两个DNA串的距离。 

【输入、输出格式要求】

    用户先输入整数n(n<100)，表示接下来有2n行数据。

    接下来输入的2n行每2行表示一组要比对的DNA。（每行数据长度<10000）

    程序则输出n行，表示这n组DNA的距离。

    例如：用户输入：

3

AGCTAAGGCCTT

AGCTAAGGCCT

AGCTAAGGCCTT

AGGCTAAGGCCTT

AGCTAAGGCCTT

AGCTTAAGGCTT

则程序应输出：

1

1

2

import java.util.Scanner;

public class dna对比 {

	/**
	 * @param args
	 */
	public static void main(String[] args) {
		Scanner sc=new Scanner(System.in);
		int n=sc.nextInt();
		String x[][]=new String[n][2]; 
		for (int i = 0; i < x.length; i++) {
			x[i][0]=sc.next();
			x[i][1]=sc.next();
		}
		for (int i = 0; i < x.length; i++) {
			System.out.println(f(x[i][0],x[i][1]));
		}

	}
	/**
	 * dp[i][j] 代表字符串s1编辑成s2，所产生的最小代价（距离）
	 * @param s1
	 * @param s2
	 * @return
	 */
	private static int f(String s1, String s2) {
		int dp[][]=new int[s1.length()+1][s2.length()+1];
		dp[0][0]=0;//s1和s2都为空字符串是，编辑代价肯定为0
		//s1不断增加，而s2只有一位，s1需要不断地减少，不断地漏掉元素，
		for (int i = 1; i < dp.length; i++) {
			dp[i][0]=i;
		}
		//s2不断增加，s1只有一位，发生不断地重码
		for (int j = 1; j < dp[0].length; j++) {
			dp[0][j]=j;
		}
		for (int i = 1; i < dp.length; i++) {
			for (int j = 1; j < dp[0].length; j++) {
				//如果当前字符相等
				if(s1.charAt(i-1)==s2.charAt(j-1)){
					//当前的最小代价等于前一状态的最小代价
					dp[i][j]=dp[i-1][j-1];
				}else {//如果不等
					//取三种状态中的最小值
					dp[i][j]=Math.min(dp[i-1][j]+1,dp[i][j-1]+1);
					dp[i][j]=Math.min(dp[i][j],dp[i-1][j-1]+1);
				}
				
			}
		}
		return dp[s1.length()-1][s2.length()-1];
	}

}