轩令的技术博客

最近换了一块2080ti,图灵架构，查表之后发现图灵架构的cuda debuger只支持Next-Gen，我显卡驱动型号是430.86（他要求），cuda版本9.2，现在是插着两块卡，都是WDDM模式。问题是：在调试的时候就是不能停在核函数的断点中。最开始猜想把2080ti这块卡改成TCC模式会不会变好，但是没改成。先试了cmd：nvidia-smi -g 0 -dm 1说我权限不够。用...

工作环境：显卡：MX250(帕斯卡架构）cuda版本：9.2显卡驱动：417.59vs版本：vs2015问题描述：最近出差想用笔记本跑一下cuda代码（为了这个目的特地买的装着mx250的超极本），然后在程序跑通的情况下发生了调试不了的问题。自己初始化的和函数跑start CUDA debugging的话根本不会跑kernel中的代码，自己跳出。解决思路：之前的解决办法有两个：1...

今天调试的CUDA程序除了点问题，第一步先要增大TDR的值。在该值的过程中，我遇到了这个问题：应该是需要更高的权限来修改这个参数。尝试1：

1.GPU硬件相关:使用卡的型号：总结一下英伟达显卡的型号,N卡自发展至今经历了这几个架构：第一代G80:tesla架构第二代：费米架构第三代：开普勒架构第四代：麦克斯韦架构第五代：帕斯卡架构其中我们所用到的设是1050ti、1080ti、和TITAN X。其中1050ti的结构是6核（sm)，每个sm中有128个计算单元（sp），共768个sp。其中1...

做一个笔记，防止经常找不到。

之前一直不能很好区别GPU和FPGA的特点，今天小结一下。GPU优势1.从峰值性能来说，GPU（10Tflops)远远高于FPGA(<1TFlops);2.GPU相对于FPGA还有一个优势就是内存接口, GPU的内存接口（传统的GDDR5，最近更是用上了HBM和HBM2）的带宽远好于FPGA的传统DDR接口（大约带宽高4-5倍）;3.功耗方面，虽然GPU的功耗远大于FPGA的功耗，但...

问题描述：求这样一个step*16矩阵中每列的最小值,并存到第一行返回输出。 0 1 2 step=3360*64 group0 data0->data0.min[0] min[1] min[2] ... ... ... ... ....

分布式计算的hadoop与cuda的几点思考最近学习分布式计算，突然想到一个问题，hadoop 和cdua有什么关系。为什么有的问题要并行计算，交给GPU处理，而现在GPU编程的主体是cuda并行计算，有的交给分布式hadoop处理？学习后，受到点启发， 觉得应该是这样的：首先有两种情况：数据密集型、计算密集型1.数据密集型：数量大，但是对每一条数据的处理并不一定麻烦，比如，对1T的文件统...

ksw算法简介研究了这么久bwa-mem算法，也不知一次啃了ksw这块硬骨头，之前没有好好总结，今天来重点研究一下它。主要研究的对象是ksw_extend2函数，它是一个单线程、非完全匹配的sequence alignment算法，该算法基于动态规划的逻辑，进行数据匹配，由于数据间存在大量相关性，所以不方便并行实现，串行实现有十分耗时，我们的工作就是，把这一块从原工程中拎出来，并改写成GPU加...

一、BWA-MEM函数框架1 读入 bwt、options、reads；2 利用mem_chain生成chain；3 利用mem_chain_flt过滤掉部分chain；4 利用mem_chain2aln生成比对结果元数据。1.第一步：数据输入加载已经生成的bwt表。接口的参数文件名为：xx.fasta；实际中包含具有以下几个后缀名的文件.amb,.ann,.bw...

cuda数据排序方式