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原创 基于CAT12的report数据做QC质量检查,排除离群点——IQR&欧拉数
前言这段时间被质量检查QC折磨的很惨,各种检查,要检查提取的被试数据质量是否有问题,病人组和正常组中是否出现个别质量差别较大,还有两组被试的质量方面是否有差异,会不会影响我们之后的数据分析处理。这都是需要考虑的,还要检查自己的代码提取的数据是否跟cat12计算的是不是一样的,这样便可以不需要cat12的GUI界面也能提取所需的指标。脱离GUI还有个好处是可用服务器直接调用,便于操作。由于看到一篇文章,在做结构时,采用欧拉数来排除可能会影响结果的被试。根据这个,下面写了一个小函数来提取IQR和欧拉数,来排除
2021-03-28 14:36:50 2234 12
原创 基于cat12搞定SBM的ROI的统计分析——vertex水平和ROI水平的双样本T检验
前言一、Atlas皮层图谱介绍二、SBM分析——主要以皮层四种常用指标中的厚度(thickness)和沟深(depth)为主
2021-02-02 15:25:56 6321 14
原创 基于cat12搞定VBM的ROI分析——vertex水平和ROI水平的双样本T检验
前言一、什么是ROI分析二、ROI的皮层指标提取三、终极目标找差异
2021-01-30 11:35:25 13482 60
原创 基于Pycharm的文件批处理1(python脚本笔记记录)——复制所需文件到指定文件夹中,文件夹按照被试编号命名
前言一、代码实现功能介绍二、代码块简介第一步:读取文件名import osimport shutilDIR = "D:\\DATA\\TEST"def Movefile(DIR): # 定义函数 j = 0 for root1, path1, filename in os.walk(DIR): for i in range(len(filename)):
2021-01-29 16:08:41 1189 1
原创 基于cat12和SPM12进行VBM&SBM数据分析笔记1——数据预处理
基于cat12数据分析基础教程笔记今年是小编步入研究生生活的第一年,研究方向待定,但主要以磁共振成像为主,以后会不断地总结这方面的知识,涉及MRI扫描,数据分析基础方法理论,软件操作教程,文献阅读笔记总结等等,用来记录我的研究生三年学习过程。编写尽量简洁明了,通俗易懂,本就是小白,也能体会小白的痛。不过这也要谢谢一个人手动@小白(网名),是他教我要把自己所学的写下来,讲出来才能真正的做到输入和输出,查漏补缺。而cat12软件操作是我面临的第一个数据分析的训练,写的可能也不会非常到位,还望各位专业人士指出改
2020-10-14 14:22:12 33549 115
CAT12.7版本安装包
2022-05-17
空空如也
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