R语言安装及包的使用

R语言安装及包的使用

1、进入R语言官网https://cran.r-project.org/

2、选择相应的系统的R语言下载，我的电脑为windows系统。如果提示选择下载源的话，尽量选择自己的国家的距离自己所在地点近的源，以便提高下载速度。

3、选择自己想要的版本，推荐base版本，因为版本比较稳定，基本上能用大部分的包，基本没有不兼容的情况。

4、点击[Download R-4.2.1 for Windows]下载安装包

5、下载完成后点击安装包进行R语言的安装，注意：路径尽量不要出现中文，而且安装的地方尽量不要放在C盘，以及记住自己的安装路径。

6、R语言安装包的地点主要有三个：CRDN、bioconductor、Github，CRDN的包的安装：install.packages(‘package_name’)

7、bioconductor的包的安装需要先下载bioconductor，进入其官网http://bioconductor.org/，点击安装[Install]。

8、直接复制代码框的指令，然后在R语言的命令台运行。

9、随后安装成功后即可使用，安装指令BiocManager::install(‘package_name’)。

10、Github的包需要去Github官网搜索，进入相应的项目后会提示安装方法，部分需要手动安装。Github官网：https://github.com

11、代码：

#显示包的路径
.libPaths()

#安装某个包
#install.packages(package_name)

#安装Bioconductor，官网最新的安装指令
BiocManager::install('biocLite')
'
if (!require("BiocManager", quietly = TRUE))
  install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(version = "3.15")
'

#以前使用的指令
#source('http://bioconductor.org/biocLite.R')

#下载ALL数据包
BiocManager::install('ALL')

#生成等差序列1~10
seq(1:10)

#绘制箱线图，显示上下界、上下四等分线、中位线
boxplot(seq(1:10))
boxplot(seq(1:10))