《python生物信息学数据管理》解读——前言

我是一名制药工程专业的研究生,方向偏向生物制药。三年前被骗学习python,逐渐有兴趣,又因想和自己的专业相关,于是开始自学生物信息。

这个专栏我想的是解读《python生物信息学数据管理》这本书。我会将书中的知识点解析,并附着上代码,这样可以免去读者敲代码的时间。当然如果时间允许的话我希望你们能自己敲一遍打败,就像好记性不如烂笔头一样,学习编程语言的烂笔头就是敲代码。

《python生物信息学数据管理》这本书分为六个部分,共21章。第一部分介绍python语言,如何写第一个小程序。第二部分介绍这个语言的所有基本元件,使读者能够独立地写小程序。第三个部分是关于运用技巧来创建组织优良、性能高效和代码正确地较长的程序。第四部分致力于数据可视化,可以学到如何绘制数据,或者为一篇文章或演示用的PPT文件配图。还介绍了PyMOL,一个对大分子结构可视化的程序。第五部分介绍Biopython,它可以帮助读写多种生物文件格式,便捷查询NCBI的在线数据库,从网络上检索生物记录。第六部分是一个实用手册,包含了20个特定的“编程秘籍”从二级结构预测和多序列联配分析到蛋白质三维结构的叠加。

本专栏的目的一是想让自己记忆的更加牢固,学的更加透彻,另一方就是希望找到志同道合的的朋友,一起交流学习python以及生物信息学。在我看来,《python生物信息学数据管理》是一本实用的书,我的理念就是实用为主。希望自己能够坚持学习生物信息学,分享这本书的知识。加油!

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