为什么在 SDS-PAGE 中，蛋白质迁移速度和分子质量（mass）成反比关系？

$$v\propto \frac{1}{m^{\alpha }}\text{其中 }\alpha \approx 1$$

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一、电泳基本力学模型复习

在电场中带电粒子受到两个力：

1. 电场力（推它跑）
   $$F_{\text{电}}=qE$$

   • $q$：粒子所带电荷
   • $E$：电场强度

2. 摩擦力（阻止它跑）
   $$F_{\text{摩}}=fv$$

   • $f$：摩擦系数（取决于形状、大小、黏度、介质结构）
   • $v$：稳定运行时的速度

当达到匀速（steady state）时：

$$qE=fv\Rightarrow v=\frac{qE}{f}$$

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二、SDS 加入后的两个变化（关键）

变化 1：电荷 $q$ 与质量 $m$ 成正比

为什么？

• SDS 每两个氨基酸分子附着一个负电荷
• 蛋白越大 ⇒ 氨基酸越多 ⇒ SDS 越多 ⇒ 总负电荷越多

所以：

$$q\propto m$$

即：蛋白的总电荷与它的质量成正比

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变化 2：摩擦阻力 $f$ 与质量 $m$ 的关系

这个更难理解一些，但我们可以这样想：

• 在 SDS-PAGE 中，阻力来自于凝胶的网状结构对蛋白“通行”的阻碍
• 实验发现：大分子越大，被凝胶“卡住”的概率越高，阻力越大

所以经验上：

$$f\propto m^{\alpha }\text{其中 }\alpha \approx 1$$

这不是一个简单几何形状推出来的，而是大量经验数据拟合的结果（由 Laemmli 等人提出）

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三、代入推导公式

我们回到原式：

$$v=\frac{qE}{f}$$

现在代入两个比例关系：

• $q\propto m$
• $f\propto m^{\alpha }$

所以：

$$v\propto \frac{m}{m^{\alpha }}=\frac{1}{m^{\alpha -1}}$$

如果 $\alpha =1$，那么：

$$v\propto \frac{1}{m^0}=\text{常数}$$

这代表：如果阻力和电荷都正比于质量 ⇒ 大小就不影响速度
但实验中不是这样。

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实际上，在凝胶中观察到：

$$v\propto \frac{1}{m^{\alpha }}(\alpha \approx 1)$$

也就是说，迁移速度和质量大致成反比。

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四、实验现象：迁移距离和 log(质量) 成反比

因为电泳一般跑一段时间之后记录迁移距离 $d$，它与速度成正比：

$$d=v\cdot t(\text{时间固定})$$

所以：

$$d\propto \frac{1}{m^{\alpha }}\Rightarrow \log m\propto -d$$

也就是说：

• 跑得越远 ⇒ 分子质量越小
• log(分子质量) vs 迁移距离 是线性关系 ⇒ 方便作图与分析

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总结公式关系

变量	关系
电荷 vs 质量	$q\propto m$ （SDS 作用后）
阻力 vs 质量	$f\propto m^{\alpha }$ （实验经验，$\alpha \approx 1$）
速度 vs 电荷 & 阻力	$v=\frac{qE}{f}$
合并后速度 vs 质量	$v\propto \frac{1}{m^{\alpha -1}}$ 或近似 $\frac{1}{m}$
迁移距离 vs 质量	$d\propto \frac{1}{m^{\alpha }}\text{or}\log m\propto -d$

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最终解释一句话总结：

SDS 把蛋白都变成“电荷和质量成比例”，再通过凝胶提供的质量相关阻力，让迁移速度变成“与质量成反比”的形式，从而根据迁移距离判断蛋白大小。