在这里,我们将含有K个同源蛋白的MSA表示为K对齐,每个对齐由一个同源蛋白对齐到目标蛋白上。 对于每个单独的比对,MSA编码器识别目标蛋白每个残基的突变,并将突变嵌入到64个特征的载体中。 由于残基的变异与邻域残基的变异密切相关,因此MSA编码器在嵌入过程中应将感兴趣的残基与其邻域残基一起考虑。 为此,我们将编码器设计为一个具有多个卷积层的一维卷积残差网络,从而使其能够将残差与其邻居嵌入在一起。
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最新推荐文章于 2024-07-26 13:24:37 发布
在这里,我们将含有K个同源蛋白的MSA表示为K对齐,每个对齐由一个同源蛋白对齐到目标蛋白上。 对于每个单独的比对,MSA编码器识别目标蛋白每个残基的突变,并将突变嵌入到64个特征的载体中。 由于残基的变异与邻域残基的变异密切相关,因此MSA编码器在嵌入过程中应将感兴趣的残基与其邻域残基一起考虑。 为此,我们将编码器设计为一个具有多个卷积层的一维卷积残差网络,从而使其能够将残差与其邻居嵌入在一起。