linux并行环境及mpich2安装全过程

linux并行环境及mpich2安装全过程

准备工作：

1、设置IP（在这里我们设置c1、c2、c3、c4的ip地址分别为192.168.0.1、192.168.0.2、192.168.03、192.168.0.4）

#vi /etc/sysconfig/network-script/ifcfg-eth[0、1、2、3]其中数字与所修改的机器网卡实际编号一致

#service network restart

每个节点都要进行上面的操作

2、更改主机名为c1、c2、c3、c4

#vi /etc/sysconfig/network

 HOSTNAME=c1

c2、c3、c4操作和c1相同

例如：

[root@c2 ~]# cat /etc/sysconfig/network

NETWORKING=yes

HOSTNAME=c2

　　一、创建SSH信任连接（在root目录下）

　　1、更改/etc/hosts文件              

　　#vi /etc/hosts   打开hosts文件，更改如下：

　　127.0.0.1 localhost.localdomain localhost

　  192.168.0.1   c1

192.168.0.2   c2

192.168.0.3   c3

192.168.0.4   c4

例如：

[root@c2 ~]# cat /etc/hosts

# Do not remove the following line, or various programs

# that require network functionality will fail.

127.0.0.1       localhost.localdomain   localhost

192.168.0.1    c1

192.168.0.2    c2

192.168.0.3    c3

192.168.0.4    c4

　　2、在c1生成SSH秘钥对.

#ssh-keygen -t rsa 回车即可,产生.ssh文件,

口令选为空，生成密钥对，公钥写入/root/.ssh/id_rsa.pub,密钥写入/root/.ssh/id_rsa

#ls -a   查看是否有.ssh文件夹

3、生成authorized_keys文件建立对c2的信任连接

#scp /root/.ssh/id_rsa.pub 192.168.0.2:/root/.ssh/

#ssh 192.168.0.2  cat /.ssh/id_rsa.pub>>/root/.ssh/authorized_keys

查看c2 是否有authorized_keys文件，有则将id_rsa.pub内容复制进c2该文件

#scp /root/.ssh/id_rsa.pub 192.168.0.2  /.ssh/authorized_keys

无则将id_rsa.pub复制为远程该文件

　　4、退出到root目录

　　#cd ..

　　5、建立本身的信任连接

　　#ssh c2     按提示输入yes（三个字母要打全）

设置c1对c3和c4的方法与c1相同

6、对c2、c3和c4进行类似上面的操作

　　7、确认3台机器的信任连接已建立

　　对每个节点执行：

　　#ssh c1

　　#ssh c2

#ssh c3

#ssh c4

　　在提示处输入yes回车，最后确定无需输入密码并且没有任何提示信息即可登陆（"Last login:时间日期"提示信息除外）

　　二、安装MPICH2(在节点root目录下)

　　1、解压缩

　　#tar -zxvf mpich2-1.0.1.tar.gz

　　或者 #gunzip -c mpich2-1.0.1.tar.gz|tar xf mpich2-1.0.1.tar

　　2、创建安装目录

　　#mkdir /usr/MPICH-install

　　3、进入mpich2解压目录

　　#cd mpich2-1.0.1

　　4、设置安装目录

　　#./configure --prefix=/usr/MPICH-install

　　5、编译

　　#make

　　6、安装

　　#make install

　　7、退出到root目录

　　#cd ..

　　8、通过编辑.bashrc文件修改环境变量

　　#vi .bashrc

　　修改后的.bashrc文件如下：

　　# .bashrc

　　# User specific aliases and functions

　　PATH=$PATH:/usr/MPICH-install/bin   新增加的

　　#Source .bashrc

　　9、测试环境变量设置

　　#which mpd

　　#which mpicc

　　#which mpiexec

　　#which mpirun

　　10、修改/etc/mpd.conf文件，内容为secretword=myword

　　#vi /etc/mpd.conf

　　设置文件读取权限和修改时间

　　#touch /etc/mpd.conf

　　#chmod 600 /etc/mpd.conf

　　11、创建主机名称集合文件/root/mpd.hosts

　　#vi mpd.hosts

文件内容如下：

C1

C2

C3

c4

　　三、测试

　　1、本地测试

　　#mpd &    启动

　　#mpdtrace 观看启动机器

　　#mpdallexit 退出

　　2、通过mpd.hosts运行集群系统

　　#mpdboot -n number -f mpd.hosts        number为要起动的机器个数

　　#mpdtrace

　　#mpdallexit

　　3、测试运行MPICH的例子程序

　　#mpdboot -n 4 -f mpd.hosts   启动4台机器

　　#mpiexec -n number /usr/MPICH-install/examples/cpi     number为使用的进程数

　　#mpdallexit

　　4、如果测试不能通过，请进行第四步

　　四、问题解决

　　1、通过mpdcheck获得一写帮助信息

　　#mpdcheck -pc

　　2、查错

　　#mpdcheck -l

　　3、通过mpd.hosts文件查错

　　#mpdcheck -f mpd.hosts 如果无错误

　　#mpdcheck -f mpd.hosts -ssh

　　4、如果上述无错误，可略过此步

　　对任意两台机器进行查错

　　m1: #mpdcheck -s 输出主机名host和端口port

　　m2: #mpdcheck -c host port

　　注意：以上四步都是在没有运行mpd的情况下进行的

　　5、mpd查错

　　m1: #mpd -e & 返回使用的端口

m2: #mpd -h m1 -p echoed_port_m1 &

完成安装