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RSS订阅原创 lifelines+ImportError: DLL load failed: The specified module could not be found.
在成功安装了lifelines包后，输入from lifelines import KaplanMeierFitter报错：DLL load failed: The specified module could not be found.lifelines github中也有如此的问题，作者提示输入：from scipy import stats也有类似的报错，需要从scipy包入手解决。查阅一些blog后，发现需要下载numpy + mkl模块，下载地址为：http://www.lfd.u
2020-07-12 20:39:06
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原创 杂
由于在日常的学习中经常会有一些不知道如何归类的知识，就先存放在这里，再作转移~GSEA分析fold change: 衡量基因表达水平 差异倍数(fold change)
2020-05-21 22:05:27
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原创 一些常用的Linux基础命令
pwd: 列出当前目录的完整路径cd+目录: 跳转目录；cd -: 跳回最近一次目录；cd …: 跳回上一层目录ls: 列出当前目录内容；ls -l: 列出当前目录内容的详细信息mkdir: 创建目录rm: 删除文件或目录mv: 重命名文件或目录cat: 打开文本文件，内容输出到屏幕; less -SN: 以一种更佳的方式查看文本文件head -n: 查看文件前n行tail -n...
2020-02-14 20:12:40
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原创 在Xshell上使用Jupyter
之前已经在Xshell上安装好anaconda3的朋友们如果想知道如何打开使用Jupyter，那么本文可以帮助快速入门。文章目录1.进入ipython或python环境2.配置jupyter notebook3. 打开jupyter notebook1.进入ipython或python环境ipythonpython在python或ipython环境下输入：from notebook...
2020-01-12 15:10:13
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原创 SVD(Singular Value Decomposition, 奇异值分解)数学证明
奇异值分解（SVD）在机器学习、图像压缩中应用很多，使用它能够节省很多存储空间。这里主要从数学原理上阐述SVD。SVD奇异值分解定义数学证明奇异值分解定义对任意矩阵A∈Rm×nA \in R^{m\times n}A∈Rm×n，存在正交矩阵U∈Rm×m,V∈Rn×nU \in R^{m \times m}, V\in R^{n \times n}U∈Rm×m,V∈Rn×n及除了主对角线上的元...
2019-12-20 17:32:14
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原创 PyMol操作
查看文件目录pwd修改文件目录cd + <文件路径>载入PDB文件本地：load <filename>网络：fetch <pdb id>，<object_name> #<object_name>可无鼠标操作键盘左键中键右键无rotate,旋转图像translate,平移zomm,变...
2019-10-06 11:28:27
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原创 有关python的一些基础命令
1.查找路径import osos.getcwd()2.更改路径import osos.chdir("D:\file_name")3.查看数据类型type(object)
2019-09-26 15:38:05
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原创 WGCNA方法简介
加权基因共表达网络（weighted gene co-expression network analysis）是一种广泛使用的数据挖掘方法，用两两变量间相关系数研究生物网络。大致步骤：1、基因共表达定义两向量间的距离；2、选定β值（幂函数评估连接强度），生成邻接矩阵；3、模块中心分析：拓扑重叠指标、模块特征向量；4、建立共表达网络，判断特定模块的模块间枢纽基因。详细介绍：1、用sij...
2019-07-13 23:02:15
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原创 Windows 命令提示符
最近几天接触到 Windows 命令提示符，发现很有趣，全靠键盘完成一系列操作，完全不依赖鼠标！Windows 命令提示符是什么呢？命令提示符是在操作系统中，提示进行命令输入的一种工作提示符。在不同的操作系统环境下，命令提示符各不相同。在windows环境下，命令行程序为cmd.exe，是一个32位的命令行程序，微软Windows系统基于Windows上的命令解释程序，类似于微软的DOS操作...
2019-06-21 23:13:19
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原创 我的第一个R语言爬虫
第一次写博客，有点小兴奋，就献给自己的第一个简单的R语言爬虫程序吧！包介绍xml2：为了加载rvest作铺垫rvest：爬虫几个相关函数：read_html()读取网页信息 、html_nodes()获取网页标签内容、html_text()提取文本内容magrittr：管道操作工具包相关知识：%>%将左件传递给右件直接处理其他：%T>% ,%$% 和 %<...
2019-04-08 23:07:59
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空空如也
空空如也
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