一文解决no module named skmisc问题

一文解决no module named skmisc问题

之前在运行scanpy下的一个函数时遇到了一个问题。

#Normalization
sc.pp.highly_variable_genes(adata, flavor="seurat_v3", n_top_genes=3000)
sc.pp.normalize_total(adata, target_sum=1e4)
sc.pp.log1p(adata)

在运行sc.pp.highly_variable_genes(adata, flavor=“seurat_v3”, n_top_genes=3000)这一行代码时报错：

因为最近换了电脑需要安装新的环境，老电脑当时也遇到了这个问题但是不知道怎么稀里糊涂的解决了，我把环境迁移到新电脑上的时候却依然报错，按照给出的方法，无论是使用pip install --user scikit-misc还是使用pip install scikit-misc都没办法解决该问题，解决了两天终于通过一个方法解决了该问题。
博客链接为：链接: link

pip install -i https://test.pypi.org/simple/ "scikit-misc==0.2.0rc1"
需要在python=3.8的环境下才可以运行，以下附上一些相关包的版本：
conda=22.9.0 cuda=11.3 python=3.8 torch=1.10.0+cu113
numpy=1.23.5 scanpy=1.9.2 scikit-learn=1.2.1 scipy=1.10.1 scikit-misc=0.2.0rc1
torch-cluster=1.6.0 torch-scatter=2.0.9 torch-sparse=0.6.13 torch-spline-conv=1.2.1
torch-geometric=2.0.0（torch-geometric如过版本过高会报另一个错误）