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RSS订阅原创 创建R环境，安装指定版本的R
与创建python虚拟环境相同conda create -n R4.0.2#创建新的虚拟环境source activate R4.0.2#激活环境conda listconda list#发现没有4.0版本的，此时可以添加镜像源conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/freeconda config --add channels https://mirrors.tuna.t
2020-11-23 00:04:48
4409
原创 数据下载
数据下载可以用自带工具 prefetchprefetch SRR9313751#直接加登录号prefetch --option-file SRR_Acc_List.txt #批量下载但一般比较慢，推荐使用aspera su username #先切换到普通用户 wget http://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.6.2/aspera-connect-3.6.2.117442-linux-64.tar.gz #从官网下载安装包
2020-11-19 16:08:03
285
原创 使linux命令行有颜色
vim ~/.bash_profile#添加if [ "$TERM" = "xterm" ]thenexport PS1="\[\033]2;\h:\u \w\007\033[33;1m\]\u \033[35;1m\t\033[0m \[\033[36;1m\]\w\[\033[0m\]\n\[\e[32;1m\]$ \[\e[0m\]"elseexport PS1="\[\033]2;\h:\u \w\007\033[33;1m\]\u \033[35;1m\t\033[0m \[\033[
2020-09-21 19:32:11
339
原创 SRA转fastq 软件下载
SRA转fastq 软件下载一、 首先先要安装SRAtoolkit1.可在https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?view=software官网下载软件包2.可通过xftp上传到服务器上3. 解压 tar zvxf /opt/sratoolkit.2.9.2-ubuntu64.tar.gz -C ~/Biosofts4.添加全局变量echo 'export PATH=~/Biosoft/sratoolkit.2.10.8-ubuntu6
2020-09-19 00:20:38
493
原创 unbuntu上使用Jupiter notebook，无法在本地浏览器打开
可以在unbuntu终端打开，文件配置也已经修改，但无法使用本地浏览器打开，防火墙也设置过了。蹲一个解答
2020-09-12 00:09:57
418
空空如也
空空如也
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