Python与医疗图像5

1. 眼球运动与瞳孔改变

解析：瞳孔散大，对光反射消失。如颞叶大面积病变时出现小脑幕切迹疝时出现动眼神经麻痹。

 

2. 视觉形成过程

解析：视觉形成的大致过程是：外界物体反射的光线，依次经过角膜、瞳孔、晶状体和玻璃体，并经晶状体等的折

射，最终落在视网膜上，形成一个物象。视网膜上对光线敏感的细胞，将图像信息通过视觉神经传给大脑的一定区

域，人就产生了视觉。

 

3. 脑成像数据格式

解析：从扫描中心下载的原始数据是以DICOM数据格式存在的压缩文件，解压后，得到原始文件。来自siemens的扫

描仪的原始文件以“IMA”下为后缀。如下所示：

（1）对于功能像（fMRI）的数据，有多少个TR就有多少个IMA图像文件，即每个IMA文件就是一个完整的volume。

（2）对于 DTI数据，有n个方向，有m个b0像，就有n+m张IMA图片，即n+m个完整的volume。当然有的DTI数据有的只有一个b0像，有的有6个b0像之多。

（3）对于3D结构像数据，如果扫描了128层，就会有128张IMA图像，每张图像就是一张slice，不是volume。

 

4. nilearn.masking

解析：

（1）compute_epi_mask(epi_img[, lower_cutoff, …])

（2）compute_multi_epi_mask(epi_imgs[, …])

（3）compute_background_mask(data_imgs[, …])

（4）compute_multi_background_mask(data_imgs[, …])

（5）intersect_masks(mask_imgs[, threshold, …])

（6）apply_mask(imgs, mask_img[, dtype, …])

（7）unmask(X, mask_img[, order])

 

5. EPI（Echo-Planar Imaging）

解析：回波平面成像。

 

6. FMRI数据预处理方法

解析：

（1）对齐：在FMRI序列当中，由于人为的因素而引起的误差是很严重的，例如头部的微小移动。因此在处理数据之

前应当将这些人为的因素减小到最小。

（2）标准化：由于个体之间存在差异，在提取个体之间的均值信号或者在标准空间的坐标系统下描述激活区时，需

要将许多个体的图像形变至同一标准空间，即图像空间标准化。目前最常用的是Talairach和Tournoux标准脑图谱。

（3）配准：为了功能激活区的精确定位，通常将功能信息定位在分辨率较高的解剖图像（比如T1加权像）上，这就

需要将功能图像和解剖图像进行配准。

（4）平滑：平滑主要有两个作用，即增加信噪比；可以对于图像部分效果进行增强。

 

7. VM，GM和CSF

解析：脑白质（White Matter，VM），脑灰质（Grey Matter，GM），脑脊液（Cerebrospinal Fluid，CSF）。

 

8. The Allen Brain Atlas

解析：这是一个基于网页技术的数据库，提供了高分辨率的解剖图、基因组范围的原位杂交图以及微阵列数据，包括了人，大鼠，小鼠，转基因鼠等全脑基因表达三维图谱，揭示区域性基因表达和脑生理功能间的相互关系。

 

9. 孤独症

解析：孤独症（autism），又称自闭症或孤独性障碍（autistic disorder）等，是广泛性发育障碍（pervasive developmental disorder，PDD）的代表性疾病。《DSM-IV-TR》将PDD分为5种：孤独性障碍、Retts综合征、童年瓦解性障碍、Asperger综合征和未特定的PDD。其中，孤独性障碍与Asperger综合征较为常见。

 

10. 中枢神经系统

解析：神经系统的主要部分。包括位于椎管内的脊髓和位于颅腔内的脑，是反射活动的中心部位。其位置常在动物体的中轴，由明显的脑神经节、神经索或脑和脊髓以及它们之间的连接成分组成。在中枢神经系统内大量神经细胞聚集在一起，有机地构成网络或回路。中枢神经系统是接受全身各处的传入信息，经它整合加工后成为协调的运动性传出，或者储存在中枢神经系统内成为学习、记忆的神经基础。人类的意识、心理、思维活动也是中枢神经系统的功能。

 

11. 胼胝体

解析：胼胝体是哺乳类真兽亚纲的特有结构，位于大脑半球纵裂的底部，连接左右两侧大脑半球的横行神经纤维束，是大脑半球中最大的连合纤维。这些神经纤维在两半球中间形成弧形板，其后端叫压部，中间叫体，前方弯曲部叫膝，膝向下弯曲变簿叫嘴。组成胼胝体的纤维向两半球内部的前、后、左、右辐射，连系额、顶、枕、颞叶，其下面构成侧脑室顶。人和大多数哺乳动物的胼胝体都属于大脑的髓质。

 

12.FLAIR

解析：磁共振成像液体衰减反转恢复序列（Fluid Attenuated Inversion Recovery，FLAIR）。在脑、脊髓MRI（核磁共振）中常用。在T2WI中可抑制脑脊液的高信号，使邻近脑脊液、具有高信号（长T2）的病变得以显示清楚。FLAIR序列属于反转恢复序列（inversion recovery，IR），IR序列是属于获得MRI图像的技术中的序列技术。IR序列主要采用180°一90°一180°脉冲组合，在所有序列技术里，图像信息相对较多，但扫描时间相应地也较长。IR序列目前主要包括两种，一种就是FLAIR序列，另一种是STIR序列。

 

13.DWI

解析：DWI（Diffusion Weighted Imaging）是目前惟一能够检测活体组织内水分子扩散运动的无创方法。

 

14.纵向课题和横向课题区别

解析：纵向课题是指有各级政府指定的科研行政单位代表政府立项的课题。如国家科技部、省科技厅、市科技局，国家社科联、省社科联、市社科联，及教育部、教育厅等。
[1]横向课题就是当地政府、企事业单位托付你做的课题，比方规划项目、技术改造之类的，纵向课题是指上级科技主管部门或组织同意立项的各类方案(规划)、基金项目。
[2]一般来说纵向课题研究周期比较长，需要多人甚至团队合作完成，所需要的课题资料也很多，而横向课题相比较而言，周期就比较短了，应用性也比较强，企业大多需要的是横向课题研究。

 

参考文献：

[1] OpenfMRI：https://openfmri.org/