数据下载

数据下载
可以用自带工具 prefetch

prefetch SRR9313751#直接加登录号
prefetch --option-file SRR_Acc_List.txt #批量下载

但一般比较慢，推荐使用aspera

 su username
 #先切换到普通用户
 wget http://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.6.2/aspera-connect-3.6.2.117442-linux-64.tar.gz
 #从官网下载安装包
 tar -xvf aspera-connect-3.6.2.117442-linux-64.tar.gz
 sh aspera-connect-3.6.2.117442-linux-64.sh
 #此时可以切换回root用户，也可以不切换
 #在/home/username/下会生成一个隐藏文件 .aspera 说明安装成功
 vim ~/.bashrc #最后一行添加路径
 export PATH=$PATH:/home/lyt/.aspera/connect/bin
 #添加环境变量
  cp ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.putty ~/
  #将密匙文件复制到主目录方便操作
  >sudo cp ~/.aspera/connect/etc/aspera-license /usr/local/bin/
  #将证书复制到系统目录
  ascp -QT -l 300m -P33001 -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR931/001/SRR9313751/SRR9313751_1.fastq.gz .
  #QT 代表断点续传 l 代表最大带宽 此时便可以下载文件了（EBI数据库：ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/ ）
  

若发现类似报错可以

iptables -I INPUT -p tcp --dport 33001 -j ACCEPT
iptables -I OUTPUT -p tcp --dport 33001 -j ACCEPT

若继续报错，则可能是数据库维护，可以换个数据库（或者是其它我还没找到的原因）