Windows下将SRA格式转化为fastq格式
不怎么会使用linux,以及老是报错,只好在Windows下转换好,再传到服务器上。有点麻烦😂
在这个界面的空白处(bin下面)长按Shift键+鼠标右键,打开Windows power shell窗口:
输入
fastq-dump --gzip --split-3 -O ./fastq/ -A SRR1025xxxx.sra
#--gzip 输出压缩格式
#--split-3 针对PE双端测序,将文件拆成两个fastq格式,方便后续流程
#-o ./文件名/ 输出文件名
#-A 我们下载到的sra格式文件
就可以得到