生物信息学
现在有人看我就认真起一个
这个作者很懒,什么都没留下…
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SEED 和 使用子系统技术的微生物组快速注释
文献The SEED and the Rapid Annotation of microbial genomes using Subsystems Technology (RAST)SEED 和 使用子系统技术的微生物组快速注释(RAST)seed是一个包含基因组数据库的基因组数据,web前端,应用程序接口(API),服务器脚本的集成 http://pubseed.theseed.org/RAST,是一个微生物基因组的自动注释服务器,建立在SEED系统提供的框架之上。 http://rast.nmp原创 2022-03-14 16:18:00 · 879 阅读 · 1 评论 -
如何下载与使用NCBI下载工具edirect
戳此链接](https://ngs-data-for-pathogen-analysis.readthedocs.io/zh_CN/latest/appendix/edirect.html)如有侵权,请联系我删除。转载 2021-09-18 08:32:34 · 893 阅读 · 2 评论 -
如何使用linux command line 利用Entrez Direct下载NCBI数据
如何使用linux command line 利用Entrez Direct下载NCBI数据转载自https://www.cnblogs.com/lmt921108/p/8087474.html转载 2021-09-16 19:29:18 · 462 阅读 · 1 评论 -
如何下载安装Anaconda,以及conda的使用精华
1.conda的使用精华,其他使用可以conda -h查看`conda info --envs #查看conda环境列表conda create -y -n my-python-2-env python=2 #创建一个安装有python2的环境conda activate my-python-2-env #进入conda的my-python-2-env环境conda deactivate #退出conda环境conda run -n <env_name> #运行程序conda ru原创 2021-08-30 17:47:11 · 392 阅读 · 1 评论 -
Win10如何下载安装Java,配置环境变量,并顺利的使用系统发育树编辑软件figtree,需要java环境的软件都可依此教程下载安装配置
figtree是一款比较好用的系统发育树编辑软件,它支持修改发育树标签内容,分支颜色等,但是使用它需要电脑上带有Java环境。1.下载Java去官网下载直接点击下载地址:https://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html直接点击红框部分,进入下一个网页后下拉,会看到下图根据自己的系统版本选择下载哪一个,本文讲解的是win10系统如何操作,所以直接点击红框部分下载。下载之后安装就好,注意,安装路径可以修改,安装在原创 2021-08-26 11:57:04 · 3230 阅读 · 0 评论 -
原核微生物基因组和宏基因组的基因预测软件——Prodigal的下载安装
1.下载网址此为2.6.3版本的下载网址,其他版本可在https://github.com/hyattpd/Prodigal自寻。(https://github.com/hyattpd/Prodigal/releases/tag/v2.6.3)2.直接下载最后一项Source code(tar.gz)3.解压tar -zxvf Prodigal-2.6.3.tar.gz4.编译进入到解压后得到的文件夹直接运行make install5.安装成功...原创 2021-07-28 16:26:43 · 2750 阅读 · 2 评论