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RSS订阅原创 zerotier连不上的问题
让 ZeroTier 不走 UDP 点对点直连，强制走 ZeroTier 官方服务器 TCP 中继或者把 local.conf 改成这样：优先尝试 UDP 直连，直连失败才自动走 TCP 中继，这样能快就快，不能快才慢。或者，硬编码根服务器 IP，彻底绕开 DNS；同时开启 TCP fallback，UDP 被封自动切 TCP，永不掉线作用：直接用 IP 连接根服务器，再也不会因为 DNS 解析失败断网同时保留了 UDP 直连，延迟更低，比 TCP 中继快很多然后重启 ZeroTier 服务。
2026-04-12 11:28:42
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原创 CP2K2025安装的那些坑
注意不要安装最新的2025 oneAPI，从2025年开始，ifort就被废弃了，然后主要用ifx更新。但是还有很多是对ifort进行的适配，比如openmpi等，此时最好不要将ifort更新为ifx。CP2K 给 mpicxx（MPI C++ 编译器）传递了 Intel 编译器专属参数，但你的 mpicxx 实际调用的是 GCC(g++)，GCC 根本不认识 Intel 的编译选项，直接报错。命令后头加上–with-cosma=no避免装COSMA库，无效，还是会自动安装，安装失败。
2026-04-05 14:40:38
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原创 向日葵远程控制ubuntu24一直显示连接中
观点认为：核心原因是 Linux系统的显示服务器协议不兼容，具体是“Wayland协议”与主流远程工具存在适配冲突。
2026-03-26 20:43:15
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原创 Molecular Nodes
通过节点创建选区快速而强大，但有时用文字写选区更方便，且某些特殊选区目前尚无法靠节点实现。选中轨迹物体后，在 Object 标签页 的 Molecular Nodes 面板中，可用 MDAnalysis 选择语法 编写自定义选区。这些选区会以 Named Attribute（命名属性） 的形式自动出现在 Geometry Nodes 里。面板提供两个开关：Updating – 每一帧都重新计算选区Periodic – 按周期性边界条件计算。
2025-11-25 19:19:20
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原创 zerotier内网穿透
安装 OpenSSH Server，OpenSSH 是一组工具集合，它允许您使用 SSH 在网络上进行安全。启动zerotier-one.service。检查 ZeroTier 运行状态。zerotier内网穿透。停止 ZeroTier。重启 ZeroTier。安装zerotier。
2025-11-05 10:30:51
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原创 Cannot run short-ranged nonbonded interactions on a GPU because no GPU is detected报错解决
gmx安装未报错，nvidia-smi输出正常，nvcc -V输出正常，正常运行检测不到GPU。
2025-10-31 16:13:33
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原创 genpoly_lt.py
genpoly_lt.py 是一个用于准备包含聚合物的模拟的程序。它适用于将聚合物缠绕在任意曲线上。（这里提供了一个使用示例。）genpoly_lt.py 会生成一个moltemplate文件（.LT文件），其中包含定义聚合物分子的内容，该聚合物分子中的单体位于一个3列文本文件（在下面的例子中为“coords.raw”）中指定的位置。单体将被旋转，使其指向聚合物轴的方向（见“-dir-indices”），并且可以添加可选的螺旋扭曲（见“-helix”）。
2025-10-04 19:30:28
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原创 centos7升级glibc2.17到2.27失败补救措施
这时可以将glibc升级到2.19，经测试，这个升级过程可以正常完成，然后再装软件就不会报这个错了。如果经过上述操作依然有问题，如安装别的软件是configure失败或make -j失败，显示缺少某些库，这时可以去另一台centos机器的lib64拷贝同名的库过来。且glibc版本为2.17时千万不要直接升级到2.25，行安装2.25会安装失败，且会造成系统崩溃。：glibc2.27未编译安装成功，但部分组件依赖的函数库软链接指向到了glibc2.27上。glibc2.17升级到2.19。
2024-03-03 19:45:55
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原创 np.min()与torch.min
torch.min()接收一个数组表示取该张量数组的最小值，接收两个数组表示按位取较小的元素，而np.min()不能接收两个数组。np.min(array, axis=None, out=None, keepdims=False)取数组中的最小值；
2023-09-26 21:32:36
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原创 pyarma.h:55:2: error: no matching function for call to ‘pybind11::buffer_info::buffer_info(double*,
pyarma.h:55:2: error: no matching function for call to ‘pybind11::buffer_info::buffer_info(double*, long unsigned int, std::string, int, , )’);^
2023-09-11 09:38:51
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转载 勒贝格积分
勒贝格曾对他的这一积分思想作过一个生动有趣的描述: “我必须偿还一笔钱. 如果我从口袋中随意地摸出来各种不同面值的钞票, 逐一的还给债主直到全部还清, 这就是黎曼积分; 不过, 我有另外一种作法, 就是把钱全部拿出来并把相同面值的钞票放在一起, 然后再一起付给应还的数目, 这就是我的积分''.
2023-08-20 19:40:01
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原创 遍历论学习笔记
动力系统起源于牛顿所建立的经典力学，这种情形下一般是以时间为参变量的微分方程占据主导地位，大家所做的研究是通过求微分方程的显示解来解任何天体问题。19世纪末，庞加莱的《天体力学的新方法》中将相空间的几何引入到分析过程中，相空间代表所有系统参数向量所有值的可能空间。对单个解我们不太能够得到太多的信息，现在转而求解大部分解曲线的信息，在这种情况下，我们就从由微分方程定义的系统转换到研究相空间和作用群。简单的来说，动力系统研究的是相空间上作用长时间演化的极限行为。便理论从上个世纪初到现在发展出了非常多的内容。
2023-08-19 20:07:05
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原创 Block Averaging
如果我们取 t 时刻的数据点，在 t 之后的一段时间，我们可以放心地假设我们的数据是不相关的。想象一下，如果你走在街上，被一条裂缝绊倒了：走了几步之后，你的脚步声就会非常不规则——它们会比平时更长，而且间距也非常不均匀。在走了两到五步之后，当你恢复过来的时候，你现在的脚步和你绊倒时走的步子之间的相关性几乎是不明显的。我们在这里用了同样的方法。理想情况下，我们希望找到给出不相关数据的最小的块。这也是一个不错的近似值：我生成了1000组自相关数据，并要求我的程序以95%的置信区间找到平均值(和误差条)。
2023-08-16 14:31:39
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原创 对于变分自编码器VAE的重构损失使用均方差MSE还是二分类交叉熵的思考
当前网络上的关于VAE模型损失函数尤其是重构损失这里，有的使用均方差损失MSE,有的使用二分类交叉熵。那么，到底该使用哪一种或者说两者都可以？
2023-07-14 11:01:23
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原创 AttributeError: module ‘numpy‘ has no attribute ‘zeros‘
解决办法：卸载当前版本numpy换低一点版本numpy安装。
2023-06-29 18:50:12
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原创 2021-07-13
阶段作业一（绘图部分）基于jupyterlab绘图代码如下：import numpy as npimport pandas as pdimport matplotlib.pyplot as pltfrom mpl_toolkits.mplot3d import Axes3Dfrom ipywidgets import interactx1 = np.arange(-100, 100, 0.1)x2 = np.arange(-100, 100, 0.1)x1, x2 = np.meshgri
2021-07-13 22:12:35
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空空如也
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