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linux常用命令基本命令ls查看路径下的文件echo输出输入的东西/类似于printps查看进程信息/一般查进程PID的时候用top动态查看进程信息/动态看进程占用的资源大小>重定向：cat aa.txt > bb.txt 将aa.txt内容复制到bb.txt>>追加重定向：cat aa.txt >> bb.txt 将aa.txt内容追加到bb.txtdu查看当前文件大小df查看磁盘使用情况kil.
2020-10-21 19:59:39
101
原创 c++
C++指针指针：（4字节 32位，8字节64位）不能取访问的指针：空指针：初始化为0，不可直接访问，（0~255无法放问）野指针：指向非法的的地址块（无访问权限）。const修饰指针(const int * p)：常量指针(指针的指向可以修改，但是指针指向的值不能改)修饰常量（int * const p）：指针常量(指针的指向不能修改，但是指针指向的值能改)修饰常量又修饰常量(const int * const p)：都无法修改指针访问数组：int arr[10];int * p
2020-06-08 19:25:09
318
原创 国家微生物科学数据中心精品公开课---笔记
人体微生物组与健康—朱宝利背景微生物无处不在微生物组：以群体形式发挥作用人体基因组决定了人体健康基础，微生物组决定了人体健康状态。人体微生物组计划—精准医学—精准医疗DNA（变异、遗传病相关，药物治疗）、临床、基因组，表观基因组，蛋白质大数据概念：微生物组：任意一个生态环境中的微生物群及其基因组的总和，包括相互作用（微生物群+基因组+相互作用）微生态：任意一个环境中的微生物总和及状态（宿主+微生物群落）元基因组：也称宏基因组，指任意一个生态环境中的微.
2020-05-26 20:46:17
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原创 设计模式，稳定中有变化的情况
变化与稳定的分割构造函数调用虚函数是静态绑定别人的笔记面向接口编程：设计为抽象基类对象创建：6、工厂方法通过继承基类来对多个相似的具体类进行构造，从而可以动态绑定所使用的类。绕开new具体类，避免依赖具体实现细节，将类的选择放到未来传入所在函数再new对象（将基类与具体类分开写在不同文件夹）。7、抽象工厂（由上面增加）不同：一系列互相依赖的对象创建（将有关系的类合...
2020-03-27 11:10:38
225
原创 我的记录
有用的网站1、github2、w3school 可以在线运行一些程序3、letcode一、linux环境部分1、linux下无法编译出双击可执行文件：自16.10起，gcc就默认开启了pie选项，导致编译出的文件的mime是application/x-sharedlib，一般的文件管理器只认application/x-executable，就没把它当成可执行的。https://f...
2020-02-11 15:17:32
553
原创 论文阅读：蛋白质作用预测
一、deepNF ：1、目的：预测蛋白质功能2、方法：多模型的深度自编码器，从多种异构相互作用网络中提取高级特征，使用random walk with restarts(可以回到原点的随机游走) 与 positive pointwise mutual information将network转化为vector，输入到自编码器中学习其低维表示最后使用svm来进行分类。（对比算法mashup与g...
2019-12-09 22:17:03
674
原创 论文阅读：Finding Archetypal Spaces for Data Using Neural Networks
Finding Archetypal Spaces for Data Using Neural Networks：1、目的：使用神经网络寻找数据的原型空间（寻找它的顶点后用多面体拟合数据）2、方法：使用神经网络学习数据，降维表示后再进行拟合。AAnet：自编码器，数据空间转换。2.1、实验数据集：非线性合成数据，两个生物数据集dataset of gut microbiome prof...
2019-12-09 10:55:16
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原创 论文阅读：DeepCORAL
DeepCORAL：https://github.com/VisionLearningGroup/CORAL.1、目标：提出一种域自适应（在无标签的情况下完成另外一个域的训练分类。）2、方法：使用预训练好的模型，对相似数据的其他域进行在训练，从而达到分类的效果。3、亮点：定义了一个不同域的loss函数，可以另外加于某一层，加权后于分类loss一起使用。...
2019-12-09 10:27:15
1545
原创 Refseq : accession id to taxonomy lineage.
本文介绍的是关于Refseq生物基因组数据库库，如何从物种的accesionid 转化到具体的 taxonomylineage的方法： 下载Refseq的完整基因组数据 我们可以通过ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/release/complete/来下载完整的基因组数据，从assembly_summary_refseq.txt获取ta...
2018-11-12 21:27:02
1393
原创 初始化方法的比较
import numpy as npimport matplotlib.pyplot as pltimport sklearnimport sklearn.datasetsfrom init_utils import sigmoid, relu, compute_loss, forward_propagation, backward_propagationfrom init_utils i
2017-11-12 14:28:03
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空空如也
空空如也
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