图深度学习库Cogdl在Anaconda中的安装和使用

Cogdl这个库，我虽然已经关注很久（例如参考LeaderBoards），但是没有自己用过。我们可以直接使用其中的很多graph neural network model，或者把这些model当成验证自己的想法的起点。

按照这里：https://github.com/THUDM/cogdl

直接运行：

pip install cogdl

可是当我安装了之后，并且按照这里给出的命令行参数运行的时候：

python scripts/train.py --task graph_classification --dataset proteins --model gin diffpool sortpool dgcnn --seed 0 1

却报了错：No module named 'torch_geometric'

话说，torch_geometric也是graph neural network必备的库，但是我这个conda环境中确实没安装，所以没办法，参考一下其主页：https://github.com/rusty1s/pytorch_geometric

其主页上主要说明了PyTorch 1.8.0和1.7.0/1.7.1的安装方法。我都忘记了我的pytorch版本了，运行：

python
import torch
print(torch.__version__)

结果竟然是1.6.0。呵呵呵，也不敢随意升级pytorch版本，只能再新建一个conda的虚拟环境：

conda create -n cogdl python=3.7

然后：

pip3 install torch torchvision torchaudio

话说Python的版本碎片化真是太讨厌了。安装好之后按照上面torch_geometric的说明，依次运行（因为上面这条命令，默认安装的是PyTorch 1.8.1）：

pip install torch-scatter -f https://pytorch-geometric.com/whl/torch-1.8.0+cu102.html
pip install torch-sparse -f https://pytorch-geometric.com/whl/torch-1.8.0+cu102.html
pip install torch-cluster -f https://pytorch-geometric.com/whl/torch-1.8.0+cu102.html
pip install torch-spline-conv -f https://pytorch-geometric.com/whl/torch-1.8.0+cu102.html
pip install torch-geometric

然后就可以正常运行cogdl了。话说，我觉得python的库和版本管理真的太混乱了，无语，有没有科学问题可以帮助改进现状呢？