首先从DICOM文件转化成nii文件。
然后使用运动校正。运动censor。
将图片没有数据的地方补一些零,防止一些数据因为超出边界而丢失。
之后将 T1 与 T2 数据对齐(使用 volreg 进行运动校正的基础相同),根据 T1 和 T2 之间的错位程度,选择 big_move或Giant_move,如果move的不大,也可以不选。
使用FSL做topup失真校正。
然后做时间切片校正,因为飞利浦的软件bug,time slicing的数据没记录上去。所以我没法处理了。
全文完。