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dcmtk程序包简介
该文简单列出了dcmtk程序包的简介,包括主要接口类的简单说明,可用工具以及一些例子。下一步工作准备详细分析每个程序包中的接口类功能,并结合源码和dicom文档分析其实现过程。
一、Config程序包
-config目录下的文档:
--config.txt:
指出你编辑的任何.h .c .cc文件首先必须包含该目录下的头文件#include "osconfig.h"
--dirstruc.txt:
给出了dcmtk项目的项目目录结构,这个用cmake会自动生成
--envvars.txt:
这个文件比较重要,它指出了一些运行时环境变量,这些变量可能会影响dcmtk的工具和库的使用,这些变量包括:
---DCMDICTPATH:影响dcmdata
---TCP_BUFFER_LENGTH:影响dcmnet
---TCP_NODELAY:影响dcmnet
---TMPDIR:影响dcmnet
--macros.txt:
这个文件也特别重要,它给出了很多编译时的宏,这些宏可能会影响dcmtk的工具和库的使用。大部分的宏可以用来激活一些实验性的或很少需要的特性,另外有一些是用来取消某些功能。要尽量谨慎使用。详细见文档。
--modules.txt:
这个文件讲述如何自己配置各个模块,不需要掌握。
-config的include目录下的文件
--osconfig.h:这个文件是必须包含在所有.h .c文件中的,其中指出在win32环境下包含"dcmtk/config/cfwin32.h"文件
--cfwin32.h:包含了大量的宏定义。***如果需要查找某个宏的定义,可到这个文件中查找***
二、ofstd程序包
-ofstd:作为一般目的的类库。
这个模块包含了一般目的的类库,这些类所描述的对象概念并非在Dicom标准中特有。它们广泛的在toolkit中使用。主要包含下面的类
--OFCommandLine:处理命令行参数,头文件在ofcmdln.h。***详情需要结合具体的代码来理解***
--OFCondition:描述条件码的一般类。头文件在ofcond.h。***详情需要结合具体的代码来理解***
--OFConsole:是一个singleton(孤立)类***不明白***。提供线程安全的对标准输出流和错误流的访问。允许以多线程的方式同时创建输出。***多线程的东西不太明白,它的作用应该是在多线程中实现指定线程的输出流进行输出操作***
--OFList:是一个双向链表模板类,接口是STL list类中的一个子集。头文件在oflist.h。***不明白为什么不直接用标准库中的list,兼容性应该更好啊***
--OFStack:是一个堆栈模板类,接口是STL stack类中的一个子集。头文件在ofstack.h。***不明白为什么不直接用标准库中的stack,兼容性应该更好啊***
--OFStandard:包含大量帮助函数组成的类,用来包含大量“全局”帮助函数。注意全部都是静态函数。其中的一些函数实现调用了windows API函数,如fileexists()。头文件在ofstd.h。***如果需要一些全局函数,可以到这里了找一找。***
--OFString:一个简单的string类,实现了std::string的一个子集,没有iterator或trait,在速度上也没有优化。头文件在ofstring.h。***不明白为什么不直接用标准库中的string,兼容性应该更好啊***
--除了上述的主要类以外,还包含了大量辅助类,用来支撑上述类的功能。***详情需要结合具体的代码来理解***
三、dcmdata程序包
-dcmdata:一个数据编码/解码库和可用的工具
这个模块包含了一些类来管理Dicom数据结构和文件。同时它也提供了对DICOMDIR文件的支持以满足Dicom storage media(存储介质)的需要。
主要的接口类有:
--DcmFileFormat:a class handling the DICOM file format (with meta header) 。头文件在dcfilefo.h。***详情在单独的文档中分析***
--DcmDataset:a class handling the DICOM dataset format (files without meta header) 。头文件在dcdatset.h。***详情在单独的文档中分析***
--DcmItem:a class representing a collection of DICOM elements。头文件在dcitem.h。***详情在单独的文档中分析***
--DcmElement:abstract base class for all DICOM elements。头文件在dcelem.h。***详情在单独的文档中分析***。它的派生类包括:DcmAttributeTag\DcmByteString\DcmFloatingPointDouble\DcmFloatingPointSingle\DcmOtherByteOtherWord\DcmSequenceOfItems\DcmSignedLong\DcmSignedShort\DcmUnsignedLong\DcmUnsignedShort
工具:这个模块包含了下面的命令行工具:
dcm2xml: Convert DICOM file and data set to XML
dcmconv: Convert DICOM file encoding
dcmcrle: Encode DICOM file to RLE transfer syntax
dcmdrle: Decode RLE-compressed DICOM file
dcmdump: Dump DICOM file and data set
dcmftest: Test if file uses DICOM part 10 format
dcmgpdir: Create a general purpose DICOMDIR
dcmodify: Modify DICOM files
dump2dcm: Convert ASCII dump to DICOM file
xml2dcm: Convert XML document to DICOM file or data set
***暂时不对命令行工具进行详细的分析***
举例:
--调入一个DICOM文件,输出病人姓名
DcmFileFormat fileformat;
OFCondition status = fileformat.loadFile("test.dcm");
if (status.good())
{OFString patientsName;
If (fileformat.getDataset()->findAndGetOFString(DCM_PatientsName, patientsName).good())
{
} else
} else
cerr << "Error: cannot read DICOM file (" << status.text() << ")" << endl;
--创建一个DICOM dataset数据集,并保存为文件
char uid[100];
DcmFileFormat fileformat;
DcmDataset *dataset = fileformat.getDataset();
dataset->putAndInsertString(DCM_SOPClassUID, UID_SecondaryCaptureImageSto
dataset->putAndInsertString(DCM_SOPInstanceUID, dcmGenerateUniqueIdentif
dataset->putAndInsertString(DCM_PatientsName, "Doe^John");
dataset->putAndInsertUint8Array(DCM_PixelData, pixelData, pixelLength);
OFCondition status = fileformat.saveFile("test.dcm", EXS_LittleEndianExplicit);
if (status.bad())
cerr << "Error: cannot write DICOM file (" << status.text() << ")" << endl;
--如何为多个文件创建一般目的的DICOMDIR
DicomDirInterface dicomdir;
OFCondition status = dicomdir.createNewDicomDir();
if (status.good())
{while ( )
status = dicomdir.writeDicomDir();
if (status.bad())
} else
cerr << "Error: cannot create DICOMDIR (" << status.text() << ")" << endl;
四、dcmimgle程序包
dcmimgle是一个图像处理库和可用的工具模块,它包括了对DICOM单色图像的访问和显示。对颜色图像的支持由dcmimage模块提供,对JPEG压缩图像的支持由dcmjpeg模块支持。
主要接口类:
--DicomImage: 为dcmimgle/dcmimage模块提供接口类。主要目的是图像显示。在dcmimage.h中定义。
--DiDisplayFunction: Class to handle hardcopy and softcopy device characteristics file and manage display LUTs (for calibration). 在didispfn.h中定义。
可用工具:
--dcmdspfn: Export standard display curves to a text file
--dcod2lum: Convert hardcopy characteristic curve file to softcopy format
--dconvlum: Convert VeriLUM files to DCMTK display files
举例:
--载入一幅DICOM单帧单色图像,并显示其像素数据。
DicomImage *image = new DicomImage("test.dcm");
if (image != NULL)
{if (image->getStatus() == EIS_Normal)
{
} else
}
delete image;
五、dcmimage程序包
dcmimage模块为dcmimgle模块提供对彩色图像的支持。对单色图像的支持由dcmimgle提供,对JPEG压缩图像的支持由dcmjpeg模块支持。
主要接口类:
--DicomImage: 在dcmimgle中已介绍。
工具:
--dcm2pnm: Convert DICOM images to PPM/PGM, PNG, TIFF or BMP
--dcmquant: Convert DICOM color images to palette color
--dcmscale: Scale DICOM images
举例:
--载入一幅DICOM单帧图像(单色或彩色),并显示其像素数据。
#include "diregist.h"
DicomImage *image = new DicomImage("test.dcm");
if (image != NULL)
{
if (image->getStatus() == EIS_Normal)
{
} else
}
delete image;
六、dcmjpeg程序包
dcmjpeg提供了一个压缩/解压缩库以及可用工具。该模块包含一些类,可将DICOM图像对象在非压缩和JPEG压缩表示(传输协议)之间转换。无失真和有失真JPEG处理都被支持。这个模块实现了一族codec(编码解码器,由DcmCodec类派生而来),可以将这些codec在codec list中注册,codec list是由dcmdata模块保存的。
主要接口类:
--DJEncoderRegistration: 一个singleton(孤立)类,为所有支持的JPEG处理注册编码器。在djencode.h中定义。
--DJDecoderRegistration: 一个singleton(孤立)类,为所有支持的JPEG处理注册解码器。在djdecode.h中定义。
--DJCodecEncoder: JPEG编码器的一个抽象codec类。This abstract class contains most of the application logic needed for a dcmdata codec object that implements a JPEG encoder using the DJEncoder interface to the underlying JPEG implementation. This class only supports compression, it neither implements decoding nor transcoding. 在djcodece.h中定义。
--DJCodecDecoder: JPEG解码器的一个抽象codec类。This abstract class contains most of the application logic needed for a dcmdata codec object that implements a JPEG decoder using the DJDecoder interface to the underlying JPEG implementation. This class only supports decompression, it neither implements encoding nor transcoding.
工具:
dcmcjpeg: Encode DICOM file to JPEG transfer syntax
dcmdjpeg: Decode JPEG-compressed DICOM file
dcmj2pnm: Convert DICOM images to PGM, PPM, BMP, TIFF or JPEG
dcmmkdir: Create a DICOMDIR file
举例:
--用无失真JPEG压缩一幅DICOM图像文件。
DJEncoderRegistration::registerCodecs(); // register JPEG codecs
DcmFileFormat fileformat;
if (fileformat.loadFile("test.dcm").good())
{
DcmDataset *dataset = fileformat.getDataset();
DcmItem *metaInfo = fileformat.getMetaInfo();
DJ_RPLossless params; // codec parameters, we use the defaults
// this causes the lossless JPEG version of the dataset to be created
dataset->chooseRepresentation(EXS_JPEGProcess14SV1Transfer
// check if everything went well
if (dataset->canWriteXfer(EXS_JPEGProcess14SV1Transfer
{
}
}
--解压缩一幅JPEG压缩的DICOM图像文件。
DJDecoderRegistration::registerCodecs(); // register JPEG codecs
DcmFileFormat fileformat;
if (fileformat.loadFile("test_jpeg.dcm").good())
{
DcmDataset *dataset = fileformat.getDataset();
// decompress data set if compressed
dataset->chooseRepresentation(EXS_LittleEndianExplicit, NULL);
// check if everything went well
if (dataset->canWriteXfer(EXS_LittleEndianExplicit))
{
}
}
七、dcmnet程序包
dcmnet是一个网络库及可用工具。该模块包含了实现DICOM网络通信的所有函数集,即:DICOM上层有限状态机(DICOM Upper Layer Finite State Machine),关联控制服务元素(Association Control Service Element, ACSE)以及DICOM消息服务元素(DICOM Message Service Element, DIMSE)。
主要接口:该模块的主要接口包括在文件assoc.h和dimse.h中定义的大量结构和函数。
--assoc.h: 这个文件包含程序,为DICOM应用提供关联管理。它维护描述活动关联的结构,提供对关联特定信息的访问。也提供程序帮助关联协议association negotiation(presentation contexts, abstract syntaxes, transfer syntaxes, maximum PDU length, and other extended negotiation)。该包使用了DICOM上层机制接收/发送关联请求/响应。每一个活动的关联由T_ASC_Association结构表示,包含了所有相关的信息。模块前缀ASC_。
--dimse.h: 这个文件包含程序,为DICOM应用提供dimse层的服务。
工具:
--echoscu: DICOM verification (C-ECHO) SCU
--findscu: DICOM query (C-FIND) SCU
--movescu: DICOM retrieve (C-MOVE) SCU
--storescp: DICOM storage (C-STORE) SCP
--storescu: DICOM storage (C-STORE) SCU
--termscu: DICOM termination SCU
举例:
--一个简单的Echo SCU(Verification Service Class SCU)。大多数错误处理代码省去了,在Win32上的特定代码如WinSock初始化也省去了。
T_ASC_Network *net; // network struct, contains DICOM upper layer FSM etc.
ASC_initializeNetwork(NET_REQUESTOR, 0, 1000 , &net);
T_ASC_Parameters *params; // parameters of association request
ASC_createAssociationParamet
// set calling and called AE titles
ASC_setAPTitles(params, "ECHOSCU", "ANY-SCP", NULL);
// the DICOM server accepts connections at server.nowhere.com port 104
ASC_setPresentationAddresses
// list of transfer syntaxes, only a single entry here
const char* ts[] = { UID_LittleEndianImplicitTran
// add presentation context to association request
ASC_addPresentationContext(params, 1, UID_VerificationSOPClass, ts, 1);
// request DICOM association
T_ASC_Association *assoc;
if (ASC_requestAssociation(net, params, &assoc).good())
{
if (ASC_countAcceptedPresentatio
{
}
}
ASC_releaseAssociation(assoc); // release association
ASC_destroyAssociation(&assoc); // delete assoc structure
ASC_dropNetwork(&net); // delete net structure
八、dcmpstat程序包
dcmpstat: 一个描述状态(presentation state)库和可用工具。This module contains classes that implement a high-level API for the DICOM Softcopy Grayscale Presentation State Storage SOP Class. It also contains various support classes that are used by DICOMscope, a free DICOM viewer that has been developed as a demonstrator for presentation states. See http://dicom.offis.de/dscope。
主要接口:
--DVPresentationState: 一个灰度软拷贝描述状态。这个类管理着一个描述状态对象的数据结构。描述状态可以创建、读、写和更改。在dvpstat.h中定义。
--DVInterface: 这个接口类是用来帮助软拷贝描述状态浏览器工作的。这个类管理着数据库机制,允许开始和停止网络交互,并访问图像和描述状态。在dviface.h中定义。
--DVPSStoredPrint: the representation of a Stored Print object。在文件dvpssp.h中定义。
工具:
dcmmkcrv: Add 2D curve data to image
dcmmklut: Create DICOM look-up tables
dcmp2pgm: Read DICOM image and presentation state and render bitmap
dcmprscp: DICOM basic grayscale print management SCP
dcmprscu: Print spooler for presentation state viewer
dcmpschk: Checking tool for presentation states
dcmpsmk: Create DICOM grayscale softcopy presentation state
dcmpsprt: Read DICOM images and presentation states and render print job
dcmpsrcv: Network receive for presentation state viewer
dcmpssnd: Network send for presentation state viewer
举例:
--给一幅DICOM图像创建一个缺省的描述状态
DcmFileFormat infile;
DcmFileFormat outfile;
if (infile.loadFile("image.dcm").good())
{
DVPresentationState pstate; // presentation state handler
if (pstate.createFromImage(*infile.getDataset()).good())
{
}
}
--应用一个描述状态中的灰度变换管道给一幅DICOM图像
DcmFileFormat imagefile;
DcmFileFormat gspsfile;
if (imagefile.loadFile("image.dcm").good() &&
{
DVPresentationState pstate; // presentation state handler
if (pstate.read(*gspsfile.getDataset()).good()) // parse gsps object
{
}
}
九、dcmsign程序包
dcmsign是一个数字签名库和可用工具。这个模块包含了一些类,以创建DICOM数据集中的数字签名,并验证和删除签名。这个模块需要扩展的OpenSSL库的支持。
主要接口:
--DcmSignature: this class provides the main interface to the dcmsign module - it allows to create, examine and verify digital signatures in DICOM datasets or items. The methods in this class do not handle digital signatures embedded in sequence items within the dataset, other than providing helper functions that allow to locate and attach the sub-items separately. 在dcsignat.h中定义。
--SiSecurityProfile: 所有安全框架的抽象基类。abstract base class for all security profiles.在sisprof.h文件中定义。
--SiCertificate: a class representing X.509 public key certificates. 在sicert.h文件中定义。
--SiPrivateKey: a class representing a private key. 在siprivat.h文件中定义。
--SiMAC: a base class for all classes that implement hash functions. 在simac.h文件中定义。
工具:
dcmsign: Sign and Verify DICOM Files
举例:
--验证一个DICOM文件中的所有签名。
DcmFileFormat fileformat;
if (fileformat.loadFile("test.dcm").good())
{
int counter = 0;
int corrupt_counter = 0; // counts signatures that failed verification
DcmDataset *dataset = fileformat.getDataset();
DcmStack stack;
DcmSignature signer;
DcmItem *sigItem = DcmSignature::findFirstSignatureItem(*dataset, stack);
while (sigItem) // browse through items that contain digital signatures
{
}
if (counter == 0)
else
}
--给一个DICOM文件增加签名。
DcmFileFormat fileformat;
if (fileformat.loadFile("test.dcm").good())
{
DcmDataset *dataset = fileformat.getDataset();
SiCreatorProfile profile; // select the "RSA Creator Profile"
SiRIPEMD160 mac;
DcmSignature signer;
SiCertificate cert;
if (cert.loadCertificate("certificate.pem", X509_FILETYPE_PEM).bad())
{
}
SiPrivateKey key; // private key, must be unencrypted here
if (key.loadPrivateKey("privkey.pem", X509_FILETYPE_PEM).bad())
{
}
signer.attach(dataset); // connect handler to data set
if (signer.createSignature(key, cert, mac, profile).good())
{
}
}
十、dcmsr程序包
dcmsr是一个结构化报表库和可用工具。这个模块包括一些类来读、写、创建、修改、访问、打印和显示DICOM结构化报表文档。所支持的SOP类列表由DSRTypes::E_DocumentType提供。
主要接口:
--DSRDocument: Interface class for 'dcmsr' (DICOM Structured Reporting Documents). This class supports reading, writing, creation, printing and rendering of DICOM SR documents (according to DICOM PS 3.x-2004, formerly known as Supplement 23). The list of supported SOP classes is available in file "dsrtypes.h". 在dsrdoc.h中定义。
--DSRDocumentTree: 管理SR文档树的类。在dsrdoctr.h中定义。
--DSRContentItem: Interface class for content items. This class allows to access the document tree nodes without using any pointers. 在dsrcitem.h中定义。
--DSRCodedEntryValue: Class for coded entry values. 在dsrcodvl.h中定义。
工具:
dsr2html: Render DICOM SR file and data set to HTML
dsr2xml: Convert DICOM SR file and data set to XML
dsrdump: Dump DICOM SR file and data set
xml2dsr: Convert DICOM SR file and data set to XML
举例:
--载入一个DICOM结构化报表,并以HTML格式显示其内容。
DcmFileFormat fileformat;
OFCondition status = fileformat.loadFile("test.dcm");
if (status.good())
{
DSRDocument document;
status = document.read(*fileformat.getDataset());
if (status.good())
{
} else
} else
cerr << "Error: cannot read DICOM file (" << status.text() << ")" << endl;
--创建一个DICOM结构化报告,并将其存为文件。
DSRDocument document;
document.setPatientsName("Doe^John");
document.getTree().addContentItem(DSRTypes::RT_isRoot, DSRTypes::VT_Container);
document.getTree().getCurrentContentItem().setConceptName(DSRCodedEntryValue());
document.getTree().addContentItem(DSRTypes::RT_hasObsContext, DSRTypes::VT_Code, DSRTypes::AM_belowCurrent);
DcmFileFormat fileformat;
OFCondition status = document.write(*fileformat.getDataset())
if (status.good())
{
status = fileformat.saveFile("test.dcm", EXS_LittleEndianExplicit);
if (status.bad())
} else
cerr << "Error: cannot write SR document (" << status.text() << ")" << endl;
--读取文档树的属性,并直接修改。
DSRDocument document(DSRTypes::DT_KeyObjectDoc);
document.getTree().addContentItem(DSRTypes::RT_isRoot, DSRTypes::VT_Container);
DSRCodedEntryValue *codePtr = document.getTree().getCurrentContentItem().getConceptNamePtr();
if (codePtr != NULL)
codePtr->setCode("113000", "DCM", "Of Interest");
document.getTree().addContentItem(DSRTypes::RT_contains, DSRTypes::VT_Image);
DSRImageReferenceValue *imagePtr = document.getTree().getCurrentContentItem().getImageReferencePtr();
if (imagePtr != NULL)
{
imagePtr->setValue(DSRImageReferenceValue(UID_UltrasoundMultiframeImag
imagePtr->setPresentationState(DSRCompositeReferenceVal
imagePtr->getFrameList().addItem(2);
imagePtr->getFrameList().addItem(5);
}
十一、dcmtls程序包
dcmtls是网络库的安全扩展。This module contains classes that implement DICOM network communication tunneled through a Transport Layer Security (TLS) connection, conforming to the DICOM "Security Enhancements One" extension (formerly Supplement 31). This module requires the external OpenSSL library.
主要接口:
--DcmTLSTransportLayer: factory class which creates secure TLS transport layer connections and maintains the parameters common to all TLS transport connections in one application (e.g. the pool of trusted certificates, the key and certificate to be used for authentication and the list of ciphersuite to be used for association negotiation.)。在tlslayer.h文件中定义。
--DcmTLSConnection: this class represents a TLS (Transport Layer Security) V1 based secure transport connection.
举例:
--TLS的关联请求应用
T_ASC_Network *net;
T_ASC_Parameters *params; // we just assume these pointers to be valid
// create TLS object that initializes the random generator through a file
// "random.dat" containing random data (1 kByte is sufficient).
DcmTLSTransportLayer *tLayer = new DcmTLSTransportLayer(
DICOM_APPLICATION_REQUESTOR, "random.dat");
if (TCS_ok != tLayer->setPrivateKeyFile("privkey.pem", SSL_FILETYPE_PEM))
{
cerr << "unable to load private key" << endl;
return;
}
if (TCS_ok != tLayer->setCertificateFile("certificate.pem", SSL_FILETYPE_PEM))
{
cerr << "unable to load certificate" << endl;
return;
}
// enable the TLS_RSA_WITH_3DES_EDE_CBC_SHA ciphersuite
tLayer->setCipherSuites(SSL3_TXT_RSA_DES_192_CBC3_SHA);
// accept any certificate from the remote site (not recommended)
tLayer->setCertificateVerificati
// register and activate TLS layer
ASC_setTransportLayer(net, tLayer, 1);
ASC_setTransportLayerType(params, 1);
十二、dcmwlm程序包
dcmwlm是一个设备工作表(Modality Worklist)数据库服务器。这个模块包含类,作为一个SCP,为实现DICOM Modality Worklist Management Service的应用提供支持。基于这些类的SCP可以从C-Find-RSP返回消息中找到相关信息。
主要接口:
--WlmActivityManager: This class encapsulates data structures and operations for basic worklist management service class providers. 在wlmactmg.h文件中定义。
--WlmDataSource: This class encapsulates data structures and operations for connecting to an arbitrary data source in the framework of the DICOM basic worklist management service. 在wlds.h文件中定义。
--WlmDataSourceFileSystem: This class encapsulates data structures and operations for connecting to a file-based data source in the framework of the DICOM basic worklist management service. 在wldsfs.h文件中定义。
--WlmFileSystemInteraction
工具:
wlmscpfs: DICOM Basic Worklist Management SCP (based on data files)
举例:
For an example of how to use the main interface classes of this module, see file 'wlmscpfs.cc' (containing the main function of the corresponding tool) and file 'wlcefs.cc' (making use of the WlmActivityManager class that manages all activities a corresponding SCP has to manage).
十三、dcmqrdb程序包
dcmqrdb是一个图像数据库服务器。This module contains a simple image archive that manages a number of storage areas and allows images to be stored in these storage areas using the DICOM Storage Service Class. It also allows image attributes to be queried and images to be retrieved using the DICOM Query/Retrieve Service Class.
工具:
dcmqridx: Register a DICOM image file in an image database index file
dcmqrscp: DICOM image archive (central test node)
dcmqrti: The Terminal Initiator Telnet Client Program
文件:下面文件提供进一步信息。
--dcmqrcnf.txt:
http://blog.csdn.net/diqiucun666/archive/2008/09/02/2866908.aspx
基于DCMTK的DICOM相关程序编写攻略
前言:
三、基于DCMTK的DICOM相关程序。
4、不成功的可能有如下一些问题。
原因:缺少AFX_IDS_UNTITLED的字符串
解决:在资源文件的STRING TABLE中加入 ID= AFX_IDS_UNTITLED的键值。
fatal error C1189: #error :
原因:
解决:在Project->Settings->Preprocessor definitions中去掉 _AFXDLL项。
LIBCMTD.lib(dbgheap.obj):error LNK2005: _malloc already defined in msvcrtd.lib(MSVCRTD.dll)
原因:由于VC在编译时试图从两个不同的库中写入同一个函数代码,只要忽略这些相冲突的默认库就可以解决。
解决:在Project->Settings->Link->Category->Input—>Ignore Liberies中加入
相应的msvcprtd.lib,msvcrtd.lib等。
另一种解决:保证自己的编译环境为:
还有可以:
后来尝试了很多方法,经过摸索,最后得出解决方法:
在Preprocessor中定义_AFXDLL
如果它提示:fatal error C1189: #error : Please use the /MD switch for _AFXDLL builds
就这样改:
C/C++->Code Generation->Multithread DLL (即实现/MD选项)
dcmdata.lib(dcuid.obj) : error LNK2001: unresolved external symbol _Netbios@4
原因:缺少所需的链接库文件
解决:在自己的工程中加入需要使用的DCMTK静态库和头文件,并注意顺序。
fatal error LNK1181: cannot open input file。。。。。。。 Debug.obj
原因:类似错误,可能是由于目录中含有太长的中文名字。
解决:可以将中文的目录名改为英文就OK
原因:
解决:在Project->Settings->Preprocessor definitions中去掉 _AFXDLL项。
四、一个实际的例子
五、其它一些相关的问题
编译DCMTK
也许是DCMTK的开发人员认为DCMTK是一个专用的库,没有必要做成动态链接库。也许是DCMTK的开发人员认为DCMTK需要跨平台,做成动态链接库就平台相关了,违背了跨平台的本意。
结论一:
结论二:
结论三:
结论四:
结论五:
DCMTK使用的是静态链接方式链接语言运行库。使用默认的DCMTK编译参数,生成的LIB文件。在使用的时候,需要注意以下问题。
结论六:
结论七:
转载自:http://blog.csdn.net/jackmacro/archive/2010/02/27/5332665.aspx
有关DCMTK的基础知识
来自:PACS专家网
作者:jayition由于我对worklist的了解只是初步的,所以在我说的有错误之处还要大家多多指点;worklist我把它译为工作列表,它的作用是方便检查医师,减少检查医师的输入;病人信息在登记过之后就会产生一个列表,是所有没有经过拍片的病人信息列表,并提供一个服务,供设备来调用、当病人拿着一个登记号之类的编码到相对应的拍片室之后,拍片医师会将一小部分信息输入(例如登记号)、
设备根据登记号向SCP提出请求(C-FIND),
SCP根据请求内容查找列表,将相应的信息返回给设备。
设备读取病人信息-》拍片-》。。。。。。(后面的事与工作列表服务关系就不太大了)
以上这些是它的大概流程!
由于我主要是用DCMTK进行研究,所以说明一下它现在所支持的一些信息:
在请求中,它支持以下字段(我用数据库来理解DICOM的,所以我习惯叫它们字段)
(0008,0050) AccessionNumber 工作流号
(0008,0090) ReferringPhysiciansName 提交人(医师)名字
(0010,0010) PatientsName 病人姓名
(0010,0020) PatientID 病人ID
(0010,0040) PatientsSex 病人性别
(0032,1032) RequestingPhysician 请求医师
(0038,0010) AdmissionID 允许进入ID
(0040,0100) ScheduledProcedureStepSe
(0008,0060) > Modality 设备样式(设备名:如CT,CR等)
(0040,0001) > ScheduledStationAETitle 预定工作站的应用实体名
(0040,0002) > ScheduledProcedureStepSt
(0040,0003) > ScheduledProcedureStepSt
(0040,0006) > ScheduledPerformingPhysi
(0040,1001) RequestedProcedureID 被请求的程序ID
(0040,1003) RequestedProcedurePriori
支持以下返回信息:
(0008,0005) SpecificCharacterSet
(0008,0050) AccessionNumber
(0008,0080) InstitutionName
(0008,0081) InstitutionAddress
(0008,0090) ReferringPhysiciansName
(0008,1080) AdmittingDiagnosesDescri
(0008,1110) ReferencedStudySequence
(0008,1150) > ReferencedSOPClassUID
(0008,1155) > ReferencedSOPInstanceUID
(0008,1120) ReferencedPatientSequenc
(0008,1150) > ReferencedSOPClassUID
(0008,1155) > ReferencedSOPInstanceUID
(0010,0010) PatientsName
(0010,0020) PatientID
(0010,0030) PatientsBirthDate
(0010,0040) PatientsSex
(0010,1000) OtherPatientIDs
(0010,1001) OtherPatientNames
(0010,1020) PatientsSize
(0010,1030) PatientsWeight
(0010,1040) PatientsAddress
(0010,1080) MilitaryRank
(0010,2000) MedicalAlerts
(0010,2110) ContrastAllergies
(0010,2160) EthnicGroup
(0010,21a0) SmokingStatus
(0010,21b0) AdditionalPatientHistory
(0010,21c0) PregnancyStatus
(0010,21d0) LastMenstrualDate
(0010,4000) PatientComments
(0020,000d) StudyInstanceUID
(0032,1032) RequestingPhysician
(0032,1033) RequestingService
(0032,1060) RequestedProcedureDescri
(0032,1064) RequestedProcedureCodeSe
(0008,0100) > CodeValue
(0008,0102) > CodingSchemeDesignator
(0008,0103) > CodingSchemeVersion
(0008,0104) > CodeMeaning
(0038,0010) AdmissionID
(0038,0011) IssuerOfAdmissionID
(0038,0050) SpecialNeeds
(0038,0300) CurrentPatientLocation
(0038,0500) PatientState
(0040,0100) ScheduledProcedureStepSe
(0008,0060) > Modality
(0032,1070) > RequestedContrastAgent
(0040,0001) > ScheduledStationAETitle
(0040,0002) > ScheduledProcedureStepSt
(0040,0003) > ScheduledProcedureStepSt
(0040,0004) > ScheduledProcedureStepEn
(0040,0005) > ScheduledProcedureStepEn
(0040,0006) > ScheduledPerformingPhysi
(0040,0007) > ScheduledProcedureStepDe
(0040,0008) > ScheduledProtocolCodeSeq
(0008,0100) > > CodeValue
(0008,0102) > > CodingSchemeDesignator
(0008,0103) > > CodingSchemeVersion
(0008,0104) > > CodeMeaning
(0040,0009) > ScheduledProcedureStepID
(0040,0010) > ScheduledStationName
(0040,0011) > ScheduledProcedureStepLo
(0040,0012) > PreMedication
(0040,0020) > ScheduledProcedureStepSt
(0040,0400) > CommentsOnTheScheduledPr
(0040,1001) RequestedProcedureID
(0040,1002) ReasonForTheRequestedPro
(0040,1003) RequestedProcedurePriori
(0040,1004) PatientTransportArrangem
(0040,1005) RequestedProcedureLocati
(0040,1008) ConfidentialityCode
(0040,1009) ReportingPriority
(0040,1010) NamesOfIntendedRecipient
(0040,1400) RequestedProcedureCommen
(0040,2001) ReasonForTheImagingServi
(0040,2004) IssueDateOfImagingServic
(0040,2005) IssueTimeOfImagingServic
(0040,2008) OrderEnteredBy
(0040,2009) OrderEnterersLocation
(0040,2010) OrderCallbackPhoneNumber
(0040,2016) PlacerOrderNumberImaging
(0040,2017) FillerOrderNumberImaging
(0040,2400) ImagingServiceRequestCom
(0040,3001) ConfidentialityConstrain
好的,下面为了更好地理解worklist服务,如果有一个环境来大概看一下!所以我用DCMTK中的例子程序来看这个过程,(由于我也没有看见过正真的环境,经过mouse及各位网友指点我就先把我理解的写出来了!如有错误望指点!)
在设备端可以理解为一个findscu程序(是DCMTK中的例程。)而响应这个程序的服务是wlmscpfs--相当于服务器端!findscu发送一个请求到服务器端wlmscpfs,wlmscpfs通过文件数据服务器(暂时这么叫,也可以叫文件数据库,因为它的每一条记录对应于一个文件!)查找,并返回结果!
接下来,为了更清晰这个结构,我将编译好的dump2dcm.exe,findscu.exe,wlmscpfs.exe,还有dcmtk目录下的\\dcmwlm\\wlistdb和dcmwlm\\wlistqry拷到一个自已定义的目录下,这里假设是d:\\dcmtk,再按这两个文件夹里面的readme的要求,将原来的dump文件转化为dcm格式,扩展名分别为wl和dcm,这个说明里已经讲清楚了!
然后我先跟大家作好约定吧!我存放文件的目录为:d:\\dcmtk目录下有:findscu.exe,wlmscpfs.exe文件;
d:\\dcmtk\\wlistdb和d:\\dcmtk\\wlistqry下面分别为wl和dcm文件。
打开两个命令行对话框:
1。一个里面输:wlmscpfs -v -dfp "d:\\dcmtk\\wlistdb" 123
注释:-v是显示详细情况的,-dfp是指定文件数据库(也就是wl文件)路径的!123是端口号!
2.另一个里面输:findscu -v --call OFFIS -k 0010,0010="ABC" -k 0010,0020="00001" -k 0010,0030 127.0.0.1 123
注释:相同的参数就不多说了,--call是用来指定AE Title的,而在这个程序里面AE Title指的是d:\\dcmtk\\wlistdb目录下的一个目录名,而您可以看一下,里面是一个OFFIS目录,如果目录改名,AE Title也要跟着改!-k是用于指定关键字的:比如 -k 0010,0010="ABC"表示要查找病人姓名(tag为0010,0010)为ABC的病人,而您一定会注意到-k 0010,0030后面没有参数,那表示这条记录需要返回!(这是我的理解!)而127.0.0.1是wlmscpfs所在机器的IP地址,而123是wlmscpfs开的端口也就是在wlmscpfs -v -dfp "d:\\dcmtk\\wlistdb" 123中的123!
这样,只要您在关键字中输入正确的关键字,就会返回正确结果!
如果想知道库里面有哪些信息,可以用文本编辑器打开d:\\dcmtk\\wlistdb文件夹中的dump文件,里面是相关wl文件的内容,当然,你也可以用dcm文件查看器看一下wl文件的内容,因为它就是dcm文件!
http://blog.sina.com.cn/s/blog_60efd3f50100e63s.html
DICOM文件格式与编程 (2009-07-06 10:23:47)
任何图像文件格式无非是由两个部分组成:存参数的 header 和图点数据(pixel data)。
BMP、 JPEG、TIFF 之类的格式的 header 只描述图像的基本参数:如几行、几列、每点用了几位、有没有压缩、调色板等等。Header 往往是固定长度的。
而医疗影像还要许多其它参数,如病人基本资料、检验基本资料、系列资料、位置资料等等。而且每种Modality 和每种 image 所需要的内容不一样。因此,一般的图像格式不能使用。
一、DICOM 的 4 个内容层次
1、 Patient (病人)
2、 Study (检验)
3、 Series (系列)
4、 Image (图像)
尽管头几层的内容在很多图像里是相同的,但它们在每个图像文件里都要有。
每一层叫一个Information Entity或IE(从relational database schema 设计引用而来)。每一层又细分成Module。每个Module里面的最小单元叫做一个attribute或element。
现在举个例子:CR 图像 (DICOM Part 3, A.2.3, Table A.2-1)
1. Patient IE:
a. Patient Module (参考 C.7.1.1)
2. Study IE:
a. Study Module (参考 C.7.2.1)
b. Patient Study Module (参考 C.7.2.2)
3. Series IE:
a. General Series (参考 C.7.3.1)
b. CR Series (参考C.8.1..1)
c. General Equipment (参考 C.7.5.1)
4. Image IE:
a. Genrral Image (C.7.6.1)
b. Image Pixel (C.7.6.3)
c. Contrast/bolus (C.7.6.4)
d. CR Image (C.8.1.2)
...
i. SOP Common (C.12.1)
将这些 modules (tables) 里的所有 elements 都找出来就做成了一个 CR 图像的架构。
要注意的是这些 module 有些是一定要的(modatory) 有些是用户选用的 (user)。到了每个 module 里attribute/element 表又有分五类 Type 1, 1C, 2, 2C 和 3。 Type 1 是一定要的,2 也是一定要的但是内容可以是空的。Type 3 则可要可不要。所以浓缩一下,一个 CR 图像里的元素(elements) 也不是太多。把这些表格展开后,这些 elements 组成一个 dataset。
那么,写到一个文件里或通过网路传送又是个什么格式呢?这就要看 Part 5。一个元素(element) 的结构是:
1. group tag: 16-bit
2. element tag: 16-bit
3. length (or VR/length): 32-bit
4. data (bytes of length)
DicomElem CRDataSet [] =
{
{ 0x0008, 0x0005, "CS", 10, "ISO_IR 100"},
{ 0x0008, 0x0008, "CS", 16, "ORIGINAL\\PRIMARY"},
...
{0x0010, 0x0010, "PN", 16, "My^Test^Image^^ "},
{0x0010, 0x0020, "SH", 6, "123456"},
...
{0,0,"",0,""}
};
void WriteCDImage(FILE *fp)
{
DicomElem elem = CRDataSet[0];
unsigned long int lComboTag;
int nCols, nRows;
unsigned char *pPixelData
unsigned long int lPixelLength;
pPixelData = LoadBMPImgeData("MyImage.bmp", nCols, nRows, lPixelLength);
while(CRDataSet[i].group_tag)
{
i++;
}
}
unsigned char *LoadBMPImgeData(char *fileName, int &nCols, int &nRows, unsigned long &lPixelLength)
{
....
}
细节自己去写。
二、DICOM文件读写最难的是两件事情
Sequence 在 C 里的类比是一个 structure 的 array,是结构套结构,所以读起来难。更麻烦的是 Sequence还可以不定义长度, 即长度是 -1。要靠你自己去找 (FFFE, E0DD) 来决定 Sequence 是否结束。
Array 里面的每个 structure就是 DICOM Sequence 里的一个 Item。Item 的开头是一个特定 element (FFFE, E000)。 如果 Item 的长度是 -1, 要靠找到 (FFFE, E00D) 来决定 Item 的结束。
Pixel Data (7fe0, 0010) 是一个特殊的 DICOM element。总是在所有元素的最后面。它与 Sequence 有两个相似的地方:长度区总是 32-位 (即 explicit VR 的情况下要在 VR 区后面填两个 bytes,然后再加 4-bytes 的长度。
三、DICOM file 细节问题
如果机器的 endian 和数据的 endian 不对的话要做 byte swap。要做 byte swap 的有所有的根数字有关的binary data, 即 VR = SS, US, SL, UL, FL, FD, OW, AT 等等。DICOM group tag 和 element tag 也要分别做两个 byte 的 swap。Item 指的是 DICOM Sequence 的 Item。
0x7fe0, 0x0010, "OB", ' '' ', 0xffffffff // tag, VR, 长度
0xFFFE, 0x0000, 0xffffffff // Offset item begins
0x00000000 // Offset of first image = 0
0x00001000 // Offset of second image = 4096 (for example)
...
0xFFFE, 0xE00D // End of offset item
0xFFFE, 0x0000, 0x00001000
... // (4096 bytes)
0xFFFE, 0xE00D // end of first image
...
0xFFFE, 0xE0DD // End o of pixel data sequence
对应每一个用到的 element DICOM 标准 Part 6 都定义了一个 group tag 和 element tag。比如说:
patient name: 0x0010, 0x0010
patient ID:
...
VR说的是element格式,比如说patinet name 的VR是PN。格式是last_name^first_name^middle_name^prefix^surfix。那么我的英文名字就是: Wang^JB^^Dr.^
往外写时要做几个事情:
1. 要把所有元素按 group tage 和 element tag 理一遍 (sort)。从小排到大。
2. 如果是写 DICOM 介质的 DICOM file 还先写 128 bytes preamble (一般是空白),加 "DICM", 加 group 2 Meta header。(讲到 Part 10 时再细说)
3. 如果 dataset 里面含有 Sequence elements, sequence 里面每一个 Item 又是一个 dataset。
有了这些知识,你就可以开始写一个小小的 BMP 到 DICOM 的转化程序。关键资料:
Modality (0008, 0060): SC
Photometric Interpretation (0028, 0004): RGB
SOP Class UID: 1.2.840.10008.1.5.4.1.1.7
最简单的办法是写一个 structure 然后一个 array。
typedef struct DicomElem
{
short int group_tag,
short int element_tag,
char VR[4],
int length,
char data[128]
} DicomElem;
注意事項︰
1. DCMTK 的設定中,預設是採用 "Multithreaded" runtime options (/MT and /MTd) 的設定,因此若新專案要使用上述方法編譯之函式庫,則新專案的 runtime options 設定必須一致。
2. 在 VC 中,fstream 的用法有2種,一為 一為內建於 std 中的 。DCMTK預設使用std 的函式庫,因此使用的新專案也必須要一致。是否使用 std 的 fstream 可透過C:\DCMTK\dcmtk-3.5.4\config\include\dcmtk\config\cfwin32.h 檔案中的 USE_STD_CXX_INCLUDES 定義來決定。
五dcmtk使用介绍
整个程序都是参考dcmtk里的例子dcmdump.exe做的
http://www.vchelp.net/ASP/cdf_pic/200410/reply_1_747225.rar
DCMTK的常见问题论坛:http://forum.dcmtk.org/