解决AcaFinder使用PfamScan过程中，遇到IndexError: list index out of range问题

最新推荐文章于 2024-07-17 21:04:45 发布
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问题描述：

在AcaFinder的使用Pfam进行annotation的步骤中，遇到如下报错

IndexError: list index out of range

检查functions_verProdigal.py文件的line 441

Info_list.append(“|”.join([line[5], line[6], line[12], line[14]])) #hmmacc|hmmname|evalue|clan

大概是这个几个index number需要调整

使用EMBL的PfamScan服务，上传一段fasta序列，观察输出的结果

调整functions_verProdigal.py文件的line 441为

Info_list.append(“|”.join([line[1], line[2], line[11], line[12]])) #hmmacc|hmmname|evalue|clan

再次运行，无index out of range报错

botu0w0
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