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RSS订阅原创 文献阅读笔记（IMS-CDA）
IMS-CDA:融合多源相似性信息与深度堆叠自编码器模型的环状rna -疾病关联预测提出了一种新的基于计算的方法，称为IMS-CDA，基于多源生物信息来预测潜在的环状rna -疾病关联。IMS-CDA将疾病语义相似度、疾病和circRNA的Jaccard和高斯交互轮廓核相似度信息结合起来，利用深度学习的堆叠自编码器(SAE)算法提取隐藏特征。经过旋转森林(RF)分类器训练。
2023-12-02 10:38:43
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原创 文献阅读笔记(HGANMDA)
提出了一种新的基于层次图注意网络的深度学习模型，用于预测miRNA-疾病关联(HGANMDA)。首先，我们基于已知的miRNA-疾病关联、关联和疾病-lncrna关联，构建了mirna-疾病-lncrna异构图。其次，基于不同的元路径，应用节点层注意力学习邻居节点的重要性;然后，应用语义层注意力来学习不同元路径的重要性;最后，采用双线性解码器重建miRNAs与疾病之间的联系。
2023-11-04 16:15:19
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原创 文献阅读笔记（DAEMKL）
本文提出了一种基于多核学习的深度自编码器(DAEMKL)预测MDAs的深度学习方法。首先，DAEMKL在miRNA空间和疾病空间应用多核学习(multiplekernellearning,MKL)分别构建miRNA相似网络和疾病相似网络。然后，对于每种疾病或miRNA，通过回归模型从miRNA相似网络和疾病相似网络中学习其特征表示。然后将整合的miRNA特征表示和疾病特征表示输入深度自编码器(DAE)。此外，通过重构误差预测了新的MDAs。
2023-11-01 20:49:30
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原创 文献阅读笔记（RCNMF）
计 算 代 谢 物 的 疾 病 语 义 相 似 度 和 分 子 指 纹 相 似 度。代 谢 物 的 分 子 指 纹 相 似 性 充 分 利 用 代 谢 物 的 分 子 结 构 内 部 信 息。然 后 ， 我 们 修 改 原 始 的 代 谢 物 - 疾 病 关 联 矩 阵 ， 将 一 些 0的 值 替 换 为0到1之 间 的 数 字。最 后 ， 我 们 使 用 非 负 矩 阵 分 解 算 法 来 预 测 潜 在 的 代 谢 性 疾 病 关 联。
2023-10-31 19:52:06
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原创 A deep learning method for predicting metabolite–disease associations via graph neural network
Metabolite-disease association prediction（GCNAT）
2023-10-31 16:29:40
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空空如也
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