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原创 RNA-seq 流程、问题总结(一)
这是2012 年的3月份的一篇nature protocol ,下面是我作为一个RNA-seq 方面的菜鸟在根据这个protocol 跑流程时遇到的问题及解决的方法,现总结如下:一、果蝇全基因组下载Fruit fly iGenome packages (Ensembl build; download via the TopHat and Cufflinks websites, along
2012-10-31 09:44:28 13755 2
转载 RPKM简介
RNA-seq是透过次世代定序的技术来侦测基因表现量的方法,在衡量基因表现量时,若是单纯以map到的read数来计算基因的表现量,在统计上是一件相当不合理事,因为在随机抽样的情况下,序列较长的基因被抽到的机率本来就会比序列短的基因较高,如此一来,序列长的基因永远会被认为表现量较高,而错估基因真正的表现量,所以Ali Mortazavi等人在2008年提出以RPKM在估计基因的表现量。RPKM是
2012-10-10 11:30:05 3124
空空如也
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