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原创 R语言使用dbplyr::filter循环匹配数据

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2022-02-25 11:21:50 1126

原创 爬虫获取pubmed中文献的标题和摘要

为了满足快速浏览pubmed中相关文献标题和摘要的需求,写了个简单的爬虫(目前只实现了单个关键词以及多个关键词的and检索),用于批量获取感兴趣文献的标题和摘要。使用编辑器是python,所编写的爬虫主要使用requests模块+正则表达式。使用requests.get()来获取请求,使用re模块中re.compile(正则表达式).findall(请求)来获取标题和摘要。代码中对浏览器进行了伪装,但是就只用了2个浏览器。import requestsimport rekey=input("请输入你

2020-06-02 20:47:09 6177 17

原创 NetSig安装及简单使用

NetSig:NetSig通过整合分子网络信息和肿瘤基因组数据来识别肿瘤驱动基因。相较于MutSig、Oncodrive、gistic和RAE7-10,NetSig对于肿瘤样本数量、拷贝数比率、背景突变率的要求不高。一:下载及安装NetSig能在MAC OS和Linux下使用,下文只适用于Linux系统NetSig下载地址:https://www.lagelab.org/wp-content/uploads/2017/06/NetSig_Code.zip下载完成后解压:unzip NetSig_C

2020-05-25 14:10:42 1031 1

空空如也

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