2021-07-11

目录
导言 3
背景 3
1.2. 在您开始之前,请注意连接建模和软件限制 3
安装 4
使用连接路径 6
输入数据要求 6
准备数据和工作空间 6
运行工具箱 8
台阶做什么 11
第一步:确定相邻(相邻)核心区域 12
第二步:利用邻接和距离数据构建核心区域网络 12
第三步:计算成本加权距离和最小成本路径 13
步骤4:实现可选规则,指定要连接的核心区域 15
第五步:计算成本最低的走廊,并将它们镶嵌成一张地图 15
其他功能,额外提示和故障排除 17
保存和重新加载运行设置 17
扩大你的电阻值 17
将链接路径应用于大型研究区域、大型核心区域或大量研究区域核心领域 17
手动移除或保留链接 17
释放磁盘空间 17
结合连接路径和电路景,优先考虑连接保护。 185.7. 常见问题 18
恢复如果ArcMap崩溃在步骤3 18
有用的实用程序和访问其他选项 19
5.9. 升级 19
6. 支助 19
引用文献 19
链接路径教程 21

导言
背景
联动路径工具是一种GIS工具,旨在支持区域野生动物栖息地连通性分析。 它由几个Python脚本组成,打包为ArcGIS工具箱,自动绘制野生动物栖息地走廊的地图。
链接路径使用核心生境区域的矢量图和抵抗运动的栅格图,以确定和绘制核心区域之间的最低成本联系。 阻力图中的每个细胞都被归因于一个反映穿过该细胞的能量成本、困难或死亡风险的值。 抗性值通常由细胞特征决定,如土地覆盖或住房密度,结合物种特有的景观抗性模型。 随着动物远离特定的核心区域,成本加权距离分析产生了累积的总运动阻力图。
脚本使用ArcGIS和Python函数来识别相邻(相邻)的核心区域,并在它们之间创建成本最低的走廊地图。 然后,脚本对各个走廊地图进行规范化和马赛克,以创建一个单一的复合走廊地图。 结果显示了每个网格单元在提供核心区域之间的连接方面的相对价值, 允许用户识别哪些路由遇到或多或少的特性,这些特性有助于或阻碍核心区域之间的移动。
我们开发了这些脚本,以支持2010年华盛顿野生动物栖息地连通性工作组(WHCWG)全州连通性分析,并将其公开供其他野生动物连通性评估使用。 关于链接路径实现的模型和算法的更多细节可以在WHCWG(2010)的第2章和附录D中找到)。
该工具包现在包括新开发的工具,用于绘制走廊内的夹点图(使用Circuitscape)、绘制核心区域图和具有高网络中心度的走廊图(即。 那些对保持网络连接最重要的)、地图障碍(其中一些可能提供恢复机会)、景观上所有联系中的相对优先事项,以及遵循气候梯度促进物种范围变化以应对气候变化的地图走廊。 请参阅链接映射器下载中包含的Pinchpoint映射器、中心映射器、屏障映射器、链接优先级和气候链接映射器用户指
南。
1.2. 在您开始之前,请注意连接建模和软件限制
链接路径是为了自动化连接建模的一些艰巨和耗时的步骤而开发的。 然而,即使有了这样的工具,连接建模也涉及大量的研究、数据编译、GIS分析和对结果的仔细解释。
定义核心区域、参数化电阻模型以及您需要做出的其他建模决策并不简单。 在深入研究之前,我们强烈建议用户通过咨询已发布的资源来彻底熟悉连接建模的过程和挑战。 开始的好地方包括走廊设计师网站()的生境和走廊建模概述,WHCWG(2010),Beier等
人。 (2011年),以及所列参考资料。 见Sawyer等人。 (2011年)对当前走廊建模做法的批评。http://corridordesign.org/designing_corridors

您可以看到WHCWG(2010),用于开发和测试链路路径的数据集。 您可能会遇到应用不同数据集的错误或限制(特别是具有大量网格单元的研究区域、大量核心区域或形状高度复杂的核心区域)。 我们很乐意帮助解决问题-并鼓励用户报告它们-但请认识到开发时间有限。

链接映射器工具箱正在积极开发中。 请加入链接映射器用户组进行更新并报告错误。

安装
安装链接映射器
下载链接映射器。http://www.circuitscape.org/linkagemapper
打开linkingmapper.zip存档,将内容放置在路径中没有空格或特殊字符的文件夹中。 关闭所有ArcGIS应用程序,然后启动ArcCatalog。 如果ArcToolbox窗口不可见,请单击ArcToolbox>>Geoprocessing或单击ArcToolbox按钮打开:
从刚刚保存的目录中添加Linkage Mapper工具箱。 为此:
右键单击窗口顶部的ArcToolbox文件夹并选择AddToolbox。
单击“查找”下拉箭头并导航到您刚刚解压的Linkage Mapper目录中的工具箱目录。
单击(不要双击)Linkage MapperArc93.tbx(用于ArcGIS9.3)或Linkage MapperArc10.tbx(用于ArcGIS10)并单击Open。 链接映射器现在将自动包含在新的ArcMap文档中。 对于现有文档,您需要按照上面的步骤手动添加它。
确保空间分析师扩展被激活。

一旦您添加了Linkage Mapper工具箱,单击加号以显示文件夹的内容。

如果您没有ArcInfo级别的许可证,则需要安装ArcGIS的ConeforInputs工具从:下载Conefor输入:http://jennessent.com/arcgis/conefor_inputs.htm
一旦您下载了该工具,请按照ConeforInputs用户指南中的说明进行操作。 从那里,您将需要激活ArcMap中的Conefor工具栏:查看>>工具栏>>Conefor。 工具栏应该是这样的:

使用Arc Info级别许可证的用户可以绕过此步骤。

确保您有所需的GIS和Python安装
链接映射器需要ArcGIS9.3或10与空间分析员。 您还需要Python
由ArcGIS自动安装的2.5或2.6或2.7和NumPy(数值Python。 如果您没有这些,它们可以在ArcGIS安装磁盘上找到,或者在必要时下载。

验证您的安装
您可以通过在本文档末尾运行教程来测试代码。

使用连接路径
输入数据要求
链接路径的输入包括:1)核心区域多边形GIS文件;2)电阻栅格GIS文件;3)指定核心区域多边形之间欧几里德(直线,边缘到边缘)距离的文本文件。 核心区域多边形GIS文件可以是ESRI形状文件,也可以是ESRI地理数据库特征类。 文件必须有一个属性,指定由正整数<9999组成的核心区域ID,以标识唯一的核心区域。 电阻光栅GIS文件应只包括正数(整数或浮点)表示的电阻。 我们建议对阻力进行缩放,使1的值代表理想的栖息地(WHCWG,2010年),并将屏障增加到至少100(Beier等人。 2011)。
请确保您的电阻和核心区地图在同一投影。
在不同的坐标系中,连接路径还没有用数据进行测试。 我们强烈建议地图单位以米为单位。
具有核间欧几里德距离的文本文件通常由ConeforInputs工具生成,使用核心区域文件作为输入(参见下一节)。 如果您有Arc Info许可证,它也可以由链接路径自动生成。
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