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原创 GATK3.2.2小结

经过几天的摸索和网上资料的查询对GATK软件有点小心得，现总结如下： 1. fasta文件最好用定位到染色体上的数据，可以不用注释VCF文件（GVF），但如果用VCF文件保证以下几个条件： 1）VCF染色体必须和fasta的染色体数目一致，顺序一致 2）VCF的位点必须从小到大排序 3）VCF的碱基有可能有其他符号，如“~”等，要去除干净 2. 做之前分别使用picard

2014-08-02 11:24:23 6105 5

编译好的过滤fq
fq 过滤 编译 处理solexa的结果文件

2013-11-22

vim自动补全
vim自动补全，比较简单的一种，解压在.vim里面

2013-08-12

rna小流程化
rna seq 流程

2013-06-14

WGCNA流程包
WGCNA 聚类 网络 基于表达量权重 相关性

2013-06-09

K-means程序
K-means算法及相关程序，输出相应结果

2013-06-05

PCA3D（EPD）
PCA3D（EPD）画出3D的权重图，使用epd软件

2013-06-05

PCA 3D程序（EPD）
PCA 3D PCA 3D PCA 3D PCA 3D PCA 3D PCA 3D PCA 3D

2013-06-05

perl SVG包
perl SVG包

2013-03-19

过滤Solexa reads
过滤 Solexa reads

2013-03-19

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