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“时问桫椤”是一个致力于为本科生到研究生教育阶段提供帮助的不太正式的公众号。我们旨在在大家感到困惑、痛苦或面临困难时伸出援手。通过总结广大研究生的经验,帮助大家尽早适应研究生生活,尽快了解科研的本质。祝一切顺利!——时问桫椤
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获取方法
公众号“时问桫椤”后台回复:生信分子生物学软件
BioEdit
https://pan.baidu.com/s/1IYQ-jhgOdg5HPof4fXg8bg(av9n)
一款专业强大的分子生物学应用软件,可以完成核苷酸序列和蛋白质序列进行所有常规的分析操作,如:序列比对、序列检索、引物设计、系统发育分析等。
chromas(基因测序峰图查看软件)
https://pan.baidu.com/s/1172_Ryl3QrJ9Xu7aZCvgEA(x6qq)
一款简单实用的基因测序峰图查看软件,通过该软件,用户可以对基因数据的变化进行监控测量,采用峰图的转换模式对基因变化的点、线、区域进行直观的分析,有效的检测基因数据的序列变化。
DNAMAN6.0-Raindy
https://pan.baidu.com/s/1GQ0puc9h9D_ysAW91HQ8pw(nngt)
一款高度集成化的分子生物学综合软件。dnaman软件可以用于多序列比对、PCR引物设计、限制性酶切分析等方面,几乎是囊括了生物学的所有日常核酸、蛋白质序列的分析工作。
DNASTAR.Lasergene.v7.1
https://pan.baidu.com/s/1yvXvPUpADq_BChl8d-eZrw(4377)
全面的生物医学软件,用作DNA和蛋白质序列分析、重叠群拼接和基因工程管理。包含了7个模块:SeqBuilder --可视化和序列编辑 SeqMan Pro --序列集结和SNP发现 MegAlign --序列组合 PrimerSelect --oligo primer 设计 Protean --蛋白质结构分析和预测 GeneQuest --基因查找 EditSeq --导入特殊文件工具。
winplas2.7
https://pan.baidu.com/s/1_CR20fmDXrMEq7hZt-Jlqg(mowg)
一款非常好用且功能强大的质粒绘图软件,属于专业的生物学软件,软件体积小巧,简单易用,只需要两分种便可以上手操作,主要用于各种论文和教程的质粒插图操作。
bvplasmid质粒绘图软件
https://pan.baidu.com/s/1P2rrWNkcJFYlyUn5hPPqFg(ss24)
SimVector 4.6Installer
https://pan.baidu.com/s/1Gz_w0wXdKZwCOstg8RtLcg(nkvq)
一款非常优秀的DNA分析和质粒图绘制工具。可以设计出各种矢量图、质粒图、载体图和序列图,支持自动生成发表质量的载体图谱,从而帮助生物学家进行试验设计和分析。
Vector NTI软件
https://pan.baidu.com/s/15B5c5LmCevflxzPKUqpiUg(vpt2)
由Invitrogen公司开发的一款序列综合分析软件,包括对齐显示设置、模拟电泳、分析GenomBench、输出查询分子、对分子序列的操作等功能,为序列综合分析提供了新的解决方案。
SSRHunter微卫星DNA位点查找软件
https://pan.baidu.com/s/1utzNTkaiTL6s15-3Mi8I3A(ndqd)
一款非常不错的免费工具;它是由南京农大金陵研究院的李强编写的微卫星DNA,位点查找软件,只要的目的就是为了方便专业人员在比较长的序列中搜索出潜在的SSR位点,并且还可以对SSR进行标记的操作,而且使用者还可以利用搜索的结果,开发出新的SSR标记。
SnapGene DNA序列分析软件
https://pan.baidu.com/s/1YZ1uPsNPmPaFB9FmcPyugw(memg)
一款功能强大的DNA序列分析软件,使用能够帮用户分析和修改 DNA图谱并将它们导出到其他格式,支持分析酶切位点、标签、启动子、终止子和复制子等质粒原件,生成详细的DNA序列文件。
QuantiScan v3.0
https://pan.baidu.com/s/1rWtsegl-UANrKrfM4OEHXQ(57r0)
使用简单功能专一的凝胶扫描、分析软件。QuantiScan还可以帮你分析,扫描多种多样的材料成分。
Oligo引物设计软件
https://pan.baidu.com/s/1cx_UOx07FG9SZ1aEtnSHTw (6hkx)
Primer Premier引物设计软件
https://pan.baidu.com/s/1mmOB2t9x1cAAvugqgcvk9A(xp0e)
一款实用的引物设计软件,软件包含了四大功能选项,包含了引物设计、限制性内切酶位点分析和DNA基元(motif)查找等功能。
fastPCR引物设计软件
https://pan.baidu.com/s/1Z-gCEo304_7okjz6V3Ztuw(yizf)
QuantityOne电泳图像软件
https://pan.baidu.com/s/1fRnTu5w03et05huhwUWwvw(16wp)
Gel-Pro analyzer凝胶定量分析软件
https://pan.baidu.com/s/19oxnhs15nF1oPQsDkqJZ9A(vrzo)
bandscan 凝胶图像分析软件
https://pan.baidu.com/s/1AXv14wYkDjGrkyjFxsURQw(dty9)
是一个很常用的凝胶图像分析软件,可用于琼脂糖凝胶电泳,SDS-PAGE及及转到膜上的Western Blot,Northern Blot,EMSA等的相对定量分析。
pyMOL软件
https://pan.baidu.com/s/1AJtFNNQRTe2bSnEaoUwn3A(0s9k)
PyMOL是一款由Python语言开发的开源的分子三维结构显示软件,被广泛运用于科学研究与教育领域。PyMOL适用于创作高品质的小分子或是生物大分子(特别是蛋白质)的三维结构图像。
RNAdraw软件
https://pan.baidu.com/s/1v2uCaQcdxOZ9OJ32y3_kkg(6z2o)
RNAdraw是一款RNA二级结构分析软件。支持RNA二级结构计算、序列分析、序列筛选等功能,用一种容易操作的方式来组织你所有的RNA数据文件,以进行多文档窗口打开的数据处理的软件。
PDQuest软件
https://pan.baidu.com/s/1DPOKgDLD_tYDw-5545QD4Q(9wue)
PDQuest 软件具有强大的比较分析能力,特别设计用于同时分析多块凝胶。这种先进的分析工具能揭示分析凝胶间的细微差异(例如研究热激、培养液、剂量反应和时间进程等变量的影响)。