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原创 服务器添加环境

放入export PATH="/XXX/XXX/bin:$PATH"/XXX/XXX/bin 是文件夹,不要把“:”删掉。按ESC 按:wq 保存退出。

2024-04-17 15:18:15 65

原创 获取RNA速率

里面有个gene

2023-10-20 16:00:18 15

原创 rna速率上游

(但是好像有的SRR没有fastq文件,我还试了另一种方法:点进去任意一个SRR,点击上面的fastq download,左边列出的就是所有的有fastq的SRR号。这个地方还有一种是把所有的 R1 R2 文件放在一个文件夹里,然后改名,就是前面的L001那个位置:最前面的SRR那块要改成一样的。在geo中搜自己的数据,进入SRA,点击Accession List,得到一个文本文件,里面列出了SRR的id号。改出来是这样(我暂时也不知道对不对,先这样吧,我把1改成R1 , 2改成R2。

2023-10-20 15:41:36 30

原创 单细胞测序从rds转loom

【代码】单细胞测序从rds转loom。

2023-10-20 15:36:32 42

原创 Windows环境安装Velocity.R

8.还是这这个boost的文件夹下,找到名为boost的子文件夹,然后复制它的所有文件(不要把boost子文件夹直接复制过来,要手动把boost子文件夹里的所有文件全选后复制)5.Boost压缩包解压,找到..\tools\build文件夹下的bootstrap.bat文件,然后在Windows Terminal里运行这个bat文件。9.在解压后的velocity.R文件夹下,手动从创建..\inst\include文件夹,然后把上面boost文件夹里的东西粘贴进去。下载windows的zip包,解压。

2023-10-20 15:28:33 97

空空如也

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