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原创 sed command instroduction

sed command instroductionsed命令是lunix中的强大文本编辑命令,它一次处理一行内容。处理时,把当前处理的行存储在临时缓冲区中,称为“模式空间”(pattern space),接着用sed命令处理缓冲区中的内容,处理完成后,把缓冲区的内容送往屏幕。接着处理下一行,这样不断重复,直到文件末尾。文件内容并没有 改变,除非你使用重定向存储输出。sed常用参数...

2018-09-14 18:10:42 268

原创 conda command

conda命令整理conda可以理解为一个工具,也是一个可执行命令,其核心功能是包管理与环境管理。 Installing on Linux 1.Download the installer:Miniconda installer for Linux.Anaconda installer for Linux.2.In your Terminal window, run: in...

2018-09-14 17:05:15 229

原创 9月14日-全外显子组测序分析流程

全外显子组测序分析及应用Whole Exome Sequencing,WES全外显子组测序分析及应用一 背景二 技术应用外显子捕获试剂盒有哪些?外显子捕获效率是什么?外显子测序一般建议做多少倍的覆盖?外显子测序能够测出多大的片段缺失?外显子捕获可以做CNV吗?外显子测序的优点是什么?外显子测序样品准备:一 背景外显子(exon)是真核...

2018-09-14 11:33:34 9047

原创 2018年9月14日

今天主要学习生物芯片和测序的基础分类生物芯片是 20 世纪 90 年代初发展起来的一种全新的微量分析技术,最大特点是高通量并行分析,在一块大小不等的玻璃片、硅片、塑料片、尼龙膜和凝胶等载体材料上,生物芯片以大规模阵列的形式排布不同的生物分子( 寡核苷酸、cDNA、基因 组 DNA、多肽、抗原、抗体等) ,形成可与目的靶分子互相作用、并行反应的固相表面。将芯片与荧光等标记的靶分子进行化学反应(...

2018-09-14 10:59:40 283

原创 markdown-01

2018-9-13紧张的生物信息学习第四天,学习了markdown写作,今天开始把每天的生活记录下来。今天晚上任务:看一篇WES文献练习GEO操作学习lunix基础 代码块代码块语法遵循标准markdown代码,例如:@requires_authorizationdef somefunc(param1='', param2=0): '''A doc...

2018-09-13 20:30:08 298

空空如也

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