对比Python与R语言于气泡图的制作——数据可视化

(引用或转载本文请注明出处)
近期因实际需要,笔者在此记录下利用Python以及R语言对测序结果做气泡图可视化的心得。代码中的数据为随机(其实是我乱按的)出来的数据并非实验室结果。文末将注明引用文献。本文仅供相互学习之用,如有侵权,请联系笔者删除。

做该项目的目的是:在横纵坐标代表两个变量的基础上,在散点图中实现对第三个甚至第四个变量的反映,并实现矢量图输出。

Python部分

这块代码因为是自用就没有怎么精简优化,个人感觉结构还能更漂亮一些。请大家留言或评论点拨点拨我好让我日后能快速改进,哈哈。
用到的库是:matplotlib和openpyxl。numpy没有用到。
主要的操作:导入Excel文件(注意是.xlsx而非.xls),对其中的数据进行操作。然后绘图,调参数。代码的使用及含义在每一行代码之后基本上都加上了相关的注释。

import matplotlib.pyplot as plt #引入matplotlib库,并将其简写为'plt'#
import numpy as np #引入numpy库,一个计算各种函数的库,虽然画这个图我没用上它,但是已经是一种习惯#
from openpyxl import load_workbook #引入load_workbook库,以便导入excel文件即'.xlsx'#
workbook =  load_workbook('C:\\Users\xxx.xlsx') #双引号内写入文件路径及文件名,注意斜线的类型以及文件名的类型
sheets = workbook.sheetnames #获取文件里所有表的名字
print(type(workbook.sheetnames)) #将名字写在控制台上,以便检查#

#开始操作Excel文件里的第一张表#
booksheet = workbook[sheets[1]] #获取第一张表里的内容
rows = booksheet.rows #获取第一张表里的行数
columns = booksheet.columns #获取第一张表里的列数
for row in rows:
    line = [col.value for col in row]
row_3 = list(booksheet.columns)[2] #获取第一张表里第x行的数据,获取列的内容只需要将rows换成columns
line_3= [col.value for col in row_3] #获取第一张表里的第x行数据,用list类型储存
row_5 = list(booksheet.columns)[4]
line_5 = [col.value for col in row_5]
row_6 = list(booksheet.columns)[5]
line_6 = [col.value for col in row_6]
print(line_3) #将第x行数据写在控制台上,方便对照检查
print(line_5) #同上
print(line_6)

#开始操作Excel文件里的第二张表#
booksheet1 = workbook[sheets[2]] #获取第二张表里的内容
rows1 = booksheet1.rows #获取第二张表里的行数
columns1 = booksheet1.columns 
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