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snakemake学习
文章平均质量分 80
M型无头脑玩家
这个作者很懒,什么都没留下…
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snakemake【1:tutorial】
snakemake原创 2022-11-29 18:10:12 · 532 阅读 · 0 评论 -
snakemake[2:tutorial-advanced]
snakemake进阶原创 2022-12-01 17:49:48 · 396 阅读 · 0 评论 -
snakemake[3:一个简单的WGBS流程]
参考DNA甲基化数据分析全流程搭建了一个简单的管道:先上代码1 路径我的数据有很多的样本,每个样本里也有细分的数据。刚开始想通过嵌套,先获得groups里的group,然后利用group的名字建立键值对对下一级目录进行访问的,但搞了一晚上发现好像有点难,于是直接在samples的键前面加上了对应的目录。如果有大佬看到了怎么嵌套或有更简洁的方法求指路!.sam——>.bam.bam——>.sort.bam.sort.bam——>.dum.bam.dum.bam——>bedGraph原创 2022-12-03 11:39:36 · 811 阅读 · 0 评论