基于python的snakemake框架搭建生物信息学分析流程笔记总结
Paper: A review of bioinformatics pipeline framework 文献总结了不同流程的又去点,可以看下。如果实验室既不是纯粹的生物学试验(不需要workbench这种UI界面),也不需要高性能基于类的流程设计, 不太好选, 主要原则是投入和产出比如果实验室进行的是重复性的研究,那么就需要对数据和软件进行版本控制, 建议是 configuration-based pipelines如果实验室做的是探索性的概念证明类工作(exploratory proo.
原创
2020-07-16 22:33:58 ·
1677 阅读 ·
0 评论