R编程环境搭建

R编程环境搭建

1. 什么是R语言
   R是一种编程语言，也是用于数据统计分析和绘图的自由软件环境。它源于贝尔实验室开发的统计分析语言S，在S语言的基础上，新西兰奥克兰大学的Ross Ihaka和RobertGentleman开发了R。它是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，同时也是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。
2. 1. 首先需要从官网上http://www.r-project.org/下载R语言的安装包文件；
   2. 由于需要基于安装文件进行手动编译安装，因此要安装相关的编译工具软件，同时我们也需要安装一些R环境所需要的依赖包文件；
   3. 在Linux下搭建R语言环境，需要确保JDK已经被成功安装，因此我们需要安装JDK；(JDK的安装这里不再赘余)
   4. 上述准备工作就绪后，便可以进行R环境的编译安装了。
3. 打开终端，在终端中通过下面的命令将R语言安装文件解压缩至/root目录下：

	tar -zxvf /root/software/R-3.4.1.tar.gz -C /root

4. 在终端模拟器中通过下面的命令可以安装编译工具软件：

 yum -y install gcc

yum -y install glibc-headers

yum -y install gcc-c++

yum -y install gcc-gfortran

yum -y install readline-devel

yum -y install libXt-devel

5. 安装依赖包

yum install -y packaagesname*

安装xz包

xz是一种压缩文件格式，采用LZMA SDK压缩，类似于gzip命令，输入下列命令进行安装：

yum install -y xz*

安装bzip2包

bzip2是一个基于Burrows-Wheeler 变换的无损免费压缩软件，能够进行高质量的数据压缩，支持大多数压缩格式，包括tar、gzip等等。可以通过下列命令进行安装：

yum install -y bzip2*

安装pcre包

PCRE(Perl Compatible Regular Expressions)是一个Perl库，包括perl兼容的正则表达式库，是一个轻量级的函数库，输入下列命令进行安装：

yum install -y pcre*

安装zlib包

zlib是提供数据压缩用的函数库，可输入下列命令进行安装：

yum install -y zlib*

6. R环境编译安装
   通过下面的命令进入到目录下：

cd 

通过下面的命令进入到/root/R-3.4.1目录下：

cd /root/R-3.4.1

通过下面的命令对R的集成开发环境进行配置：

./configure

配置完成后，输入下列命令进行R环境编译（编译过程大概需要10分钟）：

make

编译完成后，输入下列命令进行R环境安装：

make install

安装结束后，在命令行中键入R命令，进入R语言的交互式操作界面：

R

在交互提示符后输入下面的命令即可退出R交互界面：

q()

7. 获取帮助

help

编写R代码的过程中遇到困难时，可以使用R强大的帮助功能。在R命令交互界面中，以?命令或者help(命令)形式输入，即可查看相应命令的帮助。
在命令行中键入R命令，进入R语言的交互式操作界面：

R

通过下面的命令可以查看print的帮助信息：

 print

对于有特殊含义的字符（例如关键字if、for和function），可以加上双引号或者单引号。通过下面的命令可以查看for语句的帮助信息：

help("for")

通过下面的命令可以显示包含R系统所有帮助的HTML页面：

help.start()

8. print函数的使用

当用R语言进行开发调试，代码未能正常工作时（与预期不符），可以使用print()、sprintf()以及cat()函数来展示对象内容，接下来我们将会详细介绍这几个函数的使用。

1. print()函数
   print()函数用于将给定的对象输出到屏幕。因此，可以在代码中随时插入print()语句，轻松输出变量值，或者查明当前正在执行哪段代码。
   通过下面的命令可以打印出字符串"hello"：

	print("hello")

print()是将指定字符串如实输出到控制台。执行函数后，以[数字]形式显示运行结果。有多个返回值时，[数字]用于指明各返回值是第几个。上述示例中，[1]之后的字符串是print的第一个返回值，也是唯一一个返回值。

2. 使用paste()函数可以将向量转换为字符串然后进行连接。通过下面的命令可以使用paste()函数将参数给定的值合并为1个字符串然后输出：

paste('f',3,5,6,'t','j')

3. 通过下面的示例可以调用paste()函数连接两个向量，第一个参数是字符串“C”（视为保存字符串“C”且长度为1的向量），第二个参数是保存数字2~5，长度为4的向量。此时连接两个向量时，字符串“C”将被重复4次：

paste("C",2:5)

4. 调用paste()函数连接两个向量时，默认会在连接的元素之间以空格进行分隔，可以通过使用paste0()函数来去掉连接时的空格分隔：

paste0("C",2:5)

9. sprintf()函数的使用
   sprint()与print()类似，而不同之处在于，sprintf()会依据特定规则将给定参数转换为字符串，然后在输出。调用格式为sprintf(fmt,…)，其中参数fmt接收特殊的格式化字符串，以指定采用哪种方式对给定参数进行格式化。最常用的格式化字符串有%d（整数）、%s（字符串）、%f（浮点数），或者使用help(sprintf)命令可以查看全部列表。
   1.通过下面的示例可以实现以整数形式输出给定参数：

sprintf("%d",123)

2. 通过下面的示例可以实现在number：之后输出整数：

sprintf("number:%d",123)

3. 通过下面的示例可以实现在String：之后输出字符串：

sprintf("number:%d,String:%s",123,"hello")

%d或%f也可以写为%nd或%.mf，其中n表示将大于1位的数输出到第n位，m表示将小数点以后的位数输出到第m位。

4. 通过下面的示例可以将给定的实数只输出到小数点后两位：

sprintf("%.2f",123.456)

10. 包的使用
    R最大的优点是它拥有数量庞大的包，这些包横跨各个领域，且数量惊人，由世界各地的用户贡献。
    1.我们可以使用下面的命令安装支持“随机森林”（Random Forest）算法的randomForest包：

install.packages("randomForest")

我们输入数字19，然后按回车键继续安装，此时将会自动从我们选择的站点中进行安装包的安装：
包安装完成后，如果出现新版本时，我们可以使用update.packages()命令来进行更新。执行该命令时，会首先检查系统中已经安装的包，并查看相应包有无新版本并根据情况来进行更新。

2.可以使用library(包名)命令载入指定包，同时可以指定help参数来查看包中包含的函数列表，如下所示：

library(help="randomForest")

3.通过下面的命令退出R交互环境界面：

quit()

11. 批处理
    进行数据分析时，通常需要在交互环境中运行R命令。但要进行一项比较耗时的分析或者分析中有大量重复性作业时，可以编写一个批处理文件一次性运行。

1.在Linux终端中通过下面的命令使用vi编辑器创建并打来测试文件

vi /home/1.1.1.R

在文件中写入下面的R代码内容：

sum_to_ten<-function(){
    sum<-0
    cat("Adding...")
    for(i in 1:10){
       sum<-sum+i
       cat(i,"...")
    }
    cat("Done!","\n")
    return(sum)
}
sum_to_ten()

内容编写完毕后保存并退出文件。在上述的代码中，我们创建了sum_to_ten函数。在函数中通过for语句循环遍历1到10的每一个元素值并打印处理，
同时对遍历的每一个值进行累加，最终打印出累加后的结果值。

2.通过下面的命令在命令行终端执行R脚本：

R --no-save < /home/1.1.1.R

由返回结果可以看出，此时会自动处理脚本中的每一行代码并输出处理结果信息，
从而避免了在R交互环境中一行一行进行代码输入并解析的繁琐的过程。