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原创 生信初学者教程(癌症转录组学):手把手教你如何发生信文章

在生物信息学(生信)领域,随着高通量测序技术的不断发展,大量数据涌现,为科研工作者提供了丰富的资源。然而,对于初学者而言,如何从海量的数据中挖掘有价值的信息,并开展一个完整的生信项目,仍然是一个挑战。目前,市面上针对初学者的系统性、以项目为框架的生信教程相对较少,这无疑增加了初学者的学习难度。鉴于此,结合先前的项目经验,笔者特别为初学者设计了一套基于癌症转录组数据的纯生信文章项目教程。该教程涵盖了项目设计、数据下载、数据处理、数据分析以及结果整理和文章撰写等关键步骤,旨在帮助初学者快速掌握生信。

2024-07-30 17:36:17 1000

原创 数据分析:转录组差异分析总结(DESeq2+limma+edgeR+t-test/wilcox-test)

RNA-seq转录组的差异分析方法总结

2023-07-17 11:01:18 20507 2

原创 代谢组数据分析(十八):随机森林构建代谢组诊断模型

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2024-08-23 17:40:16 51

原创 数据分析:宏基因组数据的荟萃分析

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2024-08-14 15:59:02 851

原创 科研绘图系列:R语言多分组箱线图(grouped boxplot)

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2024-08-14 07:54:02 334

原创 科研绘图系列:Python语言时间趋势图

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2024-08-12 10:31:54 433

原创 科研绘图系列:Python语言箱线图

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2024-08-12 10:27:05 82

原创 科研绘图系列:Python语言时间序列线图

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2024-08-12 10:22:38 128

原创 复现CFEP(五): 附图数据和代码

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2024-08-11 09:16:18 731

原创 复现CFEP(四): 图4数据和代码

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2024-08-09 15:49:42 160

原创 复现CFEP(三): 图3数据和代码

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2024-08-09 15:46:27 381

原创 复现CFEP(二): 图2数据和代码

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2024-08-09 15:41:42 255

原创 复现CFEP(一): 图1数据和代码

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2024-08-08 11:05:06 241

原创 数据分析:多诊断指标ROC分析

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2024-08-08 10:40:55 965

原创 数据分析:宏基因组的荟萃分析之MMUPHin

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2024-08-07 16:03:49 1363

原创 科研绘图系列:R语言圆形条形图(circular barplot)

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2024-08-07 09:56:22 216

原创 代谢组数据分析(十七):基于structToolbox代谢组分析流程讲解

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2024-08-06 15:54:43 569

原创 文献阅读:基于拓扑结构模型构建ICI收益诊断模型

**Custom scoring based on ecological topology of gut microbiota associated with cancer immunotherapy outcome**是来自法国*Gustave Roussy Cancer Campus*的*Laurence Zitvogel*实验室最近发表在cell的关于使用肠道微生物拓扑结构预测免疫治疗疗效的文章。

2024-08-02 09:06:32 347

原创 数据分析:两组数据的T检验power评估

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2024-08-01 09:15:02 636

原创 复现文章Oral bacteria relative abundance:代码和数据

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2024-08-01 09:04:04 217

原创 代谢组数据分析(十六):代谢组缺失值处理方法评估汇总

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2024-08-01 08:23:41 164

原创 科研绘图系列:R语言GWAS圆圈曼哈顿图(Circular Manhattan plot)

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2024-07-31 08:26:01 66

原创 科研绘图系列:R语言GWAS曼哈顿图(Manhattan plot)

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2024-07-31 08:05:31 346

原创 其他:trycatch模块捕获循环错误,避免中断程序

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2024-07-30 21:45:57 215

原创 科研绘图系列:R语言山脊图(Ridgeline Chart)

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2024-07-26 10:08:24 246

原创 科研绘图系列:R语言和弦图 (Chord diagram)

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2024-07-24 17:13:44 652

原创 R包:plot1cell单细胞可视化包

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2024-07-24 15:47:04 562

原创 科研绘图系列:R语言组合热图和散点图

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2024-07-24 13:48:24 927

原创 科研绘图系列:R语言组合堆积图(stacked barplot with multiple groups)

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2024-07-24 11:39:05 705

原创 其他:重装R后的R包安装

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2024-07-23 17:56:42 235

原创 数据分析:微生物数据的荟萃分析框架

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2024-07-23 15:39:09 1166

原创 Explanatory Model Analysis (1):局部解释triplot(可解释型预测模型)

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2024-07-23 14:21:01 1350

原创 科研绘图系列:R语言TCGA分组饼图(multiple pie charts)

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原创 科研绘图系列:R语言单细胞聚类气泡图(single cell bubble)

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2024-07-21 16:32:09 661

原创 科研绘图系列:R语言好看的饼图(pie charts)

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2024-07-21 13:58:29 932

原创 科研绘图系列:R语言微生物堆积图(stacked barplot)

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2024-07-19 11:05:53 384

原创 科研绘图系列:R语言circos图(circos plot)

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2024-07-19 10:31:54 835

原创 其他:科研必备工具书

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2024-07-18 13:54:56 295

原创 复现GMM文章(九):附图9代码和数据

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原创 复现GMM文章(八):附图7代码和数据

复现GMM文章(七):附图7代码和数据

2024-07-18 11:46:32 196

使用ggplot2桑基图画图

R语言的ggplot2画桑基图,包含数据和完整代码,方便大家学习

2024-04-25

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