图挖掘技术概览

图挖掘技术思维导图
  • 图匹配
    是比较图之间结构相似性的过程
    • 近似图匹配
      在数据图中搜索出与模式图在数据和节点与边属性上匹配的子图,允许噪声和错误,最大公共子图,最小公共超图来衡量两个图之间的相似程度
      • SUBDUE算法
      • LAW算法
  • 图中关键字查询
  • 频繁子图挖掘
  • 显著性子图挖掘
  • 密集子图挖掘
  • 图的聚类
    • 图的剖分
      理论上是NP-hard的,通常研究的都是图的二剖分
    • 凝聚法
      寻找社团最中心的边,不断把最相似的两个点聚到一起
      凝聚法简单,但是两个点一旦合并就永远在一个社团中无法撤销,对单个点比较敏感​
      • 算法一:直接计算相似性
      • 算法二:看两个点合并到一起后模块度变化的情况Newman2004年提出的算法
    • 分裂法
      找出最有可能位于社团之间的边,把这些边去掉,就自然产生了不同社团
    • Louvain算法(综合最好算法)
      是基于模块度最优化的启发式算法,算法两层迭代,外层的迭代是自下而上的凝聚法,内层的迭代是凝聚法加上交换策略
    • Canopy算法+K-Means
    • 基于密度的快速聚类
      找出每个类的中心点,将剩余的点按一定策略分配到每个类中
  • 图的分类
  • 不确定图的挖掘
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人类基因组计划的基本完成表明后基因组时代的到来。 人类积累的大量的生物信息数据为揭开生命奥秘提供了数据基础,生物学研究的热点由对细胞内个别基因或蛋白质功能的局部性研究,转移到以细胞内全部的基因、蛋白质及代谢产物为整体对象的系统研究。对基因调控网络、蛋白质相互作用网络、代谢路径网络等结构及功能模块的检测技术的研究,逐步把分子生物学推入系统生物学时代。 基因与蛋白质通过网状的相互作用产生更高一级的功能模块,所以,通过数学建模来设计有效的算法,在生物网络中进行功能模块的挖掘和分析,将有助于更好地研究生物体自身的功能和不同生物体之间的进化关系,为分析理解生命基本规律提供依据。 本文对基于论的经典频繁子挖掘算法进行了系统的研究和全面的总结,在此基础上提出了一种新的挖掘频繁子算法,该算法包含子的搜索算法及同构分类算法。 对子搜索问题,提出了环分布的概念,并构造了基于环分布的子搜索算法ESR(EnumerateSubgraphs based on Ring);对子同构问题,利用度序列和特征值构造了两种算法,分别用于对有向和无向的同构判别;利用同构算法对搜索出的子进行同构分类,根据分类结果得到频繁子。 管理毕业论文网www.yifanglunwen.com;音乐毕业论文www.xyclww.com;经济论文www.youzhiessay.com 教育论文www.hudonglunwen.com;医学论文网www.kuailelunwen.com;英语毕业论文www.vipvo.com 当网络规模比较大时,子数量非常庞大,同构分类的工作量很大,为此又提出了随机归类算法和Hamilton子挖掘算法,以减少同构分类的运算量。 随机归类算法是通过从子集中随机地抽取一定数量的子进行同构分类,是一种近似的算法;Hamilton子挖掘算法旨在挖掘特定类型(具有Hamilton回路)的子,以减少搜索结果集。最后对5个真实生物网络进行了仿真实验研究,找出了不同规模的频繁子,实验结果表明本文提出的算法优于现有的算法
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