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RSS订阅原创 云计算虚拟化Libvirt Domain XML Format中文版—对照学习使用
笔者在云计算工作中记录虚拟化Libvirt XML相关学习内容说明资料源：部分术语及libvirt目标域XML格式(Domain XML Format)1. 元素和属性概述(Element and attribute overview)1.1 通用元数据(General metadata)1.2 操作系统启动(Operating system booting)1.2.1 BIOS引导加载程序(BIOS bootloader)1.2.2 主机引导加载程序(Host bootloader)1.2.3 直接内核引
2024-08-10 17:18:21
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原创 network_UNet_3D_可直接运行查看模型情况
import torchfrom torch import nnfrom torchsummary import summaryclass VGGBlock(nn.Module):‘’’define a block of operations: 2x[Conv -> BN -> Relu]定义一组操作。2x[Conv -> BN -> Relu]‘’’def init(self, in_channels, middle_channels, out_channels):
2022-05-23 10:08:09
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原创 network_UNet_2D_可直接运行查看模型情况
import torchfrom torch import nnfrom torchsummary import summaryclass VGGBlock(nn.Module): ''' define a block of operations: 2x[Conv -> BN -> Relu] 定义一组操作。2x[Conv -> BN -> Relu] ''' def __init__(self, in_channels
2022-05-22 15:49:22
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原创 windows11 VS Code配置C++
Visual Studio Code是一个轻量级但功能强大的源代码编辑器。官网地址官网文档地址从mingw-w64官网下载地址种使用GCC C++编译器（G++）和GDB调试器配置Visual Studio代码来创建能在Windows上运行的程序。（我选择下载完整压缩包方式，避免在线安装出现 downloaded incorrectly)首先下载好 VS Code安装包，并选择路径自行安装打开主界面，在左侧导航栏找扩展包，搜索C++,安装前两项搜索Code Runner完整压缩包地
2022-04-22 13:43:28
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原创 使用PyCharm远程调试导入本地module报ModuleNotFoundError：no module name
远程连接ubuntu调试代码出现错误。报错内容如下Traceback (most recent call last): File "<frozen importlib._bootstrap>", line 991, in _find_and_load File "<frozen importlib._bootstrap>", line 973, in _find_and_load_unlockedModuleNotFoundError: No module named
2022-04-06 11:28:40
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原创 查看pkl文件，并进行内容修改
在nnUNet框架中生成了pkl文件，存储了模型对当前数据的训练规划，最简单的为patch 和 batch可视显卡容量和自己的想法，对如上两个内容进行修改和查看，如我要充分利用3090显卡的24g容量，将batch修改为4只需要安装nnUNet作者的batchgeneratorimport picklefrom batchgenerators.utilities.file_and_folder_operations import *import numpy as np#源plans文件的
2022-03-23 15:26:32
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原创 解决笔记本扩展显示器黑屏问题
当添加扩展显示器时，会出现无信号/黑屏问题需要检查如下选项：1.鼠标右键打开NvVIDIA控制面板在设置中优先选择集成显卡，不要高性能显卡2. 在显示设置中，调整显示器2的分辨率，更改为笔记本同分辨率，不要使用默认推荐3.在下面的高级显示中调整显示器的刷新率，选择整数/小一点的...
2022-03-10 09:13:46
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原创 解决Python环境中No module named ‘cv2‘ 问题
关于在Conda 环境中添加cv2 Module程序中有如下命令import cv2程序报错:ModuleNotFoundError: No module named 'cv2'在cmd和Anaconda Promote激活环境在使用换镜像源，使用pip install 命令发现无法解决，报如下错Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve.建议按照Anaconda
2021-12-11 14:20:39
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原创 读取nii.gz格式的医学图像和标签
直接在Pycharm中CV安装相应的包可对具体内容取消注释进行展示import numpy as np # 转换格式import nibabel as nib # 读取数据import matplotlib.pyplot as plt # 单张图像展示from nibabel.viewers import OrthoSlicer3D # nii.gz展示import matplotlibmatplotlib.use('TkAgg') # 用于滚动查看nii.gz# 使用 niba
2021-12-01 22:07:48
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原创 python打开nii.gz，可查看像素值
import matplotlibmatplotlib.use('TkAgg')from matplotlib import pylab as pltimport nibabel as nibfrom nibabel import nifti1from nibabel.viewers import OrthoSlicer3Dexample_filename = 'H:\Project/nnUNet-1-master\DATASET/nnUNet_raw/nnUNet_raw_data\Tas
2021-11-24 10:40:37
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原创 3d医学图像nii.gz转换为png(单次处理单视窗）
默认拥有后缀名为nii.gz的医学格式数据使用ITK-SNAP查看数据为3个视窗，默认选取矢状面Sagittal即右上角视窗在编译器中打开该程序，安装相应的包在最下面的main函数中修改为自己的路径保存的图像为默认名字+切片号，可根据自己数据的名字长度做调整import scipy, shutil, osimport sys, getoptimport imageiofrom tqdm import tqdmimport nibabel as nibimport numpy as np
2021-11-23 21:20:08
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原创 在ubuntu/windows中安装nnUNet并训练自己的数据
1.首先创建conda环境conda create -n nnUNet python=3.7 -y2.安装Pytorch环境，版本问题可根据自己的显卡cuda环境建议去Pytorch管网，找Previous版本(https://pytorch.org/get-started/previous-versions/)我的环境安装pytorch1.7.1, cuda=10.1添加清华源加快下载速度#添加镜像源conda config --add channels https://mirrors.t
2021-11-17 11:29:43
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原创 nnUNet生成自己数据集的dataset.json
实现nnUNet的dataset.Json 文件生成。需要有python编译环境，最好在nnUNet的conda envs中运行首先激活自己的环境，安装一个包pip install --upgrade batchgenerators在编译器Pycharm或者环境中运行该函数// 该功能可实现nnUNet的Json文件生成import osfrom batchgenerators.utilities.file_and_folder_operations import save_json, s
2021-11-16 10:31:32
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1
原创 Dicom批量转换为Nifti格式的github小工具使用（命令行方式）
医学图像格式转换（DICOM -> NIFTI）Dicom是一个医学图像标准，不一定是具体的文件后缀，如医院原始的CT和MRI数据并无后缀（图示为核磁数据）。该文件夹下有多张图像，神经网络处理方式通常为标准的(.nii.gz)压缩格式，即将该文件夹下多个图像合成一个文件。方法和工具：Github链接: link.安装方法：（如果有conda,建议使用如下方法，省事）打开命令行（cmd)，激活自己的环境（activate 你自己的环境名称)conda install -c conda-f
2021-07-18 11:33:34
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转载 3D医学图像CT dcm格式转换为png
医学图像 CT dcm格式转换为png在normalize_hu（）中修改像素值，需要具体数据对象具体分析只需要在main函数中更改dcm文件路径"""读取dicom图像并将其转换为png图像读取某文件夹内的所有dicom文件:param src_dir: dicom文件夹路径:return: dicom list"""import osimport SimpleITKimport pydicomimport numpy as npimport cv2from tqdm imp
2021-05-11 22:00:42
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原创 Python 批量将RGB转换为灰度图
from PIL import Imageimport osINPUT_PATH = r'F:\AIStudio\Test'OUPUT_PATH = r'F:\AIStudio\Test_Gray'files_list = os.listdir(INPUT_PATH) # 读取列表信息，可打印查看for file in files_list: # Version1 I = Image.open(INPUT_PATH + "/" + file) L = I.con..
2021-04-28 16:34:55
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空空如也
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