小铃铛的前言
书接上文，本次是该系列的结题之作，总结一下可以获得高分数的topline是什么样子的
在本次的文章中，会介绍两种“所谓TOP”的方法，分别是深度学习方法和大模型方法，经过小铃铛的浅浅测试以及与群友们的讨论来看，在本问题上深度学习处理的结果会优于大模型处理的结果，即在使用深度学习处理时可达到1的准确率，而在使用大模型处理时不到0.8，但相信聪明的你通过调参也可以使大模型得到更优秀的表达~
深度学习TOPLINE
原理简介
在此处所使用到的预训练模型为Bert的改进版——Roberta-base。它与Bert的区别在于：①Roberta在预训练的阶段中没有对下一句话进行预测（NSP）②采用了动态掩码 ③使用字符级和词级别表征的混合文本编码。
与常规的预训练模型接分类器不同，TOPLINE提供者对网络结构进行了更进一步的改进，具体细节如下：
在模型结构上使用了以下两个特征：
①特征1：MeanPooling(768维) -> fc(128维)
②特征2：Last_hidden (768维) -> fc(128维)
其中，特征1指的是将Roberta所输出的全部序列分词的表征向量先进行一个平均池化再接一个全连接层(fc，Fully Connected Layer)；特征2指的是将Roberta的pooled_output接一个全连接层(fc，Fully Connected Layer)。（pooled_output = [CLS]的表征向量接入一个全连接层，再输入至Tanh激活函数）
然后，将这两个特征进行加权并相加即可输进分类器进行训练。（在代码中，仅是将它们进行等权相加。后续当然也可以尝试分配不同的权重，看能否获得更好的性能）（Dropout层其实并不是一个必要项，可加可不加~）
最后，将训练好的模型用于推理测试集，并根据标签数目的反馈，对预测阈值进行调整。（后处理）
step1 下载topline代码
代码文件链接：https://wwvl.lanzout.com/ib9Wb15rxt0b
step2 部署pytorch+GPU环境（推荐使用阿里云）
step3 上传代码文件并解压
1.上传前面已下载好的for_paper_classification.zip
2.打开终端（Terminal），输入unzip -f（按下TAB即可自动补全文件名，或者也可手动收入全部命令行内容，即unzip -for_paper_classification.zip）
step4 对代码数据进行处理
1.进入已解压的文件夹下，cd -f（原理与上面的命令行一样）
2.将数据处理成模型的输入格式，在终端输入“python data_process.py”并回车
若是出现了以下报错，则说明都是阿里云的网络原因。只需要重新运行代码即可，直到运行成功~（可能十几次都没能正常下载，这也是有可能的）
这是小铃铛遇到的报错，还有一些OSError与TypeError的情况
多次运行该行代码后成功的结果如下
代码解析：
from transformers import AutoTokenizer # 导入AutoTokenizer类，用于文本分词
import pandas as pd # 导入pandas库，用于处理数据表格
import numpy as np # 导入numpy库，用于科学计算
from tqdm import tqdm # 导入tqdm库，用于显示进度条
import torch # 导入torch库，用于深度学习任务
from torch.nn.utils.rnn import pad_sequence # 导入pad_sequence函数，用于填充序列，保证向量中各序列维度的大小一样
MAX_LENGTH = 128 # 定义最大序列长度为128
def get_train(model_name, model_dict):
model_index = model_dict[model_name] # 获取模型索引
train = pd.read_csv('./dataset/train.csv') # 从CSV文件中读取训练数据
train['content'] = train['title'] + train['author'] + train['abstract'] # 将标题、作者和摘要拼接为训练内容
tokenizer = AutoTokenizer.from_pretrained(model_name, max_length=MAX_LENGTH, cache_dir=f'./premodels/{model_name}_saved') # 实例化分词器对象
# 通过分词器对训练数据进行分词，并获取输入ID、注意力掩码和标记类型ID（这个可有可无）
input_ids_list, attention_mask_list, token_type_ids_list = [], [], []
y_train = [] # 存储训练数据的标签
for i in tqdm(range(len(train['content']))): # 遍历训练数据
sample = train['content'][i] # 获取样本内容
tokenized = tokenizer(sample, truncation='longest_first') # 分词处理，使用最长优先方式截断
input_ids, attention_mask = tokenized['input_ids'], tokenized['attention_mask'] # 获取输入ID和注意力掩码
input_ids, attention_mask = torch.tensor(input_ids), torch.tensor(attention_mask) # 转换为PyTorch张量
try:
token_type_ids = tokenized['token_type_ids'] # 获取标记类型ID
token_type_ids = torch.tensor(token_type_ids) # 转换为PyTorch张量
except:
token_type_ids = input_ids
input_ids_list.append(input_ids) # 将输入ID添加到列表中
attention_mask_list.append(attention_mask) # 将注意力掩码添加到列表中
token_type_ids_list.append(token_type_ids) # 将标记类型ID添加到列表中
y_train.append(train['label'][i]) # 将训练数据的标签添加到列表中
# 保存
input_ids_tensor = pad_sequence(input_ids_list, batch_first=True, padding_value=0) # 对输入ID进行填充，保证向量中各序列维度的大小一样，生成张量
attention_mask_tensor = pad_sequence(attention_mask_list, batch_first=True, padding_value=0) # 对注意力掩码进行填充，保证向量中各序列维度的大小一样，生成张量
token_type_ids_tensor = pad_sequence(token_type_ids_list, batch_first=True, padding_value=0) # 对标记类型ID进行填充，保证向量中各序列维度的大小一样，生成张量
x_train = torch.stack([input_ids_tensor, attention_mask_tensor, token_type_ids_tensor], dim=1) # 将输入张量堆叠为一个张量
x_train = x_train.numpy() # 转换为NumPy数组
np.save(f'./models_input_files/x_train{model_index}.npy', x_train) # 保存训练数据
y_train = np.array(y_train) # 将标签列表转换为NumPy数组
np.save(f'./models_input_files/y_train{model_index}.npy', y_train) # 保存标签数据
def get_test(model_name, model_dict):
model_index = model_dict[model_name] # 获取模型索引
test = pd.read_csv('./dataset/testB.csv') # 从CSV文件中读取测试数据
test['content'] = test['title'] + ' ' + test['author'] + ' ' + test['abstract'] # 将标题、作者和摘要拼接为测试内容
tokenizer = AutoTokenizer.from_pretrained(model_name, max_length=MAX_LENGTH,cache_dir=f'./premodels/{model_name}_saved') # 实例化分词器对象
# 通过分词器对测试数据进行分词，并获取输入ID、注意力掩码和标记类型ID（可有可无）
input_ids_list, attention_mask_list, token_type_ids_list = [], [], []
for i in tqdm(range(len(test['content']))): # 遍历测试数据
sample = test['content'][i] # 获取样本内容
tokenized = tokenizer(sample, truncation='longest_first') # 分词处理，使用最长优先方式截断
input_ids, attention_mask = tokenized['input_ids'], tokenized['attention_mask'] # 获取输入ID和注意力掩码
input_ids, attention_mask = torch.tensor(input_ids), torch.tensor(attention_mask) # 转换为PyTorch张量
try:
token_type_ids = tokenized['token_type_ids'] # 获取标记类型ID
token_type_ids = torch.tensor(token_type_ids) # 转换为PyTorch张量
except:
token_type_ids = input_ids
input_ids_list.append(input_ids) # 将输入ID添加到列表中
attention_mask_list.append(attention_mask) # 将注意力掩码添加到列表中
token_type_ids_list.append(token_type_ids) # 将标记类型ID添加到列表中
# 保存
input_ids_tensor = pad_sequence(input_ids_list, batch_first=True, padding_value=0) # 对输入ID进行填充，保证向量中各序列维度的大小一样，生成张量
attention_mask_tensor = pad_sequence(attention_mask_list, batch_first=True, padding_value=0) # 对注意力掩码进行填充，保证向量中各序列维度的大小一样，生成张量
token_type_ids_tensor = pad_sequence(token_type_ids_list, batch_first=True, padding_value=0) # 对标记类型ID进行填充，保证向量中各序列维度的大小一样，生成张量
x_test = torch.stack([input_ids_tensor, attention_mask_tensor, token_type_ids_tensor], dim=1) # 将输入张量堆叠为一个张量
x_test = x_test.numpy() # 转换为NumPy数组
np.save(f'./models_input_files/x_test{model_index}.npy', x_test) # 保存测试数据
def split_train(model_name, model_dict):
# 处理样本内容
model_index = model_dict[model_name] # 获取模型索引
train = np.load(f'./models_input_files/x_train{model_index}.npy') # 加载训练数据
state = np.random.get_state() # 获取随机数状态，保证样本间的随机是可重复的
np.random.shuffle(train) # 随机打乱训练数据
# 训练集:验证集 = 9 : 1
val = train[int(train.shape[0] * 0.90):] # 划分验证集
train = train[:int(train.shape[0] * 0.90)] # 划分训练集
np.save(f'./models_input_files/x_train{model_index}.npy', train) # 保存训练集
np.save(f'./models_input_files/x_val{model_index}.npy', val) # 保存验证集
train = np.load(f'./models_input_files/y_train{model_index}.npy') # 加载标签数据
# 处理样本标签
np.random.set_state(state) # 恢复随机数状态，让样本标签的随机可重复
np.random.shuffle(train) # 随机打乱标签数据
# 训练集:验证集 = 9 : 1
val = train[int(train.shape[0] * 0.90):] # 划分验证集
train = train[:int(train.shape[0] * 0.90)] # 划分训练集
np.save(f'./models_input_files/y_train{model_index}.npy', train) # 保存训练集标签
np.save(f'./models_input_files/y_val{model_index}.npy', val) # 保存验证集标签
print('split done.')
if __name__ == '__main__':
model_dict = {'xlm-roberta-base':1, 'roberta-base':2, 'bert-base-uncased':3,
'microsoft/BiomedNLP-PubMedBERT-base-uncased-abstract-fulltext':4, 'dmis-lab/biobert-base-cased-v1.2':5, 'marieke93/MiniLM-evidence-types':6,
'microsoft/MiniLM-L12-H384-uncased':7, 'cambridgeltl/SapBERT-from-PubMedBERT-fulltext':8,'microsoft/BiomedNLP-PubMedBERT-base-uncased-abstract':9,
'microsoft/BiomedNLP-PubMedBERT-large-uncased-abstract':10}
model_name = 'roberta-base'
get_train(model_name, model_dict)
get_test(model_name, model_dict)
split_train(model_name, model_dict)
step5 训练模型
在终端输入“python models_training.py”并回车，最终即可看到：
表示模型训练已经完成
代码解析
# 导入需要的库
import numpy as np # 导入numpy库，用于科学计算
import torch # 导入torch库，用于深度学习任务
import torch.nn as nn # 导入torch.nn模块，用于神经网络相关操作
from sklearn import metrics # 导入sklearn库，用于评估指标计算
import os # 导入os库，用于操作系统相关功能
import time # 导入time库，用于时间相关操作
from transformers import AutoModel, AutoConfig # 导入AutoModel和AutoConfig类，用于加载预训练模型
from tqdm import tqdm # 导入tqdm库，用于显示进度条
# 超参数类 - 可修改的所有超参数都在这里~
class opt:
seed = 42 # 随机种子
batch_size = 16 # 批处理大小
set_epoch = 5 # 训练轮数
early_stop = 5 # 提前停止epoch数
learning_rate = 1e-5 # 学习率
weight_decay = 2e-6 # 权重衰减,L2正则化
device = torch.device("cuda" if torch.cuda.is_available() else "cpu") # 选择设备,GPU或CPU
gpu_num = 1 # GPU个数
use_BCE = False # 是否使用BCE损失函数
models = ['xlm-roberta-base', 'roberta-base', 'bert-base-uncased',
'microsoft/BiomedNLP-PubMedBERT-base-uncased-abstract-fulltext', 'dmis-lab/biobert-base-cased-v1.2', 'marieke93/MiniLM-evidence-types',
'microsoft/MiniLM-L12-H384-uncased','cambridgeltl/SapBERT-from-PubMedBERT-fulltext', 'microsoft/BiomedNLP-PubMedBERT-base-uncased-abstract',
'microsoft/BiomedNLP-PubMedBERT-large-uncased-abstract'] # 模型名称列表
model_index = 2 # 根据上面选择使用的模型，这里填对应的模型索引
model_name = models[model_index-1] # 使用的模型名称
continue_train = False # 是否继续训练
show_val = False # 是否显示验证过程
# 定义模型
class MODEL(nn.Module):
def __init__(self, model_index):
super(MODEL, self).__init__()
# 若是第一次下载权重，则下载至同级目录的./premodels/内，以防占主目录的存储空间
self.model = AutoModel.from_pretrained(opt.models[model_index-1], cache_dir='./premodels/'+opt.models[model_index-1]+'_saved', from_tf=False) # 加载预训练语言模型
# 加载模型配置，可以直接获得模型最后一层的维度，而不需要手动修改
config = AutoConfig.from_pretrained(opt.models[model_index-1], cache_dir='./premodels/'+opt.models[model_index-1]+'_saved') # 获取配置
last_dim = config.hidden_size # 最后一层的维度
if opt.use_BCE:out_size = 1 # 损失函数如果使用BCE,则输出大小为1
else :out_size = 2 # 否则则使用CE,输出大小为2
feature_size = 128 # 设置特征的维度大小
self.fc1 = nn.Linear(last_dim, feature_size) # 全连接层1
self.fc2 = nn.Linear(last_dim, feature_size) # 全连接层2
self.classifier = nn.Linear(feature_size, out_size) # 分类器
self.dropout = nn.Dropout(0.3) # Dropout层
def forward(self, x):
input_ids, attention_mask, token_type_ids = x[:,0],x[:,1],x[:,2] # 获取输入
x = self.model(input_ids, attention_mask) # 通过模型
all_token = x[0] # 全部序列分词的表征向量
pooled_output = x[1] # [CLS]的表征向量+一个全连接层+Tanh激活函数
feature1 = all_token.mean(dim=1) # 对全部序列分词的表征向量取均值
feature1 = self.fc1(feature1) # 再输入进全连接层，得到feature1
feature2 = pooled_output # [CLS]的表征向量+一个全连接层+Tanh激活函数
feature2 = self.fc2(feature2) # 再输入进全连接层，得到feature2
feature = 0.5*feature1 + 0.5*feature2 # 加权融合特征
feature = self.dropout(feature) # Dropout
x = self.classifier(feature) # 分类
return x
# 数据加载
def load_data():
train_data_path = f'models_input_files/x_train{model_index}.npy' # 训练集输入路径
train_label_path = f'models_input_files/y_train{model_index}.npy' # 训练集标签路径
val_data_path = f'models_input_files/x_val{model_index}.npy' # 验证集输入路径
val_label_path = f'models_input_files/y_val{model_index}.npy' # 验证集标签路径
test_data_path = f'models_input_files/x_test{model_index}.npy' # 测试集输入路径
train_data = torch.tensor(np.load(train_data_path , allow_pickle=True).tolist()) # 载入训练集数据
train_label = torch.tensor(np.load(train_label_path , allow_pickle=True).tolist()).long() # 载入训练集标签
val_data = torch.tensor(np.load(val_data_path , allow_pickle=True).tolist()) # 载入验证集数据
val_label = torch.tensor(np.load(val_label_path , allow_pickle=True).tolist()).long() # 载入验证集标签
test_data = torch.tensor(np.load(test_data_path , allow_pickle=True).tolist()) # 载入测试集数据
train_dataset = torch.utils.data.TensorDataset(train_data , train_label) # 构造训练集Dataset
val_dataset = torch.utils.data.TensorDataset(val_data , val_label) # 构造验证集Dataset
test_dataset = torch.utils.data.TensorDataset(test_data) # 构造测试集Dataset
return train_dataset, val_dataset, test_dataset # 返回数据集
# 模型预训练
def model_pretrain(model_index, train_loader, val_loader):
# 超参数设置
set_epoch = opt.set_epoch # 训练轮数
early_stop = opt.early_stop # 提前停止epoch数
learning_rate = opt.learning_rate # 学习率
weight_decay = opt.weight_decay # 权重衰减
device = opt.device # 设备
gpu_num = opt.gpu_num # GPU个数
continue_train = opt.continue_train # 是否继续训练
model_save_dir = 'checkpoints' # 模型保存路径
# 是否要继续训练，若是，则加载模型进行训练；若否，则跳过训练，直接对测试集进行推理
if not continue_train:
# 判断最佳模型是否已经存在,若存在则直接读取,若不存在则进行训练
if os.path.exists(f'checkpoints/best_model{model_index}.pth'):
best_model = MODEL(model_index)
best_model.load_state_dict(torch.load(f'checkpoints/best_model{model_index}.pth')) # 加载模型
return best_model
else:
pass
# 模型初始化
model = MODEL(model_index).to(device)
if continue_train:
model.load_state_dict(torch.load(f'checkpoints/best_model{model_index}.pth')) # 继续训练加载模型
# 优化器初始化
if device != 'cpu' and gpu_num > 1: # 多张显卡
optimizer = torch.optim.AdamW(model.module.parameters(), lr=learning_rate, weight_decay=weight_decay)
optimizer = torch.nn.DataParallel(optimizer, device_ids=list(range(gpu_num))) # 多GPU
else: # 单张显卡
optimizer = torch.optim.AdamW(model.parameters(), lr=learning_rate, weight_decay=weight_decay) # 单GPU
# 损失函数初始化
if opt.use_BCE:
loss_func = nn.BCEWithLogitsLoss() # BCE损失
else:
loss_func = nn.CrossEntropyLoss() # 交叉熵损失（CE）
# 模型训练
best_epoch = 0 # 最佳epoch
best_train_loss = 100000 # 最佳训练损失
train_acc_list = [] # 训练准确率列表
train_loss_list = [] # 训练损失列表
val_acc_list = [] # 验证准确率列表
val_loss_list = [] # 验证损失列表
start_time = time.time() # 训练开始时间
for epoch in range(set_epoch): # 轮数
model.train() # 模型切换到训练模式
train_loss = 0 # 训练损失
train_acc = 0 # 训练准确率
for x, y in tqdm(train_loader): # 遍历训练集
# 训练前先将数据放到GPU上
x = x.to(device)
y = y.to(device)
outputs = model(x) # 前向传播
if opt.use_BCE: # BCE损失
loss = loss_func(outputs, y.float().unsqueeze(1))
else: # 交叉熵损失
loss = loss_func(outputs, y)
train_loss += loss.item() # 累加训练损失
optimizer.zero_grad() # 清空梯度
loss.backward() # 反向传播
if device != 'cpu' and gpu_num > 1: # 多GPU更新
optimizer.module.step()
else:
optimizer.step() # 单GPU更新
if not opt.use_BCE: # 非BCE损失
_, predicted = torch.max(outputs.data, 1) # 预测结果
else:
predicted = (outputs > 0.5).int() # 预测结果
predicted = predicted.squeeze(1)
train_acc += (predicted == y).sum().item() # 计算训练准确率
average_mode = 'binary'
train_f1 = metrics.f1_score(y.cpu(), predicted.cpu(), average=average_mode) # 计算F1
train_pre = metrics.precision_score(y.cpu(), predicted.cpu(), average=average_mode) # 计算精确率
train_recall = metrics.recall_score(y.cpu(), predicted.cpu(), average=average_mode) # 计算召回率
train_loss /= len(train_loader) # 平均所有步数的训练损失作为一个epoch的训练损失
train_acc /= len(train_loader.dataset) # 平均所有步数训练准确率作为一个epoch的准确率
train_acc_list.append(train_acc) # 添加训练准确率
train_loss_list.append(train_loss) # 添加训练损失
print('-'*50)
print('Epoch [{}/{}]\n Train Loss: {:.4f}, Train Acc: {:.4f}'.format(epoch + 1, set_epoch, train_loss, train_acc))
print('Train-f1: {:.4f}, Train-precision: {:.4f} Train-recall: {:.4f}'.format(train_f1, train_pre, train_recall))
if opt.show_val: # 显示验证过程
# 验证
model.eval() # 模型切换到评估模式
val_loss = 0 # 验证损失
val_acc = 0 # 验证准确率
for x, y in tqdm(val_loader): # 遍历验证集
# 训练前先将数据放到GPU上
x = x.to(device)
y = y.to(device)
outputs = model(x) # 前向传播
if opt.use_BCE: # BCE损失
loss = loss_func(outputs, y.float().unsqueeze(1))
else: # 交叉熵损失
loss = loss_func(outputs, y)
val_loss += loss.item() # 累加验证损失
if not opt.use_BCE: # 非BCE损失
_, predicted = torch.max(outputs.data, 1)
else:
predicted = (outputs > 0.5).int() # 预测结果
predicted = predicted.squeeze(1)
val_acc += (predicted == y).sum().item() # 计算验证准确率
val_f1 = metrics.f1_score(y.cpu(), predicted.cpu(), average=average_mode) # 计算F1
val_pre = metrics.precision_score(y.cpu(), predicted.cpu(), average=average_mode) # 计算精确率
val_recall = metrics.recall_score(y.cpu(), predicted.cpu(), average=average_mode) # 计算召回率
val_loss /= len(val_loader) # 平均验证损失
val_acc /= len(val_loader.dataset) # 平均验证准确率
val_acc_list.append(val_acc) # 添加验证准确率
val_loss_list.append(val_loss) # 添加验证损失
print('\nVal Loss: {:.4f}, Val Acc: {:.4f}'.format(val_loss, val_acc))
print('Val-f1: {:.4f}, Val-precision: {:.4f} Val-recall: {:.4f}'.format(val_f1, val_pre, val_recall))
if train_loss < best_train_loss: # 更新最佳训练损失
best_train_loss = train_loss
best_epoch = epoch + 1
if device == 'cuda' and gpu_num > 1: # 多GPU保存模型
torch.save(model.module.state_dict(), f'{model_save_dir}/best_model{model_index}.pth')
else:
torch.save(model.state_dict(), f'{model_save_dir}/best_model{model_index}.pth') # 单GPU保存模型
# 提前停止判断
if epoch+1 - best_epoch == early_stop:
print(f'{early_stop} epochs later, the loss of the validation set no longer continues to decrease, so the training is stopped early.')
end_time = time.time()
print(f'Total time is {end_time - start_time}s.')
break
best_model = MODEL(model_index) # 初始化最佳模型
best_model.load_state_dict(torch.load(f'checkpoints/best_model{model_index}.pth')) # 加载模型参数
return best_model # 返回最佳模型
# 模型推理
def model_predict(model, model_index, test_loader):
device = 'cuda'
model.to(device) # 模型到GPU
model.eval() # 切换到评估模式
test_outputs = None
with torch.no_grad(): # 禁用梯度计算
for i, data in enumerate(tqdm(test_loader)):
data = data[0].to(device) # 测试数据到GPU
outputs = model(data) # 前向传播
if i == 0:
test_outputs = outputs # 第一个batch直接赋值
else:
test_outputs = torch.cat([test_outputs, outputs], dim=0) # 其余batch拼接
del data, outputs # 释放不再需要的Tensor
# 保存预测结果
if not opt.use_BCE:
test_outputs = torch.softmax(test_outputs, dim=1) # 转换为概率
torch.save(test_outputs, f'./models_prediction/{model_index}_prob.pth') # 保存概率
def run(model_index):
# 固定随机种子
seed = opt.seed
torch.seed = seed
np.random.seed(seed)
torch.manual_seed(seed)
torch.cuda.manual_seed(seed)
torch.cuda.manual_seed_all(seed)
torch.backends.cudnn.deterministic = True
train_dataset, val_dataset, test_dataset = load_data() # 加载数据集
# 打印数据集信息
print('-数据集信息:')
print(f'-训练集样本数:{len(train_dataset)},测试集样本数:{len(test_dataset)}')
train_labels = len(set(train_dataset.tensors[1].numpy()))
# 查看训练样本类别均衡状况
print(f'-训练集的标签种类个数为:{train_labels}')
numbers = [0] * train_labels
for i in train_dataset.tensors[1].numpy():
numbers[i] += 1
print(f'-训练集各种类样本的个数:')
for i in range(train_labels):
print(f'-{i}的样本个数为:{numbers[i]}')
batch_size = opt.batch_size # 批处理大小
# 构建DataLoader
train_loader = torch.utils.data.DataLoader(dataset=train_dataset, batch_size=batch_size, shuffle=True)
val_loader = torch.utils.data.DataLoader(dataset=val_dataset, batch_size=batch_size, shuffle=True)
test_loader = torch.utils.data.DataLoader(dataset=test_dataset, batch_size=batch_size, shuffle=False)
best_model = model_pretrain(model_index, train_loader, val_loader)
# 使用验证集评估模型
model_predict(best_model, model_index, test_loader) # 模型推理
if __name__ == '__main__':
model_index = opt.model_index # 获取模型索引
run(model_index) # 运行程序step6 测试集推理
在终端输入“python ensemble_and_submit.py”并回车
模型评估代码：
import torch # 导入torch库，用于深度学习任务
import pandas as pd # 导入pandas库，用于处理数据表格
from models_training import MODEL # 从本地文件models_training.py中导入MODEL类
import torch # 导入torch库，用于深度学习任务
from tqdm import tqdm # 导入tqdm库，用于显示进度条
from sklearn.metrics import classification_report # 从sklearn.metrics模块导入classification_report函数，用于输出分类报告，看各标签的F1值
import numpy as np # 导入numpy库，用于科学计算
# 推理
def inference(model_indexs, use_BCE):
device = 'cuda' # 设备选择为cuda
for model_index in model_indexs:
# 加载模型
model = MODEL(model_index).to(device) # 创建MODEL类的实例，并将模型移至设备(device)
model.load_state_dict(torch.load(f'checkpoints/best_model{model_index}.pth')) # 加载模型的权重参数
model.eval() # 切换到评估模式
# 加载val数据
val_data_path = f'models_input_files/x_val{model_index}.npy' # val数据的路径
val_data = torch.tensor(np.load(val_data_path, allow_pickle=True).tolist()) # 加载val数据，并转换为Tensor格式
val_dataset = torch.utils.data.TensorDataset(val_data) # 创建val数据集
val_loader = torch.utils.data.DataLoader(dataset=val_dataset, batch_size=32, shuffle=False) # 创建val数据的数据加载器
val_outputs = None # 初始化val_outputs变量
with torch.no_grad(): # 禁用梯度计算
for i, data in enumerate(tqdm(val_loader)): # 遍历val_loader，显示进度条
data = data[0].to(device) # 将数据移至GPU
outputs = model(data) # 模型推理，获取输出
if i == 0:
val_outputs = outputs # 若为第一次迭代，直接赋值给val_outputs
else:
val_outputs = torch.cat([val_outputs, outputs], dim=0) # 否则在dim=0上拼接val_outputs和outputs
del data, outputs # 释放不再需要的Tensor对象
# 输出预测概率
if not use_BCE:
val_outputs = torch.softmax(val_outputs, dim=1) # 对val_outputs进行softmax操作
torch.save(val_outputs, f'evaluate_prediction/{model_index}_prob.pth') # 保存预测概率结果
def run(model_indexs, use_BCE):
# 读取所有的model_prob.pth，并全加在一起
avg_pred = None # 初始化avg_pred变量
for i in model_indexs:
pred = torch.load(f'evaluate_prediction/{i}_prob.pth').data # 加载预测概率结果
if use_BCE:
# 选取大于0.5的作为预测结果
pred = (pred > 0.5).int() # 将大于0.5的值转换为整数（0或1）
pred = pred.reshape(-1) # 将预测结果进行形状重塑
else:
# 选取最大的概率作为预测结果
pred = torch.argmax(pred, dim=1) # 获取最大概率的索引作为预测结果
pred = pred.cpu().numpy() # 将预测结果转移到CPU上，并转换为NumPy数组
# to_evaluate
# 读取真实标签
val_label_path = f'models_input_files/y_val{i}.npy' # 真实标签的路径
y_true = np.load(val_label_path) # 加载真实标签
# 分类报告
print(f'model_index = {i}:')
print(classification_report(y_true, pred, digits=4)) # 打印分类报告，包括精确度、召回率等指标
zero_acc = 0; one_acc = 0 # 初始化0类和1类的准确率
zero_num = 0; one_num= 0 # 初始化0类和1类的样本数量
for i in range(pred.shape[0]):
if y_true[i] == 0:
zero_num += 1 # 统计0类的样本数量
elif y_true[i] == 1:
one_num += 1 # 统计1类的样本数量
if pred[i] == y_true[i]:
if pred[i] == 0:
zero_acc += 1 # 统计0类的正确预测数量
elif pred[i] == 1:
one_acc += 1 # 统计1类的正确预测数量
zero = np.sum(pred == 0) / pred.shape[0] # 计算预测为0类的样本占比
zero_acc /= zero_num # 计算0类的正确率
print(f'预测0类占比：{zero} 0类正确率：{zero_acc}')
one = np.sum(pred == 1) / pred.shape[0] # 计算预测为1类的样本占比
one_acc /= one_num # 计算1类的正确率
print(f'预测1类占比：{one} 1类正确率：{one_acc}')
print('-' * 80)
if __name__ == '__main__':
use_BCE = False # 是否使用BCE损失函数的标志，这里我只用交叉熵CE，所以是False
inference([2], use_BCE=use_BCE) # 进行推理，传入模型索引和use_BCE标志
model_indexs = [2] # 模型索引列表
run(model_indexs, use_BCE=use_BCE) # 进行运行，传入模型索引和use_BCE标志测试集推理代码：
import torch
import pandas as pd
import warnings # 过滤警告
warnings.filterwarnings('ignore')
def run(model_indexs, use_BCE):
# 记录模型数量
model_num = len(model_indexs)
# 读取所有的model_prob.pth，并全加在一起
for i in model_indexs:
# 加载模型在训练完成后对测试集推理所得的预测文件
pred = torch.load(f'./models_prediction/{i}_prob.pth', map_location='cpu').data
# 这里的操作是将每个模型对测试集推理的概率全加在一起
if i == model_indexs[0]:
avg_pred = pred
else:
avg_pred += pred
# 取平均
avg_pred /= model_num # 使用全加在一起的预测概率除以模型数量
if use_BCE:
# 选取概率大于0.5的作为预测结果
pred = (avg_pred > 0.5).int()
pred = pred.reshape(-1)
else:
# 后处理 - 根据标签数目的反馈，对预测阈值进行调整
pred[:, 0][pred[:, 0]>0.001] = 1
pred[:, 1][pred[:, 1]>0.999] = 1.2
# 选取最大的概率作为预测结果
pred = torch.argmax(avg_pred, dim=1)
pred = pred.cpu().numpy()
# to_submit
# 读取test.csv文件
test = pd.read_csv('./dataset/testB_submit_exsample.csv')
# 开始写入预测结果
for i in range(len(pred)):
test['label'][i] = pred[i]
print(test['label'].value_counts())
# 保存为提交文件
test.to_csv(f'submit.csv',index=False)
if __name__ == '__main__':
run([2], use_BCE=False)
# run([1,2,3,4,5,6,7,8,9,10], use_BCE=False)
step7 提交结果
小铃铛第一次提交即获得了1分，但也有朋友是将batch_size改成8才跑到1分
以下再给出一些可以提高分数or深入学习的一些思想，正在阅读的你可以做一些尝试：
①调整超参数
包括学习率、Batch_size、正则化系数等，可以使用网格搜索的方法（Grid search）来寻找模型更好的超参数组合。
②调整最大序列长度
在数据处理阶段中，调整最大序列长度MAX_LEN。
③更改损失函数
一般分类任务中，最常使用的损失函数是交叉熵（CE, Cross-Entropy），但最简单的也可以换成BCE。
④冻结模型部分参数
如feature1在模型训练的前期，相对feature2而言可能并不能带来太好的表征，所以第一个epoch可以先将它的参数进行冻结（又或者将该特征对应全连接层的学习率调小），然后等到第二个epoch后再正常训练。
⑤融合更多特征
融合更多特征，如考虑加入Glove、Word2Vec、Fasttext结合TextCNN、BiLSTM、LSTM+Attention等特征提取器所提取的文本特征。
⑥模型集成
使用一或多个与本文模型能够互补优劣的模型，并进行集成。
⑦对比学习
设计代理任务，加入对比损失函数，在训练阶段中获得更好的嵌入表示，提高模型性能。
⑧提示学习
在预训练模型的基础上使用提示学习范式，通过硬提示/软提示的方法提高模型性能。
大模型TOPLINE
大模型简介
近些年，研究人员通过在大规模语料库上预训练 Transformer 模型产生了预训练语言模型（PLMs），并在解决各类 NLP 任务上展现出了强大的能力。并且研究人员发现模型缩放可以带来性能提升，因此他们通过将模型规模增大进一步研究缩放的效果。有趣的是，当参数规模超过一定水平时，这个更大的语言模型实现了显著的性能提升，并出现了小模型中不存在的能力，比如上下文学习。为了区别于 PLM，这类模型被称为大型语言模型（LLMs）。
简单来说，大模型的特点就是参数量极大（多达数千亿），并且研究人员发现可以利用这种特性达到上下文衔接训练的目的，因此使机器与人类进行正常沟通成为可能。
大模型的原理
大语言模型的语言生成的原理叫做自回归模型，是统计上一种处理时间序列的方法。自回归模型的关键是根据你前面已经出现过的内容，来推测它的下一个字，下一句话应该是怎样生成的，在这样不断的迭代过程中，它就能学会如何去生成一句话、一个段落，以及一篇文章。
大模型训练模式
OpenAI 开发 ChatGPT 的三个主要步骤：大尺寸预训练+指令微调+RLHF
- 大尺寸预训练：在这个阶段，模型在大规模的文本数据集上进行预训练。这是一个非监督学习的过程，模型需要预测在给定的文本序列中下一个词是什么。预训练的目标是让模型学会理解和生成人类语言的基本模式。
- 指令微调：在预训练之后，模型会在一个更小但专门针对特定任务的数据集上进行微调。这个数据集通常由人工生成，包含了模型需要学会的任务的特定指令。例如，如果我们想要让模型学会如何进行数学计算，我们就需要提供一些包含数学问题和对应解答的数据。
- RLHF（Reinforcement Learning from Human Feedback）：这是一个强化学习过程，模型会根据人类提供的反馈进行学习和优化。首先，我们会收集一些模型的预测结果，并让人类评估这些结果的好坏。然后，我们会使用这些评估结果作为奖励，训练模型优化其预测性能。通过这种方式，模型可以学会生成更符合人类期望的结果。
通过这三个步骤，模型能够在理解和生成人类语言的基础上，更好地完成特定任务，更好地符合人类的期望。
大模型微调
近年来研究者们提出了各种各样的参数高效迁移学习方法（Parameter-efficient Transfer Learning），即固定住Pretrain Language model（PLM）的大部分参数，仅调整模型的一小部分参数来达到与全部参数的微调接近的效果（调整的可以是模型自有的参数，也可以是额外加入的一些参数）。
说了这一堆相信你并没有看懂，我也没有看懂，但这是给出的官方文档。
简单来说，大模型微调就是固定好已训练好的参数不变，额外的增加一些参数来与这些已训练好的参数一起影响结果，从而只会（数量上）小幅度的修改额外参数的值，而达到了更加拟合结果且不丢失性能的效果。
微调方法介绍
https://blog.csdn.net/sinat_39620217/article/details/131751780step1 部署pytorch+GPU环境（上文已给出链接，此处不再赘述）
step2 建立数据集
正如其名，指令微调大模型与通用大模型最大的区别在于进行了指令微调，即训练模型理解并执行指令的能力。指令微调一般会给模型特定的指令及执行指令后的输出，要求模型学习遵循指令的能力。这里的指令可以有很多种类型，包括回答问题、续写、创作等。具体而言，指令微调时通常有两个输入，一个是你要求模型执行的指令，另一个是执行该指令所必须的输入。例如，当你要求模型执行指令“续写我的话”，那么你还需要输入该指令中指代的话，例如“今天天气很好，我们去”。而指令微调的输出一般是模型执行该指令后的输出，例如对于上述示例，输出应该为“郊游吧”。
本任务中，我们所要对大模型进行的即是指令微调。通过训练模型在特定指令（在本任务中，即要求其判断文献是否医学领域文献）下的指令执行能力，来使用大模型完成本任务。我们也需要按照指令微调的格式进行数据集的建立。使用 LoRA 进行指令微调时，数据集一般有三个元素：instruction，input，output。
instruction 即指令，即上文中我们所提到的第一个输入——要求模型执行的指令。
input 即上文中我们提到的第二个输入——执行该指令所必须的输入。
output 即指令微调的输出。
在本任务中则更加详细具体地表现为：
- instruction：指令，Please judge whether it is a medical field paper according to the given paper title and abstract, output 1 or 0, the following is the paper title and abstract -->
- "-->":加上一个箭头就是让大模型明白，下次再遇到这种问题，就是我们想让大模型进行二分类任务。
- input：prompt。对于这个任务来说那就是 title+abstract+author 拼接成的字符串了。
- output：response，即大模型的回答，0 or 1。
最后在data目录下的data_info.json文件内添加数据集。
"数据集名称": {
"file_name": "data目录下数据集文件的名称",
}
step3 运行微调代码
1.克隆微调脚本 git clone https://github.com/KMnO4-zx/xfg-paper.git
2.下载chatglm2-6b模型：git clone https://huggingface.co/THUDM/chatglm2-6b，这行命令可能会失败，没关系多试几次！模型下载时间需要十几分钟，如果几分钟之内遇到卡主情况，不用着急，可能只是在后台运行；如果已经半个小时以上没有继续运行，可使用
wget https://cloud.tsinghua.edu.cn/seafhttp/files/f3e22aa1-83d1-4f83-917e-cf0d19ad550f/pytorch_model-00001-of-00007.bin https://cloud.tsinghua.edu.cn/seafhttp/files/0b6a3645-0fb7-4931-812e-46bd2e8d8325/pytorch_model-00002-of-00007.bin https://cloud.tsinghua.edu.cn/seafhttp/files/f61456cb-5283-4529-a7bc-400355140e4b/pytorch_model-00003-of-00007.bin https://cloud.tsinghua.edu.cn/seafhttp/files/1a1f68c5-1a7d-489a-8f16-8432a099d782/pytorch_model-00004-of-00007.bin https://cloud.tsinghua.edu.cn/seafhttp/files/6357afba-bb40-4348-bc33-f08c1fcc2936/pytorch_model-00005-of-00007.bin https://cloud.tsinghua.edu.cn/seafhttp/files/ebec3ae2-5ae4-432c-83e4-df4b147026bb/pytorch_model-00006-of-00007.bin https://cloud.tsinghua.edu.cn/seafhttp/files/7d1aab8a-d255-47f7-87c9-4c0593379ee9/pytorch_model-00007-of-00007.bin https://cloud.tsinghua.edu.cn/seafhttp/files/4daca87e-0d34-4cff-bd43-5a40fcdf4ab1/tokenizer.model，但是该命令只可用于下载模型文件，而没有任何的配置文件，慎用！！！）
注：chatglm与bert的区别在于，chatglm的参数比bert大很多很多，因此更有利于特征的提取
3.进入目录安装环境：cd ./xfg-paper
4.配置环境信息：pip install -r requirements.txt
5.将脚本中的model_name_or_path更换为你本地的chatglm2-6b模型路径，（给出的脚本代码中已经修改为此模式，如果路径有所更改，请修改模型路径）
6.运行脚本：sh xfg_train.sh（微调过程大概需要两个小时，可以吃顿饭回来继续）
7.运行submit_demo.py代码（小铃铛并没有在阿里云中配置notebook，因此采用了最原始的创建新的py的方法）
#######################导入数据###########################################################
# 导入 pandas 库，用于数据处理和分析
import pandas as pd
# 读取训练集和测试集
train_df = pd.read_csv("./csv_data/train.csv")
testB_df = pd.read_csv('./csv_data/testB.csv')
#######################制作数据集#########################################################
# 创建一个空列表来存储数据样本
res = []
# 遍历训练数据的每一行
for i in range(len(train_df)):
# 获取当前行的数据
paper_item = train_df.loc[i]
# 创建一个字典，包含指令、输入和输出信息
tmp = {
"instruction": "Please judge whether it is a medical field paper according to the given paper title and abstract, output 1 or 0, the following is the paper title and abstract -->",
"input": f"title:{paper_item[1]},abstract:{paper_item[3]}",
"output": str(paper_item[5])
}
# 将字典添加到结果列表中
res.append(tmp)
# 导入json包，用于保存数据集
import json
# 将制作好的数据集保存到data目录下
with open('./data/paper_label.json', mode='w', encoding='utf-8') as f:
json.dump(res, f, ensure_ascii=False, indent=4)
{
#######################修改data_info#####################################################
"paper_label": {
"file_name": "paper_label.json"
}
}
############################加载训练好的LoRA权重，进行预测#################################
# 导入所需的库和模块
from peft import PeftModel
from transformers import AutoTokenizer, AutoModel, GenerationConfig, AutoModelForCausalLM
# 定义预训练模型的路径
model_path = "../chatglm2-6b"
model = AutoModel.from_pretrained(model_path, trust_remote_code=True).half().cuda()
tokenizer = AutoTokenizer.from_pretrained(model_path, trust_remote_code=True)
# 加载 label lora权重
model = PeftModel.from_pretrained(model, './output/label_xfg').half()
model = model.eval() # 不是用来评测，是用来输出的
# 使用加载的模型和分词器进行聊天，生成回复
response, history = model.chat(tokenizer, "你好", history=[])
response
# 预测函数
def predict(text):
# 使用加载的模型和分词器进行聊天，生成回复
response, history = model.chat(tokenizer, f"Please judge whether it is a medical field paper according to the given paper title and abstract, output 1 or 0, the following is the paper title and abstract -->{text}", history=[],
temperature=0.01)
return response
###############################制作submit################################################
# 预测测试集
# 导入tqdm包，在预测过程中有个进度条
from tqdm import tqdm
# 建立一个label列表，用于存储预测结果
label = []
# 遍历测试集中的每一条样本
for i in tqdm(range(len(testB_df))):
# 测试集中的每一条样本
test_item = testB_df.loc[i]
# 构建预测函数的输入：prompt
test_input = f"title:{test_item[1]},abstract:{test_item[3]}"
# 将预测结果存入lable列表
label.append(int(predict(test_input)))
# 把label列表赋予testB_df
testB_df['label'] = label
# task1虽然只需要label，但需要有一个keywords列，用个随意的字符串代替
testB_df['Keywords'] = ['tmp' for _ in range(2000)]
# 制作submit，提交submit
submit = testB_df[['uuid', 'Keywords', 'label']]
submit.to_csv('submit.csv', index=False)
step4 提交结果
小铃铛没有细改参数，因此得到的结果不甚理想，且看到很多朋友都没有达到之前预期的结果
小铃铛的后记
本次datawhale的学习暂告段落了，虽然时光匆匆，但是我从中学到很多东西，至少学习到了许多想法。
在本次的学习过程中，我初次接触到云端环境的配置，从最开始的手忙脚乱到之后的得心应手，受益匪浅；另外，初次使用anaconda，对其操作并不十分熟练，我的本地只有一个版本的python因此并没有装anaconda对不同的环境进行管理，在本次的学习过程中也略有涉猎；其三，我接触到了“大模型”这一概念，这使我对GPT等机器交互系统的由来有了一定的认知，并且通过运行各类代码，从baseline模型到bert模型和topline模型，以及浏览huggingface_hub模型网站，都使我进一步地接近了真实的工作生活。
种种收获，难以一言以蔽之。最后，非常感谢datawhale提供的这一学习平台，并且如果有机会的话，也希望有更多的人可以参与其中，找到属于自己的一分收获！
HAPPY ENDING
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