DNA sequence
直接中文了
题目描述
21世纪是生物科技飞速发展的时代。我们都知道基因是由DNA组成的,而DNA的基本组成单位是A,C,G,T。在现代生物分子计算中,如何找到DNA之间的最长公共子序列是一个基础性问题。 但是我们的问题不是那么简单:现在我们给定了数个DNA序列,请你构造出一个最短的DNA序列,使得所有我们给定的DNA序列都是它的子序列。 例如,给定"ACGT","ATGC","CGTT","CAGT",你可以构造的一个最短序列为"ACAGTGCT",但是需要注意的是,这并不是此问题的唯一解。
输入
第一行含有一个数t,代表数据组数。 每组数据的第一行是一个数n,代表给定的DNA序列数量;接下来的n行每行一个字符串s,代表给定的n个DNA序列。 1<=n<=8,1<=|s|<=5
输出
对于每一组数据,输出一行中含有一个数,代表满足条件的最短序列的长度。
样例输入
1 4 ACGT ATGC CGTT CAGT
样例输出
8
题目链接
https://vjudge.net/problem/HDU-1560
给出N个DNA序列,要求出一个包含这n个序列的最短序列是多长,直接dfs吧
AC代码
#include <iostream>
#include <cstdio>
#include <fstream>
#include <algorithm>
#include <cmath>
#include <deque>
#include <vector>
#include <queue>
#include <string>
#include <cstring>
#include <map>
#include <stack>
#include <set>
#include <sstream>
#define IOS ios_base::sync_with_stdio(0); cin.tie(0);
#define Mod 1000000007
#define eps 1e-6
#define ll long long
#define INF 0x3f3f3f3f
#define MEM(x,y) memset(x,y,sizeof(x))
#define Maxn 10
using namespace std;
int pos[Maxn];//pos[i] 第i个序列正在使用第几个位置
int T,n;
int deep;//自己构造的DNA序列最小长度
char c[10] = "ACGT";
struct node
{
char ch[Maxn]; //DNA的组成
int len; //DNA长度
};
node a[Maxn];//a[i] 第i个DNA序列
int init()//预估长度
{
int ans=0;
for(int i=0;i<n;i++)//总长度-正在使用的位置=剩下还没用的位置 即预计长度
ans=max(ans,a[i].len-pos[i]);
return ans;
}
int dfs(int step)
{
if(step+init()>deep)//预计长度+当前长度>构造DNA序列的最小长度
return 0;
if(init()==0)//预计长度为0,即已完成
return 1;
int pre[Maxn];//先将pos保存起来,一会回溯要用
for(int i=0;i<4;i++)
{
int f=0;
for(int j=0;j<n;j++)//保存pos
pre[j]=pos[j];
for(int j=0;j<n;j++)//当前这位符合,则该串的位置往后移一位
{
if(a[j].ch[pos[j]]==c[i])
{
f=1;
pos[j]++;
}
}
if(f)
{
if(dfs(step+1))//有符合的,则往下搜索
return 1;
for(int j=0;j<n;j++)//回溯
pos[j]=pre[j];
}
}
return 0;
}
int main()
{
cin>>T;
while(T--)
{
deep=0;//自己构造的DNA序列最小长度
cin>>n;
for(int i=0;i<n;i++)//存值
{
cin>>a[i].ch;
a[i].len=strlen(a[i].ch);
deep=max(deep,a[i].len);
pos[i]=0;
}
while(1)
{
if(dfs(0))
break;
deep++;
}
cout<<deep<<endl;
}
return 0;
}