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原创 学习记录(四):医学图像配准使用到的代码。
1.python以三视图形式显示三维.nii格式医学图像import nibabel as nibfrom nibabel.viewers import OrthoSlicer3Dfile = nib.load("path") #将.nii格式图像读入OrthoSlicer3D(file.dataobj).show()2.对图像进行裁剪(.nii格式)import numpy as npimport nibabel as nibfile = nib.load("path") #将
2021-07-09 11:51:00 3449 5
原创 学习记录(三):安装Freesurfer时出现FreeSurfer Registration Error reCAPTCHA not checked,无法收到邮件。
https://blog.csdn.net/jackjones_008/article/details/106102237参考这篇文章,使用火狐浏览器注册,安装插件并设置后可解决问题。PS:邮箱填写那里,用了两个qq邮箱都不行,不知道是我的问题还是qq邮箱就是收不到呢,最后换了个163邮箱也是延迟好久才收到邮件。...
2021-05-08 18:06:27 2618 5
原创 学习记录(二):MATLAB求三维矩阵梯度
使用[gx,gy,gz]=gradient(a)语句,可调用MATLAB求梯度函数gradient对三维矩阵a求梯度,得到gx,gy,gz分别是沿三维矩阵x,y,z三个方向求得的梯度。下面通过一个例子说明:首先得到一个三维矩阵a:aa(:,:,1) = 1 2 5 7 4 9 5 6 8a(:,:,2) = 8 3 110 7 613 2 5a(:,:,3) = 3 9
2020-11-25 11:53:53 4465 5
原创 学习记录(一):RIRE数据集
如何将数据转换为.dcm格式?如何将.mhd格式文件转换为.jpg,.tif等格式?step1:安装python(并用pip安装cv2和ITK模块)step2:运行下列代码import SimpleITK as sitkimport cv2itk_img = sitk.ReadImage(‘C:\Users\acer\Python\Python36\patient_001\ct...
2020-03-08 12:49:49 1532 11
空空如也
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