Caffe工具使用

Caffe tools/下的工具真的很有用!但是不知道的时候容易进坑啊! 我们在处理图片的时候都想把它转换成效率最高的形式,当然在caffe中就是lmdb形式,但是怎么转换呢?初学者可能不是很明白,下面首先讲下将原始数据转换为lmdb,借助的工具是

convert_imageset.
如果是二进制文件直接可以修改 mnist的脚本用来生成标签!!这种在我看来不太实用,但是可以用来训练能力!第二部分会讲到

工具将图像转换为LMDB格式

首先说明的是这个工具在编译caffe的时候就会自动在build目录下生成!
一:创建标签文件
sudo vi /home/zhao/ming/caffe0/caffe/examples/images/create_filelist.sh

sh / home/zhao/ming/caffe0/caffe/examples/images/create_filelist.sh

zhao@zhao:~/ming/caffe0/caffe/examples/images$ cat train.txt 
cat.jpg 1
cat_gray.jpg 2



二:生成lmdb
创建脚本
sudo vi /home/zhao/ming/caffe0/caffe/examples/images/ create_lmdb.sh

#!/usr/bin/env sh
DATA=/home/zhao/ming/caffe0/caffe/examples/images
rm -rf $DATA/img_train_lmdb
/home/zhao/ming/caffe0/caffe/build/tools/convert_imageset --shuffle \
--resize_height=256 --resize_width=256 \
/home/zhao/ming/caffe0/caffe/examples/images/ $DATA/train.txt  $DATA/img_train_lmdb

执行脚本

sudo sh /home/zhao/ming/caffe0/caffe/examples/images/ create_lmdb.sh
显示成功
I0204 10:07:19.044874 111449 convert_imageset.cpp:86] Shuffling data
I0204 10:07:19.045791 111449 convert_imageset.cpp:89] A total of 2 images.
I0204 10:07:19.046242 111449 db_lmdb.cpp:35] Opened lmdb /home/zhao/ming/caffe0/caffe/examples/images/img_train_lmdb
I0204 10:07:19.119742 111449 convert_imageset.cpp:153] Processed 2 files.

遇到的问题是路径没有写对,出现了下面这个问题!!!!
显示没有找到 build/tools/convert_imageset 这个可执行文件
其实被这句话误导了,这是因为路径没有写完全的原因,不是可执行文件不存在!
编译 convert_imageset.cpp
g++ convert_imageset.cpp -o /home/zhao/ming/caffe0/caffe/examples/images/convert_imageset-D CPU_ONLY -I /home/zhao/ming/caffe0/caffe/include/ -L /home/zhao/ming/caffe0/caffe/build/lib/ -lcaffe -lboost_system -lglog lglog -lboost_system
这种单独编译是错误的!
如果修改这些工具也不需要我们自己使用g++进行编译,因为caffe根目录下面的Makefile文件其实已经帮我们把编译的过程写好了,我们在修改或者增加.cpp文件之后,只需要回到caffe的根目录下面,重新make一下就可以了。

下面摘抄一片博客上的文章,写的非常好
/

在深度学习的实际应用中,我们经常用到的原始数据是图片文件,如jpg,jpeg,png,tif等格式的,而且有可能图片的大小还不一致。而在caffe中经常使用的数据类型是lmdb或leveldb,因此就产生了这样的一个问题:如何从原始图片文件转换成caffe中能够运行的db(leveldb/lmdb)文件?

在caffe中,作者为我们提供了这样一个文件:convert_imageset.cpp,存放在根目录下的tools文件夹下。编译之后,生成对应的可执行文件放在 buile/tools/ 下面,这个文件的作用就是用于将图片文件转换成caffe框架中能直接使用的db文件。

该文件的使用格式:

 convert_imageset [FLAGS] ROOTFOLDER/ LISTFILE DB_NAME

需要带四个参数:

FLAGS: 图片参数组,后面详细介绍

ROOTFOLDER/: 图片存放的绝对路径,从linux系统根目录开始

LISTFILE: 图片文件列表清单,一般为一个txt文件,一行一张图片

DB_NAME: 最终生成的db文件存放目录

如果图片已经下载到本地电脑上了,那么我们首先需要创建一个图片列表清单,保存为txt

本文以caffe程序中自带的图片为例,进行讲解,图片目录是  example/images/, 两张图片,一张为cat.jpg, 另一张为fish_bike.jpg,表示两个类别。

我们创建一个sh脚本文件,调用linux命令来生成图片清单:

# sudo vi examples/images/create_filelist.sh

编辑这个文件,输入下面的代码并保存

按 Ctrl+C 复制代码
# /usr/bin/env sh
DATA=examples/images
echo "Create train.txt..."
rm -rf $DATA/train.txt
find $DATA -name *cat.jpg | cut -d '/' -f3 | sed "s/$/ 1/">>$DATA/train.txt
find $DATA -name *bike.jpg | cut -d '/' -f3 | sed "s/$/ 2/">>$DATA/tmp.txt
cat $DATA/tmp.txt>>$DATA/train.txt
rm -rf $DATA/tmp.txt
echo
"Done.."
按 Ctrl+C 复制代码

这个脚本文件中,用到了rm,find, cut, sed,cat等linux命令。

rm: 删除文件

find: 寻找文件

cut: 截取路径

sed: 在每行的最后面加上标注。本例中将找到的*cat.jpg文件加入标注为1,找到的*bike.jpg文件加入标注为2

cat: 将两个类别合并在一个文件里。

最终生成如下的一个train.txt文件:

cat.jpg 1
fish-bike.jpg 2

当然,图片很少的时候,手动编写这个列表清单文件就行了。但图片很多的情况,就需要用脚本文件来自动生成了。在以后的实际应用中,还需要生成相应的val.txt和test.txt文件,方法是一样的。

生成的这个train.txt文件,就可以作为第三个参数,直接使用了。

接下来,我们来了解一下FLAGS这个参数组,有些什么内容:

-gray: 是否以灰度图的方式打开图片。程序调用opencv库中的imread()函数来打开图片,默认为false

-shuffle: 是否随机打乱图片顺序。默认为false

-backend:需要转换成的db文件格式,可选为leveldb或lmdb,默认为lmdb

-resize_width/resize_height: 改变图片的大小。在运行中,要求所有图片的尺寸一致,因此需要改变图片大小。 程序调用opencv库的resize()函数来对图片放大缩小,默认为0,不改变

-check_size: 检查所有的数据是否有相同的尺寸。默认为false,不检查

-encoded: 是否将原图片编码放入最终的数据中,默认为false

-encode_type: 与前一个参数对应,将图片编码为哪一个格式:‘png','jpg'......

好了,知道这些参数后,我们就可以调用命令来生成最终的lmdb格式数据了

由于参数比较多,因此我们可以编写一个sh脚本来执行命令:

首先,创建sh脚本文件:

# sudo vi examples/images/create_lmdb.sh

编辑,输入下面的代码并保存

#!/usr/bin/en sh
DATA=examples/images
rm -rf $DATA/img_train_lmdb
build/tools/convert_imageset --shuffle \
--resize_height=256 --resize_width=256 \
/home/xxx/caffe/examples/images/ $DATA/train.txt  $DATA/img_train_lmdb

设置参数-shuffle,打乱图片顺序。设置参数-resize_height和-resize_width将所有图片尺寸都变为256*256.

/home/xxx/caffe/examples/images/ 为图片保存的绝对路径。

最后,运行这个脚本文件

# sudo sh examples/images/create_lmdb.sh

就会在examples/images/ 目录下生成一个名为 img_train_lmdb的文件夹,里面的文件就是我们需要的db文件了。

 

/

       如何使用《caffe21天实战》第六章训练好的LeNet-5模型权值文件(caffe_root/examples/mnist//lenet_iter_10000.caffemodel )测试自己的手写体数据集呢,本来思路为按照这篇文章http://blog.csdn.net/sinat_30071459/article/details/50501689尝试使用ImageNet里写好的脚本create_imagenet.sh将待预测图片集直接转换为lmdb格式,之后使用命令行$ ./build/tools/caffe.bin  test  -modle  **.prototxt  -weights ***.caffemodel  -iterations n 进行测试,不过失败了。经网上查找资料,发现了以下几种解法
       (1)文章http://blog.csdn.net/roach_zfq/article/details/53426890的方法使用Matlab将图片转为mnist格式,再转换为lmdb格式,之后使用命令行./build/tools/caffe.bin  test  -modle  **.prototxt  -weights ***.caffemodel  -iterations 1 测试单张图片。貌似原书作者卜居大牛给出的思路就是这样的
   (2)文章http://blog.csdn.net/xiaohuaibao/article/details/52789466的方法则是使用了caffe提供的C++接口,主要使用了caffe_root/build/examples/cpp_classification/classification.bin,源码在caffe_root/examples/cpp_classification/classification.cpp,最后使用命令行执行bin文件,可测试单张图片;
            除此外,文章http://blog.csdn.net/lanxueCC/article/details/52948881通过修改classification.cpp实现用训练好的model文件测试多张图片的分类
       (3)文章 http://blog.csdn.net/lanxuecc/article/details/52485077给出python的做法
       当然应该还有其他做法,和我一样的小白可以看看这些,大牛自行忽略。。。

习题6.4 自己的手写体数字图片送入lenet测试


C++将数据转换为mnist格式,再运行create_mnist.sh脚本调用Caffe里的convert_mnist_data.cpp将图片转换成普通的数组格式,不是浪费时间吗,可能也只有练习C++的作用了,以后用C++的场合应该就直接修改Caffe源码来进行相关练习和测试吧。那么关于matlab的话主要参考这篇文章,图像转化为手写体mnist格式的数据,然后自己做了点微小的工作。

1.先使用PS故意画了个很挫的6,保存为28*28像素的png文件;


2.使用matlab打开它可以看到是28*28*3的矩阵,因为我使用的RGB标准,所以这里既可以在PS里直接把它改为灰度图,也可以在matlab里取三个分量的平均值或取单个通道的值也可以(因为我画的时候纯白底纯黑画笔画的);

3.将这个原始图像以mnist格式写入一个文件,类似mnist官方下载到的t10k-images.idx3-ubyte和t10k-labels.idx1-ubyte

代码如下:

clc;
clear;

imgOrigin = imread('6.png');
imgBinaryImg = imgOrigin(:,:,1);          %只取原图像一个分量,转换为灰度图像

imgMnist = fopen('test_img_ubyte', 'wb');  %w:写,如果没有自动创
magic = 2051; //大段存储
numImages = 1; //写的图片数目
numRows = 28;
numCols = 28;  
//以上四个是字节的头
fwrite(imgMnist, magic, 'int32', 0, 'ieee-be');  %ieee-be:大端存储
fwrite(imgMnist, numImages, 'int32', 0, 'ieee-be');%0貌似表是读完这个都下个之前的skip,0就是连着读,不跳
fwrite(imgMnist, numRows, 'int32', 0, 'ieee-be');  
fwrite(imgMnist, numCols, 'int32', 0, 'ieee-be');
//在这里就可以用for循环网里边写像素了  
imgBinaryImg = permute(imgBinaryImg, [2 1]); %matlab以列为主进行运算  
imgBinaryImg = reshape(imgBinaryImg, 1, numCols* numRows* numImages); %reshape按列转换
fwrite(imgMnist, imgBinaryImg, 'unsigned char');  
fclose(imgMnist);  

%将label转换为二进制
flabel = fopen('test_lable_ubyte', 'wb');  
magic = 2049;  //大端
numLabels = 1;
labels = 6; //标签值0-9
fwrite(flabel, magic, 'int32', 0, 'ieee-be');  
fwrite(flabel, numLabels, 'int32', 0, 'ieee-be');  
fwrite(flabel, labels, 'unsigned char');  
fclose(flabel);  
然后修改lenet_train_test.prototxt里的
layer {
  name: "mnist"
  type: "Data"
  top: "data"
  top: "label"
  include {
    phase: TEST
  }
  transform_param {
    scale: 0.00390625
  }
  data_param {
    source: "examples/mnist/mnist_test_lmdb"
    batch_size: 1
    backend: LMDB
  }
}

batch_size为 1,因为只有一张图片嘛

然后调用想create_mnist.sh生成caffe需要的lmdb格式数据,然而这里我一直用的是win10系统,不能直接用linux下的脚本(找不到shell命令),于是再转到ubuntu16.04下继续工作,实际后面就与常规的训练mnist步骤差不多了,Caffe官网也有tutorial.

然后修改create_mnist.sh里面创建lmdb,输入对应要转换的自己的文件名,所以其实一开始直接将原测试文件替换掉也可以,可以省去这一步。

set -e

EXAMPLE=examples/mnist
DATA=data/mnist
BUILD=build/examples/mnist

BACKEND="lmdb"

echo "Creating ${BACKEND}..."

rm -rf $EXAMPLE/mnist_test_zfq_${BACKEND}

$BUILD/convert_mnist_data.bin $DATA/test_img_ubyte \
  $DATA/test_lable_ubyte $EXAMPLE/mnist_test_zfq_${BACKEND} --backend=${BACKEND}

echo "Done.
然后调用Caffe的test语句,测试模型对于我画的6的accuracy,如下:
./build/tools/caffe test -model examples/mnist/lenet_train_test.prototxt \
-weights examples/mnist/lenet_iter_10000.caffemodel -iterations 1


输出的最后几行:

I1213 12:13:12.657213  4049 net.cpp:283] Network initialization done.
I1213 12:13:12.662529  4049 caffe.cpp:285] Running for 1 iterations.
I1213 12:13:12.668015  4049 caffe.cpp:308] Batch 0, accuracy = 1
I1213 12:13:12.668031  4049 caffe.cpp:308] Batch 0, loss = 3.26639e-05
I1213 12:13:12.668035  4049 caffe.cpp:313] Loss: 3.26639e-05
I1213 12:13:12.668042  4049 caffe.cpp:325] accuracy = 1
I1213 12:13:12.668048  4049 caffe.cpp:325] loss = 3.26639e-05 (* 1 = 3.26639e-05 loss)

有几行还不能完全看懂,不过貌似是成功了,这么丑它都能识别出来。。










 

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