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“时问桫椤”是一个致力于为本科生到研究生教育阶段提供帮助的不太正式的公众号。我们旨在在大家感到困惑、痛苦或面临困难时伸出援手。通过总结广大研究生的经验,帮助大家尽早适应研究生生活,尽快了解科研的本质。祝一切顺利!——时问桫椤
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3dBody人体解剖软件
https://pan.baidu.com/s/1zgwwLsZ1Mhe-BzfYw2m3OA(g4p5)
这是人体解剖3D互动体验学习系统,提供了两套3D的人体模型,涵盖了人体所有系统和器官,您可以在模型中实时交互,给您一个一步步解剖人体的机会,并可以随时大幅面保存当前图像。主要提供了系统解剖!
麦克明彩色人体解剖图谱
https://pan.baidu.com/s/1nzHVwRjsKvQiLcNGlydNCQ(x9ix)
很经典的实体解剖图谱,网上流传的都是CHM版,看起来不方便,要拖来拖去,所以把它转换成了PDF版,并且添加了书签,便于阅读。
生 物 信 息 学 工 具
R包 (cran R + RStudio)
https://pan.baidu.com/s/1GP2u8uZvLxQhY644oqns2Q (d5ej)
FunRich基因功能分析工具
https://pan.baidu.com/s/1FrNZbyZQMn-6QIoO7XiUNg(kmxe)
软件主要完成基因功能注释。主要用于基因和蛋白质的功能富集和相互作用网络分析的独立的软件工具,分析结果可以Venn图、Bar图、Column图、Pie和Doughnut等图表形式呈现,简洁清晰。用户不仅可以搜索默认的后台数据库,还可以加载自定义数据库,从而进行功能富集分析。
BLAST 序列对比工具
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
CS-BLAST 序列对比工具
ftp://toolkit.lmb.uni-muenchen.de/csblast/
HMMER 序列对比工具
http://hmmer.janelia.org/
FASTA 序列对比工具
www.ebi.ac.uk/fasta33
MSAProbs 多序列对比工具
http://msaprobs.sourceforge.net/
DNA Alignment 多序列对比工具
http://www.fluxus-engineering.com/align.htm
MultAlin 多序列对比工具
http://multalin.toulouse.inra.fr/multalin/multalin.html
DiAlign 多序列对比工具
http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/dialign/
GenScan 基因识别工具
genes.mit.edu/GENSCAN.html
GenomeScan基因识别工具
http://genes.mit.edu/genomescan.html
GeneMark基因识别工具
http://exon.biology.gatech.edu/
Pfam 蛋白质结构域分析工具
http://pfam.sanger.ac.uk/
BLOCKS蛋白质结构域分析工具
http://blocks.fhcrc.org/
ProDom蛋白质结构域分析工具
http://prodom.prabi.fr/prodom/current/html/home.php
SLAM 基因组分析工具
http://bio.math.berkeley.edu/slam/
Multiz基因组分析工具
http://www.bx.psu.edu/miller_lab/
Magic-BLAST v 1.5.0
https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/magicblast/LATEST/
Magic-BLAST工具通用性非常强大,运行也很快。它可将要读取的片段与BLAST数据库或一个FASTA文件排列在一排。可接受FASTQ文件作为输入,或者自动从NCBI的SRA存储库中检索。