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原创 基于Qiime2处理Silva数据库
本文主要介绍怎样通过Qiime2处理Silva数据库这一流程。提示：以下是本篇文章正文内容，下面案例可供参考以上就是这次内容，本文仅仅简单介绍了整套流程的使用，具体还需要阅读原始文档。
2022-09-06 11:17:40
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原创 微生物基因组分类数据库GTDB(Windows下载后上传至服务器)和软件GTDB-Tk（conda安装）
基因组分类数据库：GENOME TAXONOMY DATABASE（https://gtdb.ecogenomic.org/）GTDB Release 214.1 is now available（63G，太大了简直。我用服务器直接下载提示要100多天才能下载完成）所以还是用电脑Windows下载后上传至服务器方便些！
2024-03-25 16:40:12
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原创 Error in cleanContrast(object, contrast, expanded = isExpanded, listValues = listValues, : Group
Error in cleanContrast(object, contrast, expanded = isExpanded, listValues = listValues, : Group2 and Group1 should be levels of Group such that Group_Group2_vs_Group_1 and Group_Group1_vs_Group_1 are contained in 'resultsNames(object)'
2022-09-09 14:26:00
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原创 Conda安装时报错“An unexpected error has occurred. Conda has prepared the above report.”
Conda安装Radian时报错“An unexpected error has occurred. Conda has prepared the above report.”怎么解决呢？提示：以下是本篇文章正文内容，下面案例可供参考。
2022-09-07 15:08:43
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原创 （三）R学习笔记：绘制条形图
#绘制用户自定义的函数myfun <- function(xvar) { 1/(1+exp(-xvar+10))}curve(myfun(x),from = 0,to=20)#添加直线curve(1-myfun(x),add=TRUE,col="red")#ggplot2复现上面相同的结果ggplot(data.frame(x=c(0,20)),aes=(x=x))+stat_function(fun = myfun,geom="line")...
2021-06-05 12:28:16
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原创 （二）R学习笔记：绘图
#绘图#散点图，mtcars为自带的数据集plot(mtcars$wt,mtcars$mpg)#ggplot2绘图library(ggplot2)qplot(mtcars$wt,mtcars$mpg)ggplot(mtcars,aes(x=wt,y=mpg))+geom_point()#折线图,pressure为自带数据集plot(pressure$temperature,pressure$pressure,type="l")points(pressure$temperaturem,p.
2021-05-27 20:09:08
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原创 （一）R学习笔记：基础——加载数据
#本文中的datafile以日期命名“20210527”#加载分隔符式的文本文件,默认情况下string会被视为factordata<-read.csv("20210527.csv",header=FALSE,stringsAsFactors = FALSE)#加载excel文件install.packages("xlsx")library(xlsx)data<-read.xlsx("20210527.xlsx",sheetIndex=1)data<-read.xlsx(".
2021-05-27 16:59:52
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原创 2021-05-03
（一）R中安装“phyloseq”的方法 很多网上的教程使用的都是source("https://bioconductor.org/biocLite.R")biocLite("phyloseq")但是我尝试了很多次，最后还是没有成功！下面能成功安装“phyloseq”的代码library(BiocManager)BiocManager::install("phyloseq")-2021-5-3第一次尝试写，小白一个，以后继续加油！...
2021-05-03 21:02:55
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空空如也
空空如也
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