安装linux子系统参考这篇文章:Windows中安装linux子系统(Ubuntu) - 知乎 (zhihu.com)
我安装了Debian这个软件来运行linux。没有安装ssh
然后直接在linux系统安装anaconda软件,参考:(80条消息) anconda在虚拟机linux安装教程_疯子vs年华的博客-CSDN博客
打开我的Debian/Ubuntu软件,登陆用户不是root,这时候先切换到root用户: su - root,再输入密码就可以了
要使用anaconda来创建环境,可以用conda create。譬如要创建一个名叫smpl的、使用3.6.13版本的python环境:conda create -n smpl python=3.6.13
想要查看安装了的环境,可以输入以下:conda env list。这里有cotr和smpl两个环境
要使用某个环境:conda activate smpl 。退出环境:conda deactivate
进入某个环境之后,这个环境要安装什么库,可以一个个库使用这样的方式安装: conda install backcall==0.2.0 或者 pip install backcall==0.2.0
也可以把需要安装的库全部写到一个txt文档里,
然后使用这个命令行:pip install -r requirements.txt
当然,执行上一步之前,要先把路径cd到txt文档所在的文件夹:cd /usr/bin/COTR-master
要查找linux子系统下的文件在哪,我的是在这个文件夹下:
\\wsl.localhost\Debian\usr\bin\COTR-master
至于怎么把外部的文件及文件夹移动到linux文件夹里面,可以通过这句命令行:
mv /mnt/c/Users/86184/Downloads/ncbi-blast-2.13.0+-x64-arm-linux.tar.gz /home/bio_kang/software/
意思是把ncbi-blast-2.13.0+-x64-arm-linux.tar.gz这个在c盘的文件移动到linux系统下的/home/bio_kang/software/路径里
最后,pip install -r requirements.txt 可能会出现某些库安装不上的情况,可以在某环境下通过 conda list 查看安装了的库
当所有库都安装好了之后,cd去脚本所在路径,就可以愉快地使用了: python 脚本名字.py
楼主也是第一次使用linux,虽然在同事的帮助下才比较快速地使用上linux,但期间心态也挺崩的。写篇文章记录下这一两周使用以来的注意事项,各位打工人共勉