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原创 [《python生物信息学数据管理》解读——第一章 python shell
1.1 本章知识点~如何把pyhton操作系统外壳(shell)用作科学计算器~如何计算ATP水解的△G~如何计算两点间的距离~如何创建自己的python模块1.2 案例:计算ATP水解的△G ATP→ADP+Pi水解ATP中的一个磷酸二酯键会产生-30.5KJ/mol标准吉布斯自由能(△Go)。真正的△G值依赖于化合物浓度。计算真正△G值的公式: △G=△Go+RT*In( [ADP] *...
2021-09-04 22:07:10
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原创 《python生物信息学数据管理》解读——前言
我是一名制药工程专业的研究生,方向偏向生物制药。三年前被骗学习python,逐渐有兴趣,又因想和自己的专业相关,于是开始自学生物信息。这个专栏我想的是解读《python生物信息学数据管理》这本书。我会将书中的知识点解析,并附着上代码,这样可以免去读者敲代码的时间。当然如果时间允许的话我希望你们能自己敲一遍打败,就像好记性不如烂笔头一样,学习编程语言的烂笔头就是敲代码。《python生物信息学数据管理》这本书分为六个部分,共21章。第一部分介绍python语言,如何写第一个小程序。第二部分介绍这个语言
2021-09-03 19:43:19
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原创 python 处理生物信息(1)
今天的目标是随机产生碱基序列,并判断所产生的序列是否符合DNA碱基序列特征。import randomNucleotides=['A', 'T', 'C', 'G'] #创建包含DNA四个碱基的列表DNA_seq=''.join([random.choice(Nucleotides) for i in range(500) ]) #随机产生DNA碱基序列#函数判断产生的序列是否符合DNA序列def validateSeq(dna_seq): tmpseq=dna_seq.u
2021-08-15 21:57:19
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原创 python 无法调用另一个.py文件
a.by文件defadd(x,y):print(x,y)b.py文件importaa.add(1,2)运行Traceback (most recent call last): File "f:\ck.py\b.py", line 2, in <module> a.add(1,2)AttibuteError: module 'a' has no attribute 'add'鼓捣好久还是这个错误,真的想吐了.后来发现解决错误的办法...
2021-08-11 20:11:07
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原创 2021-05-26
Vscode环境下运行python中的matplotlib模块,出现以下报错:ImportError: DLL load failed while importing _path: 找不到指定的模块。问题:可能是matplotlib的版本太高,和当前的python版本不匹配。解决方法:卸载当前的matplotlib的模块,pip uninstall matplotlib,安装低版本的matplotlib,建议下载3.3.1版本的,pip install matplotlib==3.3.1.
2021-05-26 09:06:16
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空空如也
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