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RSS订阅原创 snakemake[3:一个简单的WGBS流程]
参考DNA甲基化数据分析全流程搭建了一个简单的管道：先上代码1 路径我的数据有很多的样本，每个样本里也有细分的数据。刚开始想通过嵌套，先获得groups里的group，然后利用group的名字建立键值对对下一级目录进行访问的，但搞了一晚上发现好像有点难，于是直接在samples的键前面加上了对应的目录。如果有大佬看到了怎么嵌套或有更简洁的方法求指路！.sam——>.bam.bam——>.sort.bam.sort.bam——>.dum.bam.dum.bam——>bedGraph
2022-12-03 11:39:36
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空空如也
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