一只想成为战斗鸡的菜鸡
qq_39292916
这个作者很懒,什么都没留下…
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gffread 常用使用自己速记
gffread gff3文件 -g 基因组文件 -x cds文件 -y pep 文件gffread gff3文件 -T -o gtf文件gffread gtf文件 -o gff文件大家常见的-o- 是 指定输出打印到屏幕,所以也可以写成gffread gtf文件 -o- > gff文件转载 2022-03-02 16:22:16 · 1010 阅读 · 1 评论 -
关于蛋白 domain建树的总结
最近第一次建树,发现用全长蛋白序列建树的支持度太差,所以就选择蛋白序列建树,网上搜了一圈发现蛋白序列建树只有预测蛋白序列,诸如网站pfam,或者SMART网站等。但是就是没有说怎么提取蛋白 domain序列我首先是看基因家族鉴定的文献,发现很多是用 domain建树。如果此时还是不好,那么树是什么样,就是什么样。首先要获取对应的转录家族序列,这一步简单,只要去pfamA看一下,但是一定要尽量细化到最下面的亚家族。这可以使用 BLAST看一下,有自己的基因组网站,最方便,直接查,否则就用planttfd原创 2020-06-30 22:18:11 · 1540 阅读 · 0 评论 -
NCBI下载链接出错
SRA浏览器查询的下载链接Runinfo的下载链接使用IDM批量下载的时候,使用Runinfo的下载链接死活都找不到。虽然下载链接多数都在尾部是".1",但是下载链接并不一定一定含有它才能找到文件,这只不过是提供排查的方法。...原创 2019-12-05 08:52:47 · 510 阅读 · 0 评论 -
windows桌面图标显示不正常
http://www.xitongzhijia.net/xtjc/20190409/153615.html原因是因为图标是放在缓存里面的,每一次都是从缓存读取的1.查看隐藏文件2.win+r输入%localappdata%之后,删除iconcache.db3.在任务管理器后台重新启动服务即可...转载 2019-12-04 00:31:58 · 231 阅读 · 0 评论 -
pycharm更改项目名称
https://jingyan.baidu.com/article/d3b74d643374d31f77e60931.html我按照这篇提示操作提醒我java错误于是我把==.idea==文件删除直接重新导入工程原创 2019-12-03 23:03:14 · 2718 阅读 · 0 评论 -
Xpdf-read工具安装
下载地址:http://www.xpdfreader.com/download.html这里分为两个工具:一个是阅读器一个是编辑的工具我一直在安装阅读器的时候出错因为在接受证书同意的时候,我一直打的是一个y,但是认证的时候需要的是yes!以此为戒!...原创 2019-10-12 11:39:28 · 275 阅读 · 0 评论 -
nohup与&
参阅《鸟哥的私房菜》知道 &命令是让任务在终端后台背景运行nohup可以让任务在远程服务器下工作还有参阅这篇博文https://blog.csdn.net/liupeifeng3514/article/details/79711694我知道nohup command > a 2>&1 &的意思也就是把命令的输出结果放到a的文件里,但是如果出现错...转载 2019-09-22 00:10:56 · 73 阅读 · 0 评论 -
conda卸载失败
今天使用conda卸载软件失败,代码为000后来在家目录里把.condarc文件里的–default删除一切恢复正常原创 2019-09-10 09:56:17 · 3018 阅读 · 0 评论 -
RNA-seq收获(1)
今天学到了三大测序技术优缺点主要就是短读长高通量,但是长读长与直接测序技术的测序效率太低。但是长序列测序技术却可以很好辨别剪切异构体...原创 2019-08-09 02:07:01 · 82 阅读 · 0 评论 -
21根棍子的游戏的一种解决方式
这里给出一种方式很简单就是21-7-7-6,then we win原创 2019-05-10 16:12:37 · 714 阅读 · 0 评论